错配修复缺陷肿瘤细胞中的DNA感知对抗肿瘤免疫至关重要

DNA Sensing in Mismatch Repair-Deficient Tumor Cells Is Essential for Anti-tumor Immunity.

作者信息Changzheng Lu, Junhong Guan, Steve Lu, Qihuang Jin, Benoit Rousseau, Tianshi Lu, Dennis Stephens, Hongyi Zhang, Jiankun Zhu, Mingming Yang, Zhenhua Ren, Yong Liang, Zhida Liu, Chuanhui Han, Longchao Liu, Xuezhi Cao, Anli Zhang, Jian Qiao, Kimberly Batten, Mingyi Chen, Diego H Castrillon, Tao Wang, Bo Li, Luis A Diaz, Guo-Min Li, Yang-Xin Fu
PMID33338425
发布时间2021-01-11
DOI10.1016/j.ccell.2020.11.006

实验完整度

高

包含体外细胞模型、多种基因敲除小鼠模型、人源化小鼠模型和临床样本分析,并进行了功能验证和机制验证。

主要模型

小鼠乳腺癌细胞系4T1及其Mlh1敲除变体 小鼠黑色素瘤细胞系B16-OVA及其Mlh1敲除变体 小鼠结肠癌细胞系MC38-OVA及其Mlh1敲除变体 人结肠癌细胞系HCT116及其MLH1敲除/回补变体

重点核对

肿瘤细胞中Mlh1敲除的克隆筛选及MLH1蛋白缺失的Western blot确认 dMLH1肿瘤细胞中胞质DNA的定量(PicoGreen染色和qPCR) dMLH1肿瘤细胞中IFN-β的ELISA检测 STING或cGAS敲除对肿瘤生长和T细胞浸润的影响 ICB治疗中抗CTLA4和抗PDL1抗体的剂量和给药方案

摘要

在具有DNA错配修复缺陷(dMMR)的高突变癌症中,新抗原的增加被认为是抗PD-1治疗高客观缓解率的主要贡献因素。然而,耐药机制尚未完全了解。使用MMR基因Mlh1缺陷(dMLH1)的肿瘤模型,我们发现dMLH1肿瘤细胞以cGAS-STING依赖的方式积累胞质DNA并产生IFN-β,这使得dMLH1肿瘤进展缓慢且对检查点阻断高度敏感。在新抗原固定的模型中,dMLH1肿瘤有效诱导T细胞启动,并失去对检查点治疗的抵抗,独立于肿瘤突变负荷。相应地,肿瘤细胞中STING或cGAS的缺失减少了T细胞的肿瘤浸润,并赋予对检查点阻断的抵抗。在临床上,人dMMR癌症中cGAS/STING的下调与不良预后相关。我们得出结论,肿瘤细胞内的DNA感知对于dMMR触发的抗肿瘤免疫至关重要。本研究为抗dMMR癌症免疫治疗提供了新的机制和生物标志物。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
dMMR肿瘤中除新抗原外,是否存在其他机制贡献于抗肿瘤免疫和对ICB的敏感性?
核心机制
MLH1缺陷导致胞质DNA积累,激活肿瘤细胞内在的cGAS-STING通路,产生IFN-β,促进DC交叉提呈和CD8+ T细胞启动,从而增强抗肿瘤免疫和ICB疗效。
主要证据
在多种小鼠肿瘤模型和人细胞系中,dMLH1细胞积累胞质DNA并激活cGAS-STING-IFN通路;STING或cGAS敲除加速肿瘤生长并减少T细胞浸润;在新抗原固定的模型中,dMLH1肿瘤仍能增强T细胞启动和ICB疗效;临床样本中cGAS/STING高表达与更好的生存相关。
研究意义
揭示了dMMR肿瘤中DNA感知通路对抗肿瘤免疫的重要性,提供了cGAS/STING作为ICB治疗生物标志物的潜力,并为克服ICB耐药提供了新思路。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立dMLH1肿瘤模型

探究MLH1缺陷对肿瘤生长和免疫原性的影响

使用CRISPR-Cas9在4T1和B16-OVA细胞中敲除Mlh1,筛选克隆并体外传代,然后接种到免疫 competent小鼠中观察肿瘤生长。

2

验证cGAS-STING通路在dMLH1肿瘤中的作用

确定肿瘤细胞内在的cGAS-STING通路对肿瘤生长和免疫的影响

在dMLH1细胞中敲除Sting或cGAS,接种到小鼠中,观察肿瘤生长和T细胞浸润;使用STING或cGAS缺陷小鼠进行对比。

3

检测dMLH1细胞中胞质DNA和IFN信号

探究MLH1缺陷是否导致胞质DNA积累和I型IFN信号激活

使用PicoGreen染色和qPCR检测胞质DNA,ELISA检测IFN-β,qPCR检测ISGs,Western blot检测STAT1磷酸化。

4

MLH1回补实验

验证MLH1缺失对胞质DNA和IFN信号的因果关系

在dMLH1细胞中回补MLH1,检测胞质DNA和IFN信号的变化,以及肿瘤生长。

5

新抗原固定模型中的T细胞启动实验

探究dMLH1介导的DNA感知是否独立于新抗原促进T细胞启动

使用OVA表达肿瘤细胞与BMDCs共培养,然后与OT-I T细胞共培养,检测T细胞增殖和细胞因子产生;体内使用OT-I T细胞转移和ELISPOT。

6

ICB治疗实验

评估DNA感知对ICB疗效的影响

在肿瘤模型中给予抗CTLA4和抗PDL1抗体,观察肿瘤反应和生存。

7

临床样本分析

探究cGAS/STING表达与dMMR癌症患者预后的关系

分析TCGA数据库和临床试验样本中cGAS/STING表达与生存的关系。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Dulbecco改良Eagle培养基Sigma-AldrichD6429
胎牛血清Sigma-Aldrich--
Lipofectamine 2000转染试剂----
BD FACSAria II细胞分选仪BD--
Amersham ECL Select试剂Amersham--
ChemiDoc MP成像系统Bio-Rad--
Pico488双链DNA定量试剂Lumiprobe life science solutions42010
Prolong Diamond抗淬灭封片剂(含DAPI)Thermo Fisher Scientific36962
Leica TCS SP8共聚焦显微镜Leica--
Tecan SPARK多功能微孔板读数仪Tecan--
重组小鼠FLT3LBioLegend576306
CFSE细胞分裂追踪试剂盒BioLegend423801
EasySep小鼠CD11c阳性选择试剂盒IISTEMCELL18780
EasySep小鼠CD8+ T细胞分离试剂盒STEMCELL19853
BD CBA小鼠炎症试剂盒BD Biosciences552364
小鼠IFN-β ELISA试剂盒PBL Assay Science42410-2
BD小鼠IFN-γ ELISPOT试剂盒BD Biosciences551083
SsoAdvanced通用SYBR Green预混液Bio-Rad1725272
TRIzol试剂Thermo-Invitrogen15596018
ProtoScript II逆转录酶NEBM0368L
APC抗小鼠CD8a抗体BioLegend100712
PE抗小鼠CD3抗体BioLegend100206
抗FcγIII/II受体抗体(克隆2.4G2)BD Biosciences553141
可固定活性染料eFluor 506----
CytoFLEX流式细胞仪Beckman Coulter--
STING(D2P2F)兔单克隆抗体Cell Signaling Technology13647S
cGAS(D3O8O)兔单克隆抗体Cell Signaling Technology31659S
纯化小鼠抗人MLH-1抗体BD Biosciences550838
磷酸化Stat1(Tyr701)(58D6)兔单克隆抗体Cell Signaling Technology9167
微管蛋白抗体(B-5-1-2)Santa Cruz Biotechnologysc-23948
体内用抗小鼠CD8β抗体(Lyt 3.2)BioXcellBE0223
体内用抗小鼠PDL1抗体(10F.9G2)BioXcellBE0101
体内用抗小鼠CTLA4抗体(9D9)BioXcellBP0164
体内用抗小鼠IFNAR1抗体(MAR1-5A3)BioXcellBP0241
阿替利珠单抗pharmacy--
伊匹木单抗pharmacy--
卵清蛋白Sigma-AldrichA2512
OVA257-264肽(SIINFEKL)Invivogenvac-sin
SIY肽Sigma-Aldrich--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
dMLH1肿瘤模型建立
Mlh1敲除的克隆筛选和验证、细胞传代天数、接种细胞数(1×10^6)、小鼠品系和年龄
阅读提示:Methods: Cell lines; Tumor growth and treatments; Figure 1A-B
STING或cGAS敲除实验
基因敲除的克隆验证、接种细胞数、小鼠品系、观察时间
阅读提示:Methods: Cell lines; Figure 1D-E; Figure S1C
ICB治疗实验
抗体剂量(抗CTLA4 200 µg/小鼠,抗PDL1 100 µg/小鼠)、给药途径(腹腔注射)、给药频率(每3天一次)、治疗持续时间、肿瘤植入方法(碎片移植或细胞注射)
阅读提示:Methods: Tumor growth and treatments; Figure 5; Figure S5
T细胞启动实验
BMDC与肿瘤细胞共培养比例、T细胞与BMDC比例(1:2和1:20)、CFSE标记浓度(2 µM)、共培养时间(2天)、OVA蛋白浓度(100 µg/ml)
阅读提示:Methods: In vitro cross-priming of T cells by BMDCs; Figure 4A-C
胞质DNA定量
细胞数量(2×10^7)、胞质分离方法、Pico488稀释比例(1:200)、qPCR引物
阅读提示:Methods: Quantification of Cytosolic DNA; Figure 3C-D