验证胞葬作用诱导糖酵解
确定胞葬作用是否以及如何影响巨噬细胞的糖酵解。
使用Seahorse代谢分析,将BMDM和HMDM与凋亡细胞共孵育45分钟(脉冲),洗涤后进行不同时间的追踪(1、6、24小时),测量ECAR和OCR。
PFKFB2-mediated glycolysis promotes lactate-driven continual efferocytosis by macrophages
包含体外细胞实验(BMDM/HMDM)、siRNA敲低、Seahorse代谢分析、体内骨髓移植及地塞米松胸腺模型等多个独立证据层级,并进行功能验证与机制验证。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 人单核细胞来源巨噬细胞(HMDM) PFKFB2突变小鼠骨髓移植的C57BL/6J小鼠 地塞米松诱导的胸腺细胞凋亡模型
使用PFKFB2突变小鼠的BMDM验证糖酵解缺陷 使用siRNA敲低Pfkfb2或Slc2a1验证糖酵解和葡萄糖摄取 使用2-DG和乳酸处理验证糖酵解和乳酸的作用 使用地塞米松诱导的胸腺细胞凋亡模型验证体内胞葬作用 使用BAPTA-AM或MK-2206处理验证钙信号和Akt的作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定胞葬作用是否以及如何影响巨噬细胞的糖酵解。
使用Seahorse代谢分析,将BMDM和HMDM与凋亡细胞共孵育45分钟(脉冲),洗涤后进行不同时间的追踪(1、6、24小时),测量ECAR和OCR。
确定PFKFB2和TXNIP是否参与胞葬作用诱导的糖酵解,并探索其上游信号。
使用免疫印迹检测胞葬作用后PFKFB2和TXNIP的磷酸化水平,使用siRNA敲低Pfkfb2、Slc2a1或Txnip,使用Akt抑制剂MK-2206处理,观察对糖酵解、葡萄糖摄取和PFKFB2/TXNIP磷酸化的影响。
验证糖酵解和乳酸是否影响巨噬细胞连续摄取多个凋亡细胞的能力。
进行连续胞葬作用实验,用绿色荧光标记的凋亡细胞进行首次孵育,2小时间隔后,用红色荧光标记的凋亡细胞进行第二次孵育,评估双阳细胞比例。使用2-DG、siPfkfb2、siLdha、乳酸、DCA、MK-2206、BAPTA-AM、中和抗体等处理。
确定乳酸是否通过钙信号上调MerTK和LRP1的细胞表面表达以增强胞葬作用。
使用免疫荧光和图像分析检测PFKFB2突变或siPfkfb2处理后的BMDM中MerTK和LRP1的细胞表面表达。使用Fluo-8-AM钙染色和活细胞成像评估胞内钙水平。使用BAPTA-AM螯合胞内钙。
在体内评估PFKFB2对巨噬细胞胞葬作用和组织消退的重要性。
将PFKFB2突变小鼠或野生型小鼠的骨髓移植到受照射的C57BL/6J小鼠中,4周后进行地塞米松胸腺实验。分析胸腺重量、细胞数、凋亡细胞、巨噬细胞数量、体内胞葬作用、坏死区域以及MerTK和LRP1的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | 10-013-CV |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Corning | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Corning | 10-040 | |
| 细胞极化 | 脂多糖 | -- | -- |
| 重组小鼠IFN-γ | PeproTech | -- | |
| 重组人IFN-γ | PeproTech | -- | |
| 重组小鼠IL-4 | PeproTech | -- | |
| 重组人IL-4 | PeproTech | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | PreproTech | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PreproTech | -- | |
| 阴性对照 | 乱序RNA | Dharmacon | -- |
| 基因沉默 | siRNA(ON-TARGETplus SMARTPool) | Dharmacon | -- |
| Lipofectamine RNAi-MAX转染试剂 | Life Technologies | -- | |
| 代谢分析 | Seahorse XF96分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| Seahorse XF DMEM测定培养基 | Seahorse Bioscience | 103575-100 | |
| 2-NBDG | Thermo Fisher | -- | |
| Fluo-8-AM钙离子荧光探针 | Abcam | -- | |
| 乳酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞染色 | pHrodo染料 | Thermo Fisher | -- |
| PKH26染料 | Sigma-Aldrich | -- | |
| PKH67染料 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 药物处理 | MK-2206(Akt抑制剂) | -- | -- |
| 2-脱氧葡萄糖(2-DG) | -- | -- | |
| 乳酸 | -- | -- | |
| BAPTA-AM(钙螯合剂) | -- | -- | |
| 细胞松弛素D | -- | -- | |
| Western blot | Laemmli样品缓冲液 | Bio-Rad | -- |
| Novex 4-20% Tris-甘氨酸梯度凝胶 | Invitrogen | -- | |
| SuperSep Phos-tag凝胶 | FUJIFILM Wako | -- | |
| 抗PFKFB2抗体 | CST | 13045 | |
| 抗磷酸化PFKFB2抗体 | CST | 13064 | |
| 抗Akt抗体 | CST | 4691 | |
| 抗磷酸化Akt抗体 | CST | 4060 | |
| 抗TXNIP抗体 | CST | 14715 | |
| 抗MerTK抗体 | R&D systems | AF591 | |
| 抗LRP1抗体 | Abcam | Ab92544 | |
| 抗β-actin抗体 | CST | 5125 | |
| LC-MS/MS | QTRAP 6500 LC-MS/MS系统 | SCIEX | -- |
| 动物实验 | 地塞米松 | Sigma-Aldrich | -- |
| 新霉素 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 抗GLUT1抗体 | Abcam | Ab15309 | |
| 抗Mac2抗体 | Cedarlane | CL8942LE | |
| 含DAPI的ProLong Gold抗淬灭封片剂 | Invitrogen | -- | |
| 基因表达分析 | PureLink RNA Mini试剂盒 | Life Technologies | -- |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | TruStain FcX(抗小鼠CD16/32) | Biolegend | -- |
| Alexa Fluor 647抗GLUT1抗体 | Abcam | ab195020 | |
| FITC抗F4/80抗体 | Biolegend | 123108 | |
| FITC膜联蛋白V | Biolegend | 640906 | |
| 显微镜 | 荧光显微镜 | Leica | DMI6000B |
| 转盘共聚焦显微镜 | Nikon | Eclipse Ti |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | BMDM培养基含20% L-929条件培养基;HMDM培养基含GM-CSF或M-CSF 阅读提示:Methods:Generation of BMDMs;Generation of HMDMs |
| 凋亡细胞制备 | Jurkat细胞经UV照射15分钟,PBS孵育2-3小时,与巨噬细胞比例5:1 阅读提示:Methods:Generation of apoptotic Jurkat cells |
| siRNA转染 | 使用Dharmacon ON-TARGETplus SMARTPool siRNA,浓度20 nM,Lipofectamine RNAi-MAX转染 阅读提示:Methods:siRNA-mediated gene silencing |
| Seahorse分析 | 细胞密度20,000细胞/孔,培养基为Seahorse XF DMEM,底物浓度:葡萄糖20 mM、寡霉素2 μM、2-DG 80 mM 阅读提示:Methods:Seahorse analysis |
| 胞葬作用实验 | 凋亡细胞与巨噬细胞比例5:1,孵育45分钟,连续胞葬作用间隔2小时 阅读提示:Methods:Single and continual efferocytosis assays |
| 体内实验 | 小鼠品系C57BL/6J,辐射剂量1000 rads,骨髓细胞注射量2.5×10^6,地塞米松剂量250 μg 阅读提示:Methods:Mouse husbandry;Bone marrow transplantation;Dexamethasone–thymus assay |