检测SALS患者脊髓中肌动蛋白动力学
验证散发性ALS中G-actin/F-actin比例是否失调。
对SALS患者和对照的腰段脊髓组织进行G-actin/F-actin分离实验,Western blot检测β-actin。
Cofilin hyperphosphorylation triggers TDP-43 pathology in sporadic amyotrophic lateral sclerosis
包含人SALS脊髓组织、TDP-43 rNLS8小鼠模型和NSC-34细胞,并有药理学和肽干预功能验证。
散发性ALS患者脊髓组织 TDP-43 rNLS8转基因小鼠 NSC-34运动神经元细胞 Neuro-2A和SH-SY5Y细胞
SALS患者和对照的年龄匹配及样本量(队列1 n=4/组,队列2 n=5/组) rNLS8小鼠Dox撤除时间点(1、2、4、6周及恢复期) Jasplakinolide处理浓度和时间(1 µM,1小时)及对照DMSO和latrunculin A Cofilin S3A肽处理浓度和时间(50 µg/ml,48小时) Western blot中磷酸化cofilin归一化至总cofilin
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证散发性ALS中G-actin/F-actin比例是否失调。
对SALS患者和对照的腰段脊髓组织进行G-actin/F-actin分离实验,Western blot检测β-actin。
验证SALS中cofilin Ser3磷酸化是否增加。
对SALS患者和对照的腰段脊髓裂解物进行Western blot,使用磷酸化Ser3特异性抗体检测p-cofilin,并归一化至总cofilin。
验证p-cofilin在运动神经元中是否增加。
对SALS患者和对照的胸段脊髓切片进行免疫组化,使用SMI-32标记运动神经元,共聚焦显微镜定量p-cofilin荧光强度。
探究cofilin过度磷酸化的上游机制。
对SALS患者和对照脊髓裂解物进行Western blot,检测p-LIMK1 (Thr508)、总LIMK1、Tpm-4.1和Tpm-4.2。
验证cofilin磷酸化是否与TDP-43病理出现相关。
在Dox撤除后1、2、4、6周及恢复期,对rNLS8小鼠和对照皮层裂解物进行Western blot检测p-cofilin和总cofilin。
验证p-cofilin在运动神经元中是否增加。
对Dox撤除6周的rNLS8小鼠和对照腰段脊髓切片进行免疫组化,使用p-cofilin、人TDP-43和NeuN抗体。
验证细胞质TDP-43是否足以引起cofilin磷酸化和F-actin增加。
在NSC-34细胞中转染TDP-43WT、TDP-43ΔNLS或对照,72小时后Western blot检测p-cofilin、总cofilin和G/F-actin。
验证F-actin稳定是否诱导TDP-43病理特征。
用jasplakinolide(1 µM,1小时)处理NSC-34或SH-SY5Y细胞,检测TDP-43错误定位、包涵体、片段化和磷酸化。
验证F-actin稳定是否促进应激颗粒形成及TDP-43招募。
用jasplakinolide处理表达GFP、TDP-43WT、TDP-43M337V或TDP-43ΔNLS的NSC-34细胞,免疫染色TIAR-1或HuR,共聚焦显微镜定量。
验证不可磷酸化cofilin肽是否能减轻TDP-43病理。
用TAT+S3A、TAT+S3或TAT-CTRL肽处理表达TDP-43M337V或TDP-43ΔNLS的Neuro-2A细胞,检测错误定位、包涵体和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白定量 | Pierce™ BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| G-actin/F-actin分离 | G-肌动蛋白/F-肌动蛋白体内实验生化试剂盒 | Cytoskeleton | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 肌动蛋白聚合诱导 | Jasplakinolide | Sigma | -- |
| 肌动蛋白解聚诱导 | Latrunculin A | Sigma | -- |
| Western blot | Clarity™ ECL Western Blotting Substrate试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| SDS-PAGE | 4%–20% SDS-PAGE凝胶 | Bio-Rad | -- |
| Western blot成像 | ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM 880倒置共聚焦激光扫描显微镜 | Zeiss | -- |
| Stellaris 5共聚焦激光显微镜 | Leica Biosystems | -- | |
| 免疫荧光封片 | 抗荧光淬灭封片剂 | Dako | -- |
| 细胞核染色 | Hoechst 33258 | -- | -- |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基(DMEM) | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人脊髓组织G-actin/F-actin分离 | SALS和对照的年龄匹配、样本量(n=6/组)、性别比例 阅读提示:Results 'G- and F-actin are dysregulated in SALS'及Supplementary Table 3 |
| 人脊髓组织cofilin磷酸化Western blot | 队列1和2的样本量(n=4和n=5/组)、年龄匹配、抗体特异性(Ser3) 阅读提示:Results 'Cofilin phosphorylation is increased in spinal MNs of SALS patients'及Supplementary Table 2 |
| rNLS8小鼠Dox撤除时间点 | Dox撤除后1、2、4、6周及恢复期的时间安排、小鼠年龄(8–10周) 阅读提示:Materials and methods 'Animals'及Results 'Cofilin phosphorylation correlates with disease progression...' |
| Jasplakinolide处理 | 浓度(1 µM)、处理时间(1小时)、溶剂(DMSO)及对照(latrunculin A) 阅读提示:Materials and methods 'Soluble and insoluble fraction preparation'及Results 'Actin polymerization induces TDP-43 pathology' |
| Cofilin S3A肽处理 | 肽浓度(50 µg/ml)、处理时间(48小时)、转染后开始时间 阅读提示:Materials and methods 'Cofilin peptide treatment'及Results 'Cofilin S3A peptide reduces pathological features of TDP-43' |