患者样本中SYK表达与化疗耐药关联分析
比较原发与复发卵巢癌中SYK和p-SYK表达,并分析其与化疗反应的关系。
对配对原发和复发HGSC组织进行免疫组化,使用H-score半定量SYK和p-SYK(Y525/526);对214例卵巢癌腹水样本进行SYK染色并与化疗反应关联分析。
Inhibition of Spleen Tyrosine Kinase Potentiates Paclitaxel-Induced Cytotoxicity in Ovarian Cancer Cells by Stabilizing Microtubules.
包含患者组织芯片、细胞系、动物移植瘤模型及SILAC磷酸化蛋白质组学,并有功能与机制验证。
卵巢高级别浆液性癌患者组织及腹水样本 SKOV3和MPSC1及其紫杉醇耐药亚系 SKOV3c.2皮下移植瘤裸鼠模型 SKOV3Luc腹腔复发移植瘤裸鼠模型
紫杉醇耐药细胞系SKOV3TR和MPSC1TR中SYK及p-SYK(Y525/526)表达水平 R406与紫杉醇联合的协同指数及紫杉醇IC50变化倍数 R406(6.5 mg/kg)和紫杉醇(8 mg/kg)联合对SKOV3c.2皮下移植瘤重量的影响 R406(10 mg/kg)和紫杉醇(10 mg/kg)联合对SKOV3Luc腹腔复发瘤 luminescence 的影响 SILAC磷酸化蛋白质组中R406下调的磷酸化肽段及候选SYK底物
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较原发与复发卵巢癌中SYK和p-SYK表达,并分析其与化疗反应的关系。
对配对原发和复发HGSC组织进行免疫组化,使用H-score半定量SYK和p-SYK(Y525/526);对214例卵巢癌腹水样本进行SYK染色并与化疗反应关联分析。
确定SYK表达和活性是否与紫杉醇耐药相关。
比较亲本和紫杉醇耐药细胞中SYK和p-SYK表达;在25种原代卵巢癌细胞培养和细胞系中分析p-SYK/SYK比值与紫杉醇或卡铂IC50的相关性。
验证SYK是否可作为治疗靶点,以及抑制SYK是否增敏紫杉醇。
使用shRNA或siRNA敲低SYK,或用SYK抑制剂R406、P505-15/PRT062607、GS-9973处理细胞;检测细胞增殖、SYK磷酸化、药物联合指数及紫杉醇IC50变化。
鉴定紫杉醇耐药细胞中受SYK调控的底物,探索耐药机制。
对R406或溶剂对照处理的SKOV3TR细胞进行SILAC和磷酸化蛋白质组分析,鉴定差异磷酸化肽段和候选SYK底物;通过体外激酶实验和免疫共沉淀验证微管相关蛋白为SYK底物。
验证SYK激活是否足以导致紫杉醇耐药并增加MAP1B/MAP4酪氨酸磷酸化。
建立四环素诱导表达野生型SYK或持续激活型SYK-130E的SKOV3细胞,检测紫杉醇IC50及MAP1B、MAP4、微管蛋白的酪氨酸磷酸化。
验证抑制SYK是否增强紫杉醇诱导的微管稳定。
用Western blot检测乙酰化α-tubulin和去酪氨酸化α-tubulin;用FRAP分析GFP-α-tubulin的微管动态;并在体内肿瘤样本中检测乙酰化α-tubulin。
在动物模型中验证R406与紫杉醇联合的抗肿瘤效果。
使用SKOV3c.2皮下移植瘤模型和SKOV3Luc腹腔复发模型,分别给予R406、紫杉醇或联合治疗,监测肿瘤重量、BrdU掺入和 luminescence 信号。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗SYK抗体[4D10.1] | Abcam | ab3113 |
| 抗磷酸化SYK(Tyr525/526)抗体 | CST | 2711 | |
| 抗α微管蛋白(磷酸化Y272)抗体[EP1334(2)Y] | Abcam | ab76290 | |
| 柠檬酸盐抗原修复液 | DAKO | -- | |
| EnVision+检测系统 | DAKO | -- | |
| 动物实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 药物处理 | R406 | -- | -- |
| P505-15/PRT062607 | -- | -- | |
| GS-9973 | -- | -- | |
| 细胞培养与处理 | 紫杉醇 | -- | -- |
| 多西他赛 | -- | -- | |
| 卡铂 | -- | -- | |
| 5-氟尿嘧啶 | -- | -- | |
| 多柔比星 | -- | -- | |
| 甲氨蝶呤 | -- | -- | |
| 细胞培养 | Hoechst 33342 | -- | -- |
| 流式细胞术 | 膜联蛋白V | -- | -- |
| 免疫印迹 | 抗BrdU抗体 | -- | -- |
| 活体成像 | D-荧光素 | -- | -- |
| IVIS Spectrum活体成像仪 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本免疫组化 | 配对原发和复发HGSC样本23对;腹水样本214例;抗体货号及H-score评分标准。 阅读提示:Experimental Procedures的Immunohistochemistry小节及Figure 1图注。 |
| 细胞系及耐药亚系 | SKOV3、MPSC1亲本及紫杉醇耐药亚系SKOV3TR、MPSC1TR的来源和培养条件。 阅读提示:Results中“Association between paclitaxel resistance and SYK”部分及Supplemental Experimental Procedures。 |
| 药物联合处理 | R406浓度2.5 µM;紫杉醇浓度30 nM;联合处理时间;联合指数计算方法。 阅读提示:Figure 3图注和Figure 7图注;Results中“SYK inhibitors enhance paclitaxel sensitivity”部分。 |
| SILAC磷酸化蛋白质组学 | SILAC标记条件;R406处理浓度和时间;两次独立实验的H/L比值阈值(<0.7)。 阅读提示:Results中“Identification of substrates phosphorylated by SYK”部分及Table S2。 |
| 皮下移植瘤模型 | SKOV3c.2细胞接种量5×10^6/只;紫杉醇8 mg/kg,R406 6.5 mg/kg;3天给药/3天停药周期,共4周期;BrdU 150 mg/kg腹腔注射。 阅读提示:Experimental Procedures的Xenograft mouse tumor models小节及Figure 4图注。 |
| 腹腔复发移植瘤模型 | SKOV3Luc细胞接种量5×10^6/只;紫杉醇10 mg/kg,R406 10 mg/kg,每周3次;luminescence阈值>2×10^6 photons/s。 阅读提示:Experimental Procedures的Xenograft mouse tumor models小节及Figure 4图注。 |
| FRAP微管动态分析 | GFP-α-tubulin稳定转染细胞系;漂白10秒,观察2分钟,每2秒采集图像;每组12-15次观察。 阅读提示:Experimental Procedures的FRAP小节及Figure 7图注。 |