临床样本关联分析
探究SOST表达与乳腺癌骨转移及预后的相关性。
对422例乳腺癌原发灶组织进行免疫组化染色,分析SOST表达与临床病理特征及生存期的关系。
Targeting SOST using a small-molecule compound retards breast cancer bone metastasis
包含临床样本分析(IHC、生存分析)、体外细胞功能实验(增殖、迁移、黏附)、体内动物模型(骨转移模型)、机制验证(免疫共沉淀、RNA-seq)以及药物筛选与类器官实验,多层证据相互印证。
SCP2细胞(骨转移倾向乳腺癌细胞系) MDA-MB-231细胞 MCF-7细胞 BALB/c裸鼠骨转移模型 乳腺癌类器官
SCP2细胞中SOST敲低效率达85% S6处理SCP2细胞的IC50为1.89 μM 小鼠左心室注射SCP2细胞(1×10^6) S6给药剂量为10 mg/kg,每周两次 类器官实验S6处理浓度为2 μM和80 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究SOST表达与乳腺癌骨转移及预后的相关性。
对422例乳腺癌原发灶组织进行免疫组化染色,分析SOST表达与临床病理特征及生存期的关系。
验证SOST对乳腺癌细胞增殖、迁移和黏附能力的影响。
构建SOST敲低和过表达细胞系,通过CCK-8、迁移实验和黏附实验检测细胞功能变化。
验证SOST敲低对乳腺癌骨转移和生存的影响。
通过左心室注射SCP2细胞建立骨转移模型,监测肿瘤转移和生存。
阐明SOST促进乳腺癌骨转移的分子机制。
通过RNA-seq分析基因表达变化,预测STAT3结合位点,Western blot检测信号通路蛋白。
鉴定靶向SOST-STAT3相互作用的小分子抑制剂。
利用计算建模和虚拟筛选从约120,000个化合物中筛选候选分子,并通过BLI和细胞实验验证。
评估S6对乳腺癌细胞增殖和类器官生长的抑制作用。
检测S6对SCP2、MCF-7、MDA-MB-231细胞的增殖抑制,以及对乳腺癌类器官的生长抑制。
评估S6对乳腺癌骨转移的治疗效果和安全性。
在骨转移模型中给予S6治疗,监测骨转移、生存率和体重,并通过组织染色评估毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学/免疫组化 | 抗SOST抗体 (ab63097) | Abcam | ab63097 |
| 细胞培养 | Leibovitz's L15培养基 | Thermo Fisher | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| α-MEM培养基 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | Thermo Fisher | A1113803 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | -- |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | RR047A | |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara | RR820A | |
| Western blot | 抗SOST抗体 (ABIN6997488) | antibodies-online GmbH | ABIN6997488 |
| 抗TGF-β抗体 (ER31210) | HuanBio | ER31210 | |
| 抗SMAD3抗体 (66516-1-1g) | PTG | 66516-1-1g | |
| 抗CXCR4抗体 (60042-1-1g) | PTG | 60042-1-1g | |
| 抗STAT3抗体 (10253-2-AP) | PTG | 10253-2-AP | |
| 抗p-STAT3抗体 (9138) | Cell Signaling Technology | 9138 | |
| 抗KRAS抗体 (12063-1-AP) | PTG | 12063-1-AP | |
| 抗β-actin抗体 (20536-1-AP) | PTG | 20536-1-AP | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 |
| ELISA | CXCL12 ELISA试剂盒 | PTG | KE10049 |
| 迁移实验 | 24孔Transwell板 | Corning | 3422 |
| 黏附实验 | β-甘油磷酸 | Solarbio | -- |
| 抗坏血酸 | Solarbio | -- | |
| 氢氧化铵 | Sigma | -- | |
| Triton X-100 | Solarbio | -- | |
| 细胞活力实验 | CCK8试剂盒 | Dojindo | -- |
| BLI | Octet K2仪器 | ForteBio | -- |
| 重组SOST蛋白 (10593-H07H) | SinoBio | 10593-H07H | |
| S6化合物 | Chemdiv | C29H24N6O2S | |
| 动物实验 | TRAP染色试剂盒 | Sigma | 387A |
| 类器官培养 | Matrigel基质胶 | -- | -- |
| BMSC分化 | 碱性磷酸酶(ALP)试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA-seq | Illumina测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | 患者队列:Shengjing Hospital, 2011-2013, 422例乳腺癌患者;排除标准:新辅助化疗/放疗、其他肿瘤等。 阅读提示:Methods - Patients |
| 细胞培养 | 细胞系:MDA-MB-231(L15培养基)、MCF-7(DMEM+10%FBS)、MC3T3-E1(α-MEM+10%FBS)、SCP2;培养条件:37°C,5% CO2。 阅读提示:Methods - Cell culture |
| SOST敲低/过表达 | SCP2细胞慢病毒感染MOI=10,使用5 μg/mL嘌呤霉素筛选7天;SOST过表达质粒转染后G418筛选。 阅读提示:Methods - Transduction |
| 体外功能实验 | 趋化实验:3×10^4细胞/室,2%FBS培养基,共培养24h;黏附实验:骨基质层诱导9天,细胞孵育15min。 阅读提示:Methods - Chemotaxis assay; Adhesion assay |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠,左心室注射SCP2细胞(1×10^6),每组8-10只;观察期42天;S6治疗:10 mg/kg,静脉注射,每周两次。 阅读提示:Methods - Murine xenograft tumor model |
| 药物处理 | S6浓度:体外细胞实验2 μM、80 μM;类器官实验2 μM和80 μM;体内10 mg/kg。 阅读提示:Methods - Testing drug sensitivity in organoid cultures; Results - S6 inhibits breast cancer progression |
| 机制研究 | 免疫共沉淀:S6预处理200 μM,4°C过夜;RNA-seq:SCP2/NC vs SCP2/KD1细胞。 阅读提示:Methods - Immunoprecipitation; Transcriptome sequencing |