CIS在CD4+ T细胞中的表达特征分析
确定CIS在T细胞活化及不同辅助性T细胞亚群中的表达模式及诱导因素。
分选naive CD4+ T细胞,用板结合anti-CD3和anti-CD28活化不同时间,并用多种细胞因子或阻断抗体处理,通过定量RT-PCR检测Cis、Il2、Cd25 mRNA;检测各辅助性T细胞亚群中Cis mRNA。
The signaling suppressor CIS controls proallergic T cell development and allergic airway inflammation.
含CIS条件敲除与CD4-Cre/Foxp3-Cre特异性小鼠、体外极化、ChIP及荧光素酶报告基因机制验证等多层证据
Cis−/−及Cisfl/flCD4-Cre基因敲除小鼠 C57BL/6及BALB/c来源的naive CD4+ T细胞体外极化 Stat5a、Stat6缺陷小鼠CD4+ T细胞 实验性过敏性哮喘小鼠模型
体外极化条件:TH1、TH2、TH9、TH17及iTreg的细胞因子和阻断抗体浓度 哮喘诱导采用文献34的标准方案,分组为Cis−/−与Cisfl/fl或CD4-Cre特异性敲除小鼠 CIS缺失后STAT3、STAT5、STAT6磷酸化及总蛋白免疫印迹检测时间点 ChIP中anti-STAT5、anti-STAT6与对照抗体及Il9启动子等基因区域引物 混合骨髓嵌合体中野生型CD45.1+与Cis−/−CD45.2+按1:1重建Rag1−/−小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定CIS在T细胞活化及不同辅助性T细胞亚群中的表达模式及诱导因素。
分选naive CD4+ T细胞,用板结合anti-CD3和anti-CD28活化不同时间,并用多种细胞因子或阻断抗体处理,通过定量RT-PCR检测Cis、Il2、Cd25 mRNA;检测各辅助性T细胞亚群中Cis mRNA。
验证CIS是否影响T细胞中STAT蛋白的活化。
比较野生型和Cis−/− CD4+ T细胞在anti-CD3/anti-CD28刺激及重组人IL-2存在下的STAT1、STAT3、STAT5、STAT6磷酸化水平;并利用IL-4、IL-6、IL-21中和抗体分析上游信号。
确定CIS缺失是否在体内引起过敏性肺部疾病。
对6月龄小鼠脾脏和肺相关淋巴结细胞进行胞内染色;对10月龄和18月龄小鼠肺组织进行H&E、Masson三色和PAS染色,评估炎症、胶原沉积和杯状细胞化生。
验证CIS在T细胞中而非Treg细胞中抑制过敏性气道炎症。
按标准方案诱导过敏性哮喘,比较Cis−/−与Cisfl/fl、Cisfl/flCD4-Cre与Cisfl/fl、Cisfl/flFoxp3-Cre小鼠的BALF细胞、肺浸润细胞、TH2细胞因子及肺组织mRNA;并用混合骨髓嵌合体验证T细胞内在作用。
确定CIS对TH1、TH2、TH9、TH17和iTreg分化的直接影响。
分选naive CD4+ T细胞,在TH1、TH2、TH9、TH17和iTreg极化条件下培养,通过胞内染色、ELISA和定量RT-PCR检测谱系标志物和细胞因子。
明确STAT5和STAT6在TH9分化中的作用及其对Il9的转录调控。
利用Stat5afl/−Mx-Cre小鼠和STAT5A1*6逆转录病毒过表达、Stat6−/−小鼠分析TH9分化;用ChIP检测STAT5和STAT6在Il4、Gata3、Il9等基因区域的结合;用荧光素酶报告基因检测Il9启动子转录激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| T细胞活化 | 抗CD3抗体(2C11) | BioXCell | -- |
| 抗CD28抗体(37.51) | BioXCell | -- | |
| 细胞因子中和 | 抗IL-4抗体(11B11) | BioXCell | -- |
| 抗IFN-γ抗体(XMG1.2) | BioXCell | -- | |
| 抗IL-6抗体(MP520F3) | R&D Systems | -- | |
| 抗IL-21抗体(AF594) | R&D Systems | -- | |
| T细胞极化 | 白细胞介素12 | Peprotech | -- |
| 白细胞介素4 | Peprotech | -- | |
| 转化生长因子β | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素6 | Peprotech | -- | |
| 免疫印迹分析 | 抗STAT1抗体(9172) | Cell Signaling Technology | 9172 |
| 抗磷酸化STAT1抗体(9171) | Cell Signaling Technology | 9171 | |
| 抗STAT3抗体(sc-482) | Santa Cruz Biotechnology | sc-482 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体(91345) | Cell Signaling Technology | 91345 | |
| 抗STAT5抗体(sc-835) | Santa Cruz | sc-835 | |
| 抗磷酸化STAT5抗体(93515) | Cell Signaling Technology | 93515 | |
| 抗STAT6抗体(sc-981) | Santa Cruz | sc-981 | |
| 抗磷酸化STAT6抗体(sc-981-G) | Santa Cruz | sc-981-G | |
| 抗CIS抗体(N19;sc-1529) | Santa Cruz | sc-1529 | |
| 染色质免疫沉淀 | 多克隆抗STAT5抗体(sc-835) | Santa Cruz | sc-835 |
| 多克隆抗STAT6抗体(sc-981) | Santa Cruz | sc-981 | |
| 对照免疫球蛋白G(sc-2763) | Santa Cruz | sc-2763 | |
| 荧光素酶报告基因实验 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma | -- |
| 双荧光素酶报告系统 | Promega | -- | |
| 定量RT-PCR | iQ SYBR green实时PCR试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| Bio-Rad iCycler光学系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T细胞体外极化 | 各亚群极化细胞因子与阻断抗体浓度、anti-CD3/anti-CD28用量及培养时间 阅读提示:Online Methods 'T cell differentiation'小节 |
| STAT磷酸化免疫印迹 | 活化时间点、是否加入外源IL-2、anti-IL-4/IL-6/IL-21中和抗体使用、抗体货号 阅读提示:Online Methods 'Immunoblot analysis'及Figure 1d图注 |
| 过敏性哮喘诱导 | 具体诱导方案、分组、每组样本量及检测终点 阅读提示:Online Methods 'Asthma induction',原文引用文献34,具体步骤文中未明确说明 |
| T细胞特异性与Treg特异性Cis敲除 | Cisfl/flCD4-Cre与Cisfl/flFoxp3-Cre小鼠构建及对照设置 阅读提示:Online Methods 'Mice'及Figure 4图注 |
| ChIP与荧光素酶报告基因 | 细胞活化时间、IL-2或IL-4处理、引物序列、PMA与IL-4组合 阅读提示:Online Methods 'ChIP'与'Luciferase reporter assay'及Figure 7图注 |