低温对蛋白酶体活性的影响
确定低温是否选择性地影响蛋白酶体活性
将C. elegans成虫或HEK293细胞置于低温(15 °C或36 °C)处理,检测三种蛋白酶体活性。
Cold temperature extends longevity and prevents disease-related protein aggregation through PA28γ-induced proteasomes
包含C. elegans遗传模型、人类细胞系和iPSC衍生运动神经元等多种独立模型,涵盖功能验证(寿命、运动、凋亡)和机制验证(蛋白酶体活性、基因敲低/过表达、TRPA1/NHR-49通路)。
秀丽隐杆线虫(野生型N2、fer-15;fem-1不育株) HEK293人胚胎肾细胞 肌萎缩侧索硬化患者iPSC衍生运动神经元(FUSP525L突变)
低温处理温度(15 °C vs 20 °C vs 25 °C;人类36 °C vs 37 °C) psme-3/PSME3基因敲低或过表达 TRPA1基因敲低或HC-030031抑制 C. elegans寿命测定(n=96/组,20 °C发育后转移至15/20/25 °C) 胰蛋白酶样蛋白酶体活性测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定低温是否选择性地影响蛋白酶体活性
将C. elegans成虫或HEK293细胞置于低温(15 °C或36 °C)处理,检测三种蛋白酶体活性。
验证PSME-3是否介导低温诱导的胰蛋白酶样活性
通过RNAi敲低psme-3或过表达psme-3,检测蛋白酶体活性。
探究TRPA1和NHR-49是否调控低温下的PSME-3表达
使用trpa-1突变体或nhr-49 RNAi,检测PSME-3蛋白和mRNA水平。
确定PSME-3是否介导低温诱导的长寿
在psme-3 RNAi或过表达下进行寿命测定。
低温是否减少疾病相关蛋白聚集,且是否依赖PSME-3
使用表达polyQ67、FUSP525L或TDP-43M331V的C. elegans模型或HEK293细胞,检测蛋白聚集和总蛋白水平。
低温是否通过PSME3减少ALS运动神经元凋亡
将ALS-iPSC衍生的运动神经元置于36 °C,检测凋亡和PSME3依赖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质印迹 | 抗PSME3抗体 | Abcam | ab97576 |
| 抗20S蛋白酶体C2抗体 | Abcam | ab3325 | |
| 抗PSMD11抗体 | Abcam | ab99413 | |
| 抗TRPA1抗体 | Proteintech | 19124-1-AP | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T6199 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗FUS抗体 | Abcam | ab154141 | |
| 抗TDP43抗体 | Abcam | ab225710 | |
| 抗亨廷顿蛋白抗体 | Cell Signaling | 5656 | |
| 抗GFP抗体 | AMSBIO | TP401 | |
| 抗IFB-2抗体 | Developmental Studies Hybridoma Bank | MH33 | |
| 免疫细胞化学 | 抗剪切型Caspase-3兔单抗 | Cell Signaling | 9661S |
| 抗MAP2小鼠单抗 | Sigma-Aldrich | M1406 | |
| 抗PSME3兔多抗 | Proteintech | 14907-1-AP | |
| 抗FUS小鼠单抗 | Abcam | ab154141 | |
| 抗HA标签小鼠单抗 | ThermoFisher | 26183 | |
| Alexa Fluor 488标记山羊抗小鼠IgG二抗 | ThermoFisher | A-11029 | |
| Alexa Fluor 568标记山羊抗兔IgG二抗F(ab')2片段 | ThermoFisher | A-21069 | |
| Hoechst 33342染料 | ThermoFisher | H3570 | |
| ProLong Diamond防淬灭封片剂 | ThermoFisher | P36961 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | ThermoFisher | 11966025 |
| 胎牛血清 | ThermoFisher | 10500064 | |
| MEM非必需氨基酸 | ThermoFisher | 11140035 | |
| iPSC培养 | Geltrex基质胶 | ThermoFisher | A1413302 |
| mTeSR1培养基 | Stem Cell Technologies | 85850 | |
| 分散酶 | Stem Cell Technologies | 07913 | |
| 运动神经元分化 | DMEM/F12培养基 | ThermoFisher | 11330057 |
| Neurobasal培养基 | ThermoFisher | 21103049 | |
| Glutamax补充剂 | ThermoFisher | 35050038 | |
| B27补充剂 | ThermoFisher | 12587010 | |
| N2补充剂 | ThermoFisher | 17502048 | |
| 视黄酸 | Sigma-Aldrich | R2625 | |
| Smoothened激动剂 | Sigma-Aldrich | 566661 | |
| LDN-193189 | Miltenyi Biotech | 130-103-925 | |
| SB-431542 | Miltenyi Biotech | 130-105-336 | |
| SU-5402 | Sigma-Aldrich | SML0443 | |
| DAPT | Sigma-Aldrich | D5942 | |
| 多聚L-鸟氨酸 | Sigma-Aldrich | P3655 | |
| 层粘连蛋白 | ThermoFisher | 23017015 | |
| 脑源性神经营养因子 | Biozol | 450-02 | |
| 胶质细胞源性神经营养因子 | Biozol | 450-10 | |
| 基因敲低 | Mission shRNA载体 | Sigma-Aldrich | -- |
| 嘌呤霉素 | ThermoFisher | A1113803 | |
| ROCK抑制剂 | Abcam | ab120129 | |
| Accutase消化液 | ThermoFisher | A1110501 | |
| 质粒转染 | Fugene HD转染试剂 | Promega | E2311 |
| 蛋白酶体活性测定 | 胰蛋白酶样活性底物 | Enzo | BWL-AW9785-0005 |
| 胰凝乳蛋白酶样活性底物 | Enzo | BML-ZW8505-0005 | |
| caspase样活性底物 | Enzo | BWL-ZW9345-0005 | |
| EnSpire多功能酶标仪 | Perkin Elmer | -- | |
| 蛋白质印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | 11836153001 |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoScientific | 23225 | |
| 基因敲低 | Gentra Puregene组织DNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| qPCR | RNAbee RNA提取试剂 | Tel-Test Inc. | CS501-B |
| qScript Flex cDNA合成试剂盒 | Quantabio | -- | |
| CFC384实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞处理 | HC-030031(TRPA1拮抗剂) | -- | -- |
| 来普霉素B(核输出抑制剂) | Sigma-Aldrich | -- | |
| 线虫培养 | OP50大肠杆菌 | -- | -- |
| 线虫RNAi | HT115大肠杆菌 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 线虫培养与温度处理 | 线虫株系(如N2、fer-15;fem-1)、培养温度(20°C)、成虫后转移温度(15、20、25°C) 阅读提示:Methods: C. elegans strains; Lifespan studies |
| 蛋白酶体活性测定 | 底物种类(Ac-RLR-AMC等)、蛋白量(25 μg)、裂解缓冲液成分、荧光读取条件(380/460 nm) 阅读提示:Methods: Proteasome activity |
| 基因敲低 | RNAi起始时间(成虫第1天)、psme-3 RNAi质粒构建、组织特异性RNAi菌株(如DCL569等) 阅读提示:Methods: RNAi constructs for C. elegans; C. elegans strains |
| 寿命测定 | 每条件蠕虫数(96)、评分频率(每天或隔天)、审查标准(丢失、袋状等) 阅读提示:Methods: Lifespan studies |
| 人类细胞培养与低温处理 | HEK293T/17细胞系、培养基(DMEM+10%FBS)、低温处理(36°C 24小时) 阅读提示:Methods: Human cell lines |
| iPSC衍生运动神经元分化 | iPSC系(FUSP525L/P525L)、分化方案(24天)、细胞因子浓度 阅读提示:Methods: Motor neuron differentiation |