树突状细胞抗原摄取和提呈功能检测
验证ASC是否影响树突状细胞的抗原摄取和提呈能力,并判断是否依赖炎症小体。
比较野生型、Asc−/−、Nlrp3−/−和caspase-1−/− BMDCs对荧光标记的zymosan A、polystyrene beads、OVA、dextran和LY的摄取;Asc−/− DCs与BSA特异性T细胞共培养检测增殖和细胞因子。
The inflammasome adaptor ASC regulates the function of adaptive immune cells by controlling Dock2-mediated Rac activation and actin polymerization.
包含体外原代细胞功能验证、基因缺陷小鼠体内迁移、骨髓嵌合体、回补救援及机制验证等多层级证据。
野生型及Asc−/−小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDCs) 野生型及Asc−/−小鼠脾脏CD4+ T细胞和B细胞 Asc−/−、Nlrp3−/−、caspase-1−/−、Dock2−/−等基因缺陷小鼠
Asc−/−与野生型BMDCs在OVA、dextran、LY、zymosan A和polystyrene beads摄取上的差异 Asc−/−与野生型T/B细胞在SDF-1或SLC/BLC诱导下的趋化迁移及Rac激活和F-actin聚合 Asc−/−、Nlrp3−/−、caspase-1−/− BMDCs中DOCK2的mRNA和蛋白表达水平 Asc−/−与野生型BMDCs中Dock2 mRNA在DRB或actinomycin D处理后的半衰期 Asc−/−细胞中异位表达GFP-DOCK2对OVA摄取和SLC趋化迁移的恢复效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ASC是否影响树突状细胞的抗原摄取和提呈能力,并判断是否依赖炎症小体。
比较野生型、Asc−/−、Nlrp3−/−和caspase-1−/− BMDCs对荧光标记的zymosan A、polystyrene beads、OVA、dextran和LY的摄取;Asc−/− DCs与BSA特异性T细胞共培养检测增殖和细胞因子。
验证ASC是否细胞内在性地影响T细胞和B细胞的迁移能力。
分析Asc−/−小鼠脾和淋巴结细胞数量;过继转移野生型和Asc−/−淋巴细胞;构建竞争性骨髓嵌合体;体外transwell趋化实验检测SDF-1、SLC和BLC诱导的迁移。
验证ASC缺陷是否导致Rac激活和F-actin聚合受损。
BMDCs经OVA刺激后检测Rac活性和F-actin聚合;T/B细胞经SDF-1刺激后检测Rac激活和F-actin聚合。
鉴定ASC调控的靶基因及其调控层次(转录、mRNA稳定性或蛋白稳定性)。
微阵列分析Asc−/− BMDCs基因表达;qPCR和Western blot验证Dock2表达;Dock2启动子荧光素酶报告基因检测;DRB或actinomycin D阻断转录后检测Dock2 mRNA半衰期;蛋白酶体抑制剂MG-132处理检测DOCK2蛋白稳定性。
验证DOCK2是ASC下游的功能效应分子。
检测Dock2−/− BMDCs对dextran、OVA、LY、zymosan A和polystyrene beads的摄取;在Asc−/− BMDCs和T细胞中异位表达GFP-DOCK2,检测抗原摄取和趋化迁移恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 抗DOCK2抗体 | Millipore | 09-454 |
| 抗ASC抗体 | Enzo Life Sciences | AL177 | |
| 抗Fstl1抗体 | R&D | AF1738 | |
| 抗FABP4抗体 | Cell Signaling Technology | 2120 | |
| 抗Galanin抗体 | Abcam | ab99452 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| 基于HRP的增强化学发光试剂 | thermoscientific | 34095 | |
| 转染 | 核转染试剂盒 | Lonza | VPA-1009 |
| 逆转录病毒转导 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668-027 |
| T细胞增殖实验 | 牛血清白蛋白 | Sigma | 85040 |
| 细胞分选 | 小鼠CD4+ T细胞富集试剂盒 | Milteny AutoMACS | 130-095-248 |
| CD4+CD11c+树突状细胞分选试剂盒 | Milteny AutoMACS | 130-091-262 | |
| 胶原酶D | Roche | 11088874103 | |
| 细胞培养 | HL-1培养基 | Lonza | 7720 |
| 流式细胞术 | Permwash通透液 | Biolegend | 421002 |
| Alexa 488标记的鬼笔环肽 | BD Biosciences | -- | |
| 共聚焦显微镜 | 小鼠单克隆ASC抗体 | Millipore | 04-147 |
| Prolong gold-DAPI封片剂 | Invitrogen | P-36931 | |
| 荧光素酶报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| Amaxa树突状细胞核转染试剂盒 | Lonza | -- | |
| mRNA稳定性实验 | 5,6-二氯-1-β-呋喃核糖基苯并咪唑 | Sigma-Aldrich | D191 |
| 亚细胞组分分离 | NE-PER核质分离试剂 | Thermo Scientific | -- |
| 细胞因子检测 | Milliplex ELISA试剂盒 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 树突状细胞抗原摄取实验 | BMDCs来源、抗原类型(OVA、dextran、LY、zymosan A、polystyrene beads)、浓度、孵育时间(3小时)、温度(37°C)、检测方式(流式细胞术MFI) 阅读提示:Methods中抗原摄取部分及Figure 1e, 1f图注 |
| 淋巴细胞趋化实验 | 细胞类型(脾细胞)、趋化因子种类和浓度(SDF-1 500 ng/ml;SLC、BLC浓度)、transwell孔径(5 μm)、孵育时间(3小时) 阅读提示:Methods中Chemotaxis assay部分及Figure 2d, 2e, 6g图注 |
| Rac激活和肌动蛋白聚合检测 | 刺激物(OVA或SDF-1 500 ng/ml)、刺激时间、检测方法(Rac1 G-LISA或流式细胞术) 阅读提示:Methods中GTPase activity assays部分及Figure 3图注 |
| Dock2 mRNA稳定性实验 | 转录抑制剂(DRB 50 μM或actinomycin D 5 μg/ml)、处理时间、RT-qPCR检测Dock2和β-actin mRNA、归一化基因(GAPDH) 阅读提示:Methods中mRNA stability assay部分及Figure 5d图注 |
| 骨髓嵌合体实验 | 受体小鼠(CD45.1同源)、照射剂量(1200 Rads分次)、骨髓比例(1:1)、重建时间(6周) 阅读提示:Methods中Competitive reconstitution mixed chimeras部分及Figure 2c图注 |