评估CAD患者的抗病毒T细胞反应
确定CAD患者对SARS-CoV2和EBV抗原的T细胞反应是否存在缺陷
分离健康对照和CAD患者的PBMC,用SARS-CoV2刺突蛋白和核衣壳蛋白或EBV gp350刺激5天,检测IFN-γ分泌和CD69+CD40L+ T细胞频率。
Hyperactivity of the CD155 immune checkpoint suppresses anti-viral immunity in patients with coronary artery disease
包含临床样本分析、体外细胞实验、功能验证、机制研究(m6A位点鉴定、荧光素酶报告实验)及体内NSG小鼠模型验证。
健康人与CAD患者外周血单核细胞来源的巨噬细胞 CD14+单核细胞 免疫缺陷NSG小鼠人源化模型 人动脉粥样硬化斑块组织
病毒抗原刺激浓度(1μg/ml)及刺激时间(5天) 巨噬细胞分化条件(M-CSF 20ng/ml,5天;LPS 100ng/ml和IFN-γ 100U/ml,24小时) CD155和METTL3 siRNA敲低(10 nM) m6A抑制剂3-DAA处理 体内模型中细胞转移数量(1×10^7 PBMC,1×10^6 Mϕ)和免疫方案(10μg SARS-CoV-2蛋白)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定CAD患者对SARS-CoV2和EBV抗原的T细胞反应是否存在缺陷
分离健康对照和CAD患者的PBMC,用SARS-CoV2刺突蛋白和核衣壳蛋白或EBV gp350刺激5天,检测IFN-γ分泌和CD69+CD40L+ T细胞频率。
探究CAD患者的巨噬细胞是否具有抗原呈递缺陷
将健康或CAD单核细胞分化为巨噬细胞,负载病毒抗原后与自体T细胞共培养,检测再刺激后的IFN-γ和CD69+CD40L+ T细胞频率。
在体内环境中确认CAD患者T细胞和巨噬细胞对病毒抗原的反应缺陷
将健康或CAD患者的PBMC和自体巨噬细胞转移到NSG小鼠,免疫SARS-CoV-2蛋白,一周后检测脾脏中人CD4+CD38+ T细胞频率。
确定导致CAD巨噬细胞抑制T细胞反应的共刺激/共抑制分子
分析健康与CAD巨噬细胞的共刺激/共抑制分子转录谱,发现CD155显著上调,并通过流式和免疫荧光验证蛋白表达。
证实CD155在CAD巨噬细胞中抑制抗病毒T细胞反应中的作用
使用抗CD155阻断抗体或CD155 siRNA敲低,评估对T细胞IFN-γ和CD69+CD40L+细胞频率的影响;并在体内模型中验证CD155敲低的效果。
鉴定与CD155相互作用的T细胞受体及其表达模式
通过流式分析CD4+记忆T细胞在抗CD3/CD28刺激后的TIGIT、CD96、PD-1和CD226表达,并检查病毒抗原反应性T细胞上TIGIT和CD96的表达。
确定METTL3调控CD155 mRNA稳定性的机制
通过放线菌素D实验测定CD155 mRNA半衰期;RT-PCR和Western检测METTL3表达;siRNA敲低METTL3后检测CD155 mRNA和蛋白水平。
确认CD155 mRNA上的特异性m6A位点及其对mRNA稳定性和表达的功能影响
通过m6A-RT-PCR定位m6A位点;构建3'UTR突变载体进行双荧光素酶报告实验;Me-RIP验证m6A富集。
证实METTL3在CAD巨噬细胞介导的T细胞抑制中的作用
在CAD Mϕ中敲低METTL3或抑制m6A,评估对病毒抗原诱导的T细胞IFN-γ和CD69+CD40L+细胞频率的影响;体内实验验证METTL3敲低的作用。
确定CAD患者单核细胞中METTL3和CD155高表达的环境因素
分析健康单核细胞在含不同脂质血浆或oxLDL、LDL、LPS等刺激下METTL3和CD155 mRNA表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | Lymphoprep分离液 | STEMCELL Technologies | -- |
| T细胞分离 | EasySep人记忆CD4+ T细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19157 |
| 单核细胞分离 | EasySep人单核细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19359 |
| T细胞分离 | EasySep人初始CD4+ T细胞分离试剂盒II | STEMCELL Technologies | 17555 |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | Biolegend | -- |
| 胎牛血清 | Lonza | -- | |
| 细胞分化刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 干扰素-γ | Sino Biologicals | -- | |
| 细胞培养 | Accutase细胞分离溶液 | Innovative Cell Technologies | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| siRNA(CD155或METTL3) | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| ELISA | IFN-γ高灵敏度人ELISA试剂盒 | abcam | -- |
| 流式细胞术 | Brilliant Violet 785标记抗人CD154抗体 | Biolegend | 310842 |
| Brilliant Violet 510标记抗人CD69抗体 | Biolegend | 310936 | |
| Brilliant Violet 421标记抗人CD3抗体 | Biolegend | 344834 | |
| PE/Cyanine7标记抗人CD4抗体 | Biolegend | 343574 | |
| Brilliant Violet 650标记抗人CD8抗体 | Biolegend | 344730 | |
| APC/Cyanine7标记抗人CD45RA抗体 | Biolegend | 304128 | |
| FITC标记抗人CD45RO抗体 | Biolegend | 304242 | |
| PerCP/Cyanine5.5标记抗人CD38抗体 | Biolegend | 356614 | |
| Brilliant Violet 711标记抗人CD163抗体 | Biolegend | 333630 | |
| PE/Cyanine7标记抗人CD45抗体 | Biolegend | 368532 | |
| Brilliant Violet 711标记抗人CD4抗体 | Biolegend | 317439 | |
| Pacific Blue标记抗人HLA-DR抗体 | Biolegend | 307624 | |
| APC标记抗人CD206抗体 | Biolegend | 321110 | |
| PE标记抗人CD155抗体 | Biolegend | 337610 | |
| 免疫荧光 | CD155单克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-13493 |
| CD68单克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-13324 | |
| 免疫荧光/蛋白质印迹 | METTL3(E3F2A)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 86132S |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG(H+L)Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-11008 |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L)Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | A-31635 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解缓冲液 | Abcam | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SDS-PAGE凝胶 | Bio-Rad | 4561083 | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 | |
| 抗兔IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| SuperSignal West Femto高灵敏度底物 | Thermo Fisher Scientific | 34094 | |
| RNA提取 | Direct-zol RNA MiniPrep试剂盒 | Genesee Scientific | -- |
| cDNA合成 | High-Capacity cDNA反转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green qPCR预混液 | Bimake | -- |
| RealPlex2梯度PCR仪 | Eppendorf | -- | |
| m6A富集 | EpiQuik CUT&RUN m6A RNA富集试剂盒 | EpiGentek | P-9018 |
| 荧光素酶报告 | pMIR-REPORT载体 | Thermo Fisher | -- |
| 双荧光素酶报告分析系统 | Promega | -- | |
| 细胞活力检测 | LIVE/DEAD细胞成像试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞毒性检测 | Pierce LDH细胞毒性分析 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞活力检测 | AlamarBlue细胞活力试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 单核细胞刺激 | 氧化低密度脂蛋白 | -- | -- |
| 低密度脂蛋白 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者特征 | CAD患者纳入标准:需有冠状动脉旁路移植术、冠状动脉支架置入术或心肌梗死病史,且事件后至少90天;健康对照需排除心血管疾病。 阅读提示:Methods部分的Patients小节 |
| 细胞分离 | PBMC分离方法(密度梯度离心)、单核细胞分离试剂盒(EasySep #19359)、T细胞分离试剂盒(EasySep #19157和#17555)。 阅读提示:Methods部分的Cell culture小节 |
| 巨噬细胞分化 | 单核细胞用M-CSF(20ng/ml)培养5天,然后LPS(100ng/ml)和IFN-γ(100U/ml)刺激24小时。 阅读提示:Methods部分的Cell culture小节 |
| 抗原呈递实验 | PBMC与病毒抗原(1μg/ml)共培养5天;再刺激时用抗原负载的巨噬细胞(2×10^5)与T细胞共培养6小时。 阅读提示:Methods部分的In vitro Antigen Presentation Assay小节 |
| CD155和METTL3敲低 | 使用Lipofectamine 3000转染10 nM siRNA(CD155或METTL3)于巨噬细胞。 阅读提示:Methods部分的Cell culture小节 |
| RNA稳定性实验 | 放线菌素D处理浓度(3μg/ml或10μg/ml),时间点0,2,4,8小时。 阅读提示:Methods部分的RNA decay assays小节 |
| m6A位点检测和Me-RIP | m6A-RT-PCR使用BstI和MRT酶;Me-RIP使用EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit(P-9018)。 阅读提示:Methods部分的m6A RNA enrichment和RT-PCR based quantification of m6A小节 |
| 体内实验 | NSG小鼠转移1×10^7 PBMC和1×10^6 Mϕ,腹腔注射10μg SARS-CoV-2蛋白,7天后检测脾脏中CD4+CD38+ T细胞。 阅读提示:Methods部分的In vivo Antigen Presentation Assay小节 |