建立APOL1肾病小鼠模型
验证APOL1风险变异在体内诱导肾病表型
对APOL1 G0/G0、G1/G1、G2/G2转基因小鼠尾静脉注射IFN-γ腺病毒,检测尿蛋白和肾小球硬化
Purine Metabolism Regulates the Severity of APOL1 Nephropathy
含体外HEK细胞和足细胞、体内BAC转基因小鼠模型,代谢组学及AICAr功能与机制验证
APOL1 BAC转基因小鼠(G0/G0、G1/G1、G2/G2) HEK四环素诱导APOL1 G0/G1/G2表达细胞系 永生化小鼠足细胞(FVB、G0、G2)
APOL1肾病诱导:尾静脉注射8×10^7 pfu IFN-γ腺病毒 AICAr补充:500 mg/kg溶于200 μl生理盐水,每日经眶后注射,持续21天 细胞APOL1诱导:50 ng/ml tet处理18小时 ATIC敲低:100 nM siRNA转染48小时 终点检测:尿白蛋白与肌酐比值、细胞毒性/ATP检测、pAMPK蛋白水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证APOL1风险变异在体内诱导肾病表型
对APOL1 G0/G0、G1/G1、G2/G2转基因小鼠尾静脉注射IFN-γ腺病毒,检测尿蛋白和肾小球硬化
鉴定APOL1风险变异相关的代谢通路改变
分离注射IFN-γ后48小时的肾小球,进行非靶向代谢组学和通路富集分析
在体外验证嘌呤代谢扰动及关键酶表达变化
对四环素诱导表达APOL1 G0/G1/G2的HEK细胞进行代谢组学,检测ATP/ADP、肌苷/黄嘌呤比值及嘌呤合成酶表达
验证补充嘌呤前体能否减轻风险变异细胞毒性并确认ATIC依赖性
在G0/G1/G2细胞中给予AICAr,检测细胞毒性、pAMPK和嘌呤代谢酶表达;用ATIC siRNA敲低验证机制
验证AICAr在APOL1 G2小鼠中减轻肾病
IFN-γ腺病毒注射后每日给予AICAr 21天,检测尿白蛋白与肌酐比值、肾小球硬化和pAMPK
在足细胞中验证炎症刺激诱导的死亡及AICAr的ATIC依赖性保护作用
用IFN-γ和Pam3CSK4处理FVB、G0、G2足细胞,给予AICAr并检测细胞活力;用Atic siRNA验证机制
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肾小球分离 | Hank平衡盐溶液 | Cytiva | SH30268.02 |
| Dynabeads磁珠 | Invitrogen | 14013 | |
| 代谢组学 | 13C/15N标记氨基酸 | Cambridge Isotope Laboratories | MSK-A2-1.2 |
| Q Exactive HF-X混合四极杆-轨道阱质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Vanquish二元超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞培养 | 杀稻瘟菌素S盐酸盐 | Gibco | A11139-03 |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| RPMI-1640培养基 | American Type Culture Collection | 30-2001 | |
| 细胞毒性测定 | MultiTox-Fluor多重细胞毒性测定试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞活力测定 | 重组小鼠IFN-γ | R&D | 485-MI-100 |
| Pam3CSK4 | InvivoGen | tlrl-pms | |
| 发光ATP测定试剂盒 | Promega | G9241 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778150 |
| ADP/ATP比值测定 | ADP/ATP比值测定试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK135 |
| 肌苷测定 | 肌苷测定试剂盒 | Cell Biolabs | MET-5092 |
| 黄嘌呤测定 | 黄嘌呤/次黄嘌呤测定试剂盒 | Abcam | ab155900 |
| RNA提取 | RNeasy迷你试剂盒 | QIAGEN | 74106 |
| cDNA合成 | High Capacity RNA-to-cDNA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4387406 |
| qPCR | QuantStudio 6 Flex实时PCR系统 | Applied Biosystems by Life Technologies | -- |
| Western blot | 抗pAMPK抗体 | Cell signaling technology | 2535s |
| 抗AMPK抗体 | Cell signaling technology | 2532s | |
| 抗兔辣根过氧化物酶标记抗体 | Cell signaling technology | 7074s | |
| SuperSignal West Dura延长持续时间底物 | Thermo Fisher Scientific | 34076 | |
| 组织学 | Schiff试剂 | Abcam | ab150680 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型建立 | 小鼠基因型(G0/G0、G1/G1、G2/G2)、性别(雄性)、年龄(2月龄)、IFN-γ腺病毒剂量(8×10^7 pfu)及注射途径(尾静脉) 阅读提示:Methods 'Animal Models'小节及Figure 1图注 |
| AICAr体内干预 | AICAr剂量(500 mg/kg)、溶剂(200 μl生理盐水)、给药途径(眶后注射)、给药起始时间(IFN-γ注射后1天)和持续时间(21天) 阅读提示:Methods 'Animal Models'小节及Figure 6图注 |
| 细胞APOL1诱导及AICAr处理 | tet浓度(50 ng/ml)、处理时间(18小时)、AICAr剂量(文中未明确说明具体剂量) 阅读提示:Methods 'Cytotoxicity Assay'小节及Figure 5图注 |
| ATIC敲低实验 | siRNA浓度(100 nM)、转染时间(48小时)、转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX) 阅读提示:Methods 'Cytotoxicity Assay'小节 |
| 代谢组学样本制备 | 肾小球分离时间(IFN-γ注射后48小时)、每组小鼠数(N=3)、内标(13C/15N标记氨基酸) 阅读提示:Methods 'Glomerular Isolation'和'Metabolomics'小节及Figure 2图注 |