评估Siglec-9在人类肥大细胞中的表达
确定人类肥大细胞(包括细胞系和原代细胞)是否表达Siglec-9及其表达水平。
通过流式细胞术和qPCR检测多种人肥大细胞系(HMC-1.2、LUVA、LAD2)和原代细胞(PBCMCs、HSCMCs、肺肥大细胞)中Siglec-9的表面和mRNA表达,并通过共聚焦显微镜观察其亚细胞定位。
Siglec-9 is an inhibitory receptor on human mast cells in vitro
包含细胞系模型、原代细胞模型和基因编辑功能验证,并通过配体处理、抗体共结合及信号通路检测进行机制验证。
LAD2细胞系 HMC-1.2细胞系 LUVA细胞系 外周血CD34+衍生培养肥大细胞(PBCMCs) 人皮肤衍生培养肥大细胞(HSCMCs)
Siglec-9在多种人肥大细胞系和原代细胞中的表达水平 SIGLEC9基因编辑效率及对激活标志物和脱颗粒的影响 Siglec-9配体GlycA和HMW-HA的浓度及处理时间 Siglec-9与FcεRI共结合时的抗体浓度和交联方法 使用sialidase处理去除唾液酸后对肥大细胞活化的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定人类肥大细胞(包括细胞系和原代细胞)是否表达Siglec-9及其表达水平。
通过流式细胞术和qPCR检测多种人肥大细胞系(HMC-1.2、LUVA、LAD2)和原代细胞(PBCMCs、HSCMCs、肺肥大细胞)中Siglec-9的表面和mRNA表达,并通过共聚焦显微镜观察其亚细胞定位。
探究Siglec-9在抗体结合后是否发生内吞和降解。
使用抗Siglec-9单克隆抗体结合后,通过延迟二次染色法评估表面和总Siglec-9表达随时间的变化,并通过共聚焦显微镜检查其与早期内体标志物Rab5和晚期内体标志物Rab7的共定位。
确定Siglec-9缺失对肥大细胞活化敏感性的影响。
使用CRISPR/Cas9技术敲除LAD2细胞中的SIGLEC9基因,随后通过流式细胞术检测激活标志物LAMP-1的表达,并通过β-己糖胺酶释放试验评估IgE依赖性和IgE非依赖性刺激下的脱颗粒反应。
确定天然配体GlycA和HMW-HA是否通过Siglec-9抑制肥大细胞活化。
用不同浓度的GlycA或HMW-HA处理LAD2细胞和HSCMCs,然后进行IgE依赖性或IgE非依赖性刺激,测量脱颗粒指标(β-己糖胺酶释放或LAMP-1表达),并比较Siglec-9敲除细胞与野生型细胞的反应。
探究Siglec-9与FcεRI共交联是否能增强抑制效果。
用抗FcεRIα和抗Siglec-9抗体孵育PBCMCs和HSCMCs,然后用二抗交联,测量LAMP-1表达、花生四烯酸代谢物(cys-LT、PGD2)和趋化因子(IL-8、MCP-1)的释放。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| IMDM培养基 | -- | -- | |
| StemPro-34无血清培养基 | Thermo Fisher Scientific | 10639011 | |
| StemSpan SFEM II培养基 | StemCell Technologies | -- | |
| X-Vivo 15培养基 | iLonza | 04-418Q | |
| 热灭活胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 重组小鼠IL-3 | Peprotech | -- | |
| 重组小鼠SCF | Peprotech | -- | |
| 重组人IL-6 | Peprotech | -- | |
| 重组人SCF | Peprotech | -- | |
| 重组人IL-3 | Peprotech | -- | |
| 环丙沙星 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 透明质酸酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| II型胶原酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| I型DNA酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氯化钙 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Percoll | -- | -- | |
| 基因编辑 | Lipofectamine CRISPRMAX试剂 | Thermo Fisher Scientific | CMAX00001 |
| Cas9蛋白 | Integrated DNA Technologies | 1081058 | |
| sgRNA | Thermo Fisher Scientific | A35533 | |
| qPCR | RNeasy Plus Micro试剂盒 | Qiagen | 74034 |
| RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 | |
| SuperScript VILO cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| Maxima SYBR Green/ROX qPCR预混液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Step One Plus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | 抗人Siglec-6抗体 | R&D Systems | FAB2859N-025 |
| 抗人Siglec-7抗体 | R&D Systems | FAB11381P | |
| 抗人Siglec-8抗体 | BD Biosciences | 747875 | |
| 抗人Siglec-9抗体(BV421) | BD Biosciences | 743363 | |
| 抗人Siglec-9抗体(APC) | R&D Systems | FAB1139A | |
| 抗人c-Kit抗体 | BD Biosciences | 562687 | |
| 抗人FcεRIα抗体(FITC) | Invitrogen | 11-5899-42 | |
| 抗人LAMP-1抗体 | Biolegend | 328629 | |
| 抗人CD45抗体 | Invitrogen | 11-9459-41 | |
| 抗人CD11b抗体 | Biolegend | 301341 | |
| 抗人CD66b抗体 | Biolegend | 392915 | |
| 抗小鼠c-Kit抗体 | Biolegend | 105825 | |
| 抗小鼠FcεRIα抗体 | Biolegend | 134307 | |
| 抗小鼠Siglec-E抗体 | BD Biosciences | 748154 | |
| DAPI | Sigma Aldrich | D9542 | |
| 抗人GlycA抗体 | Biolegend | 306607 | |
| 唾液酸酶 | Roche | 11080725001 | |
| 小鼠抗人Siglec-9(未结合) | R&D Systems | MAB1139100 | |
| 小鼠IgG2a同型对照 | R&D Systems | MAB003 | |
| 重组人Siglec-9 Fc嵌合蛋白 | R&D Systems | 1139-SL-050 | |
| Alexa Fluor 488偶联抗人IgG二抗 | Jackson ImmunoResearch | 709-546-149 | |
| 碘化丙啶 | Biolegend | 421301 | |
| FITC偶联Annexin V | Biolegend | 640905 | |
| Annexin V结合缓冲液 | Biolegend | 422201 | |
| 显微镜 | 腔室载玻片 | Thermo Fisher Scientific | 154526 |
| 人血浆纤连蛋白 | Sigma Aldrich | F2006 | |
| Prolong Diamond DAPI封片剂 | Invitrogen | P36966 | |
| SlowFade DAPI封片剂 | Invitrogen | S36968 | |
| 抗Rab5a抗体 | Cell Signaling Technology | 2143S | |
| 抗Rab7抗体 | Cell Signaling Technology | 9367S | |
| Alexa Fluor 594偶联驴抗兔IgG | Abcam | ab150076 | |
| Alexa Fluor 488偶联驴抗小鼠IgG | Invitrogen | A21202 | |
| 细胞活化 | 人IgE | Abcam | ab65866 |
| 抗人IgE抗体 | Abcam | ab99804 | |
| 化合物48/80 | Sigma Aldrich | C2313 | |
| A23187 | Sigma Aldrich | C7522 | |
| 血型糖蛋白A(GlycA) | Sigma Aldrich | G5017 | |
| 高分子量透明质酸(HMW-HA) | Sigma Aldrich | 53747 | |
| ELISA | PGD2 ELISA试剂盒 | Cayman Chemical | 512031 |
| Cys-LT ELISA试剂盒 | Cayman Chemical | 500390 | |
| 趋化因子检测 | ProcartaPlex多重免疫分析 | Thermo Fisher Scientific | PPX-07-MXH6CA4 |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(如LAD2)和原代细胞(如HSCMCs)的培养条件,包括培养基类型、细胞因子浓度(如SCF、IL-3、IL-6)、培养时间(≥5周) 阅读提示:Methods: Human mast cell lines, Human primary mast cells |
| 基因编辑 | CRISPR/Cas9转染条件:LAD2细胞密度(3x10^5细胞/孔)、Cas9和sgRNA浓度(各12 pmol)、转染试剂(Lipofectamine CRISPRMAX)用量 阅读提示:Methods: Gene Editing |
| Siglec-9配体处理 | GlycA和HMW-HA的使用浓度(20-100 μg/ml)及预处理时间(20分钟),以及刺激物类型和浓度 阅读提示:Methods: Siglec-9 engagement with native ligands |
| 流式细胞术 | 抗体克隆及浓度,如抗Siglec-9抗体克隆191240,浓度5 μg/ml;FcεRIα抗体浓度100 ng/ml 阅读提示:Methods: Flow cytometry |
| 细胞活化检测 | β-己糖胺酶释放实验的条件:细胞浓度(1x10^5细胞/孔)、刺激时间(1小时);LAMP-1检测的刺激时间(30分钟) 阅读提示:Methods: β-hexosaminidase release assay, Flow cytometry |