建立肝细胞特异性PKCλ/ι敲除小鼠并评估肝癌发生
验证PKCλ/ι缺失是否促进HCC发生和进展。
将Prkcif/f与Alb-Cre小鼠杂交获得肝细胞特异性敲除小鼠,在常规饮食和DEN/HFD方案下观察肝脏病理、肿瘤发生和肺转移。
PKCλ/ι Loss Induces Autophagy, Oxidative Phosphorylation, and NRF2 to Promote Liver Cancer Progression.
包含肝细胞特异性基因敲除小鼠、HCC细胞系、移植瘤模型、患者样本及代谢组学等多层级证据,并有功能与机制验证
Prkcif/f;Alb-Cre肝细胞特异性PKCλ/ι敲除小鼠 DEN/HFD诱导小鼠HCC模型 BNL CL.2、DihXD3、HepG2、SK-HEP-1肝癌细胞系 NSG小鼠脾内移植转移模型
Prkcif/f;Alb-Cre小鼠在DEN/HFD方案下HCC发生率及肺转移率 PKCλ/ι缺失细胞中氧消耗率(OCR)及GW6471(10 μM)或BafA1(30 nM)的抑制效果 LC3 S12位点被PKCλ/ι磷酸化及LC3S12A突变对自噬的影响 sgPrkci细胞中Nfe2l2敲低或NAC(2 mM)/BHA(100 μM)处理对增殖和caspase-3活性的影响 人HCC样本(271例)及非肿瘤肝组织(143例)中PKCλ/ι表达与肿瘤分级和复发的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PKCλ/ι缺失是否促进HCC发生和进展。
将Prkcif/f与Alb-Cre小鼠杂交获得肝细胞特异性敲除小鼠,在常规饮食和DEN/HFD方案下观察肝脏病理、肿瘤发生和肺转移。
确定PKCλ/ι缺失是否引起氧化磷酸化、ROS和NRF2通路上调。
对Prkcif/f和Prkcif/f;Alb-Cre小鼠肝脏进行RNA-seq和GSEA,检测OCR、酮体、甘油三酯、DHE染色、NQO1表达和NRF2靶基因。
确定PKCλ/ι是否通过PKCζ-PPARα轴调控OXPHOS。
在BNL CL.2、HepG2、DihXD3细胞中CRISPR/Cas9敲除PKCλ/ι,检测OCR、PPARα磷酸化、PKCζ表达及siRNA敲低PKCζ的影响。
确定PKCλ/ι是否直接抑制自噬及其分子机制。
检测LC3-II水平、自噬通量、电镜观察自噬囊泡、BioID2鉴定互作蛋白、体外激酶实验和LC3 S12A突变体功能。
确定代谢和ROS/NRF2变化是否驱动恶性表型。
在sgPrkci细胞中检测增殖、成球、侵袭,使用etomoxir、GW6471、氯喹、NAC、BHA处理及Nfe2l2敲低,并进行脾内移植转移实验。
确定PKCλ/ι缺失的非肿瘤肝组织是否促进肿瘤生长和转移。
将DihXD3细胞脾内注射或原位植入Prkcif/f和Prkcif/f;Alb-Cre小鼠,并利用Nfe2l2+/−杂交验证NRF2依赖性。
验证小鼠发现是否适用于人肝癌。
对271例切除HCC样本和143例非肿瘤肝组织进行IHC,分析PKCλ/ι表达与肿瘤分级和复发的相关性,并利用TCGA和GSE10143数据验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | 10–017CV |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Corning | 25–005-CI | |
| 动物实验 | 60%高脂小鼠饲料 | Bio-Serv | F3282 |
| 二乙基亚硝胺 | -- | -- | |
| 基因敲除 | Truecut Cas9蛋白v2 | Thermo | -- |
| Neon电转染系统 | Invitrogen | MPK1096 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778030 |
| 质粒转染 | X-tremeGENE HP DNA转染试剂 | Roche | 6366236001 |
| OCR检测 | XFp细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 寡霉素 | Sigma-Aldrich | 75351 | |
| FCCP | Sigma-Aldrich | C2920 | |
| 鱼藤酮 | Sigma-Aldrich | R8875 | |
| 代谢标记 | [U-13C16]棕榈酸 | Cambridge Isotope | CLM-409-PK |
| [U-13C6]葡萄糖 | Cambridge Isotope | CLM-1396-PK | |
| 自噬通量检测 | 巴弗洛霉素A1 | Selleck Chemicals LLC | S1413 |
| 细胞处理 | GW6471 | Sigma-Aldrich | G5045 |
| 依托莫司 | Sigma-Aldrich | E1905 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A7250 | |
| 氯喹 | -- | -- | |
| 花萼海绵诱癌素A | Sigma | C5552 | |
| 原代肝细胞分离 | IV型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C5138–1G |
| 血清检测 | VetScan v2生化分析仪 | Abaxis | -- |
| 血浆酮体检测 | β-羟基丁酸比色检测试剂盒 | Cayman | 700190 |
| 肝甘油三酯检测 | 甘油三酯定量检测试剂盒 | Wako | 992–02892 |
| 免疫组化 | VECTASTAIN Elite ABC-HRP试剂盒 | Vector | PK-6100 |
| 免疫印迹 | ECL蛋白质印迹底物 | Thermo Scientific | 32106 |
| 组织裂解 | TissueLyser II组织研磨仪 | QIAGEN | 85300 |
| 共聚焦成像 | Zeiss LSM 710 NLO共聚焦显微镜 | Carl Zeiss Microscopy | -- |
| 电镜观察 | Philips CM-100透射电子显微镜 | Philips Electron Optics | -- |
| 流式分析 | LSRFortessa 14色流式分析仪 | BD Biosciences | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| RNA纯化 | Quick-RNA小量提取试剂盒 | Zymo Research | R1054 |
| RT-qPCR | MultiScribe逆转录酶 | Invitrogen | 4311235 |
| 成球实验 | Matrigel生长因子减少型基质胶 | Corning | 356230 |
| 侵袭实验 | Matrigel侵袭实验试剂盒 | Corning | 354480 |
| ROS检测 | 二氢乙锭 | Sigma-Aldrich | D7008 |
| 抗体 | 兔抗磷酸化MAP1LC3A(S12)抗体 | Abgent | AP3301a |
| 鼠抗NQO1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32793 | |
| 鼠抗NRF2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365949 | |
| 兔抗SQSTM1/p62抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5–20839 | |
| 兔抗MAP1LC3A抗体 | Cell Signaling Technology | 4599 | |
| 兔抗PKCζ抗体 | Cell Signaling Technology | 9368 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DEN/HFD诱导HCC模型 | DEN剂量25 mg/kg,2周龄腹腔注射;60%高脂饮食喂养32周;36周龄处死;雄性和雌性均使用 阅读提示:Methods Details中Experiment Mouse Models小节 |
| PKCλ/ι敲除细胞代谢检测 | GW6471浓度10 μM处理24小时;BafA1浓度30 nM处理24小时;OCR归一化至细胞数 阅读提示:Methods Details中Respiration Assays小节,Figure 3C-D和Figure 4U-V图注 |
| 自噬通量检测 | 溶酶体抑制剂PI(20 mM NH4Cl和200 μM leupeptin)处理0、2、4小时;FBS饥饿4小时;BafA1 100 nM处理48小时(HEK293T) 阅读提示:Methods Details中LC3 Flux Analyses小节,Figure 4G-I图注 |
| 脾内注射转移模型 | 2×10^6 DihXD3细胞脾内注射后脾切除;8周龄雄性NSG小鼠;14天或35天后检测;转移指数计算方式 阅读提示:Methods Details中Experiment Mouse Models小节,Figure 5L和Figure 6A图注 |
| 原位肝植入模型 | 1×10^6细胞(50% Matrigel,20 μl)注射至14周龄小鼠肝中叶和左外叶包膜下,每肝3个注射位点;HFD喂养8周前和4周后;28天后检测 阅读提示:Methods Details中Experiment Mouse Models小节,Figure 6F图注 |
| 人HCC样本IHC分析 | 271例切除HCC样本和143例非肿瘤肝组织;PKCλ/ι表达分级(none、weak、moderate、strong);logistic回归分析139例;Kaplan-Meier分析82例(GSE10143) 阅读提示:Methods Details中Bioinformatics Analysis of Clinical Data小节,Figure 7A-D图注 |