基板细胞形态定量分析
明确基板形成过程中细胞形状变化的时间进程。
对E13.5、E14.5和E15.5小鼠表皮进行全胚免疫荧光染色和共聚焦z-stack成像,使用Edar抗体和Fgf20βGal报告基因标记基板细胞,三维分割基底细胞并测量细胞轴长、顶底面积比和细胞体积。
Mechanical forces across compartments coordinate cell shape and fate transitions to generate tissue architecture.
包含小鼠胚胎活体成像、激光烧蚀力学测量、遗传敲除、皮肤外植体培养、微加工细胞培养和3D顶点模型模拟等多层证据。
小鼠胚胎毛囊基板 Myh9条件性敲除小鼠(K14-Cre和Twist2-Cre) E13.5-E14.5小鼠皮肤外植体 原代表皮祖细胞(2D和3D培养)
Myh9-eKO(K14-Cre)和Myh9-dKO(Twist2-Cre)小鼠在E14.5和E15.5的基板内陷深度、Sox9阳性细胞数和密度 blebbistatin处理(10 nM,24小时)E13.5皮肤外植体对基板形成和Sox9区室化的影响 激光烧蚀测量成纤维细胞环和基板细胞的回缩方向与位移 GM6001(10 μM,48小时)处理E13.5外植体对基板出芽的影响 微加工基底和3D胶原水凝胶压缩(3小时或16小时)对表皮祖细胞Sox9表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确基板形成过程中细胞形状变化的时间进程。
对E13.5、E14.5和E15.5小鼠表皮进行全胚免疫荧光染色和共聚焦z-stack成像,使用Edar抗体和Fgf20βGal报告基因标记基板细胞,三维分割基底细胞并测量细胞轴长、顶底面积比和细胞体积。
观察基板形成过程中的细胞运动和组织变形模式。
对R26RmT/mG或R26R-RG小鼠完整胚胎进行活体共聚焦成像,使用PIV分析E14.5和E15.5基板及周围表皮的组织流动和散度。
量化基板、表皮和成纤维细胞环的机械张力分布。
在E14.5和E15.5胚胎上进行激光烧蚀,使用双光子激光(800 nm,75%功率)切割组织,通过PIV分析回缩位移和方向。
检验细胞自主性和外源性机械力在基板形态发生中的充分性。
构建多层3D顶点模型,包含基底表皮细胞、基板细胞、基底膜和多层基底上细胞,模拟内在润湿系数变化(模型1)或外源向心力(模型2),并与胚胎形态测量数据比较。
验证上皮和真皮肌球蛋白IIA在基板形成和Sox9区室化中的作用。
使用K14-Cre(Myh9-eKO)和Twist2-Cre(Myh9-dKO)条件性敲除Myh9,分析E14.5、E15.5和E16.5基板形态、Sox9表达和成纤维细胞环;用blebbistatin(10 nM)处理E13.5或E14.5皮肤外植体24小时。
检验机械限制是否足以促进Sox9表达和区室化。
将表皮祖细胞接种在微加工PDMS凹槽(直径100 μm,深度20 μm)或3D胶原水凝胶上,施加静态压缩(500 g硅圆柱,3或16小时),免疫染色检测Sox9。
研究基板形成过程中细胞分裂的时空模式及其调控机制。
使用Ki67染色和Histone2B-mCherry/membrane-EGFP活体成像检测E14.5和E15.5基板细胞分裂,免疫染色检测active YAP;用mitomycin C(1 μg/ml,3小时)处理E14.5外植体抑制分裂,用verteporfin(10 μM,6小时)抑制YAP。
探究基底膜软化及其蛋白水解机制在基板出芽中的作用。
使用原子力显微镜(AFM)测量E14.5和E15.5基板下方基底膜的弹性模量;免疫染色检测胶原IV、LN-511和LN-332;用广谱MMP抑制剂GM6001(10 μM,48小时)处理E13.5皮肤外植体;重新分析E14.5小鼠皮肤单细胞RNA-seq数据。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 山羊抗Edar抗体 | R&D Systems | AF745 |
| 兔抗磷酸化MLC2抗体 | Abcam | 2480 | |
| 兔抗波形蛋白抗体 | Abcam | 185030 | |
| 兔抗Sox9抗体 | Cell Signaling | 82630 | |
| 兔抗Sox2抗体 | Millipore Sigma | AB5603 | |
| 小鼠抗Twist2抗体 | Abcam | 50887 | |
| 小鼠抗Ki67抗体 | Cell Signaling | 9449 | |
| 兔抗活性YAP1抗体 | Abcam | 205270 | |
| 豚鼠抗角蛋白14抗体 | Progen | GP-CK14 | |
| 兔抗IV型胶原抗体 | Abcam | 6586 | |
| 兔抗层粘连蛋白332抗体 | -- | -- | |
| 大鼠抗层粘连蛋白α5抗体 | -- | 504 | |
| 鸡抗β-半乳糖苷酶抗体 | Abcam | 9361 | |
| Alexa647标记鬼笔环肽 | Invitrogen | -- | |
| 抗兔IgG Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11008 | |
| 抗兔IgG Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A10042 | |
| 抗小鼠IgG1 Alexa Fluor 546 | Invitrogen | A21123 | |
| 抗小鼠IgG2A Alexa Fluor 546 | Invitrogen | A21134 | |
| 抗大鼠IgG Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21247 | |
| 抗山羊IgG Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21467 | |
| 抗鸡IgG Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21449 | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Invitrogen | -- | |
| Elvanol封片剂 | Sigma | 81381 | |
| Dabco | Sigma | D27802 | |
| 甘油 | ThermoFisher | BP229-1 | |
| 外植体培养 | blebbistatin | Sigma | -- |
| GM6001 | Sigma | -- | |
| 细胞培养 | Dispase II | Sigma | D4693 |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| I型胶原 | Millipore | -- | |
| 纤连蛋白 | Millipore | -- | |
| 维替泊芬 | Stem Cell technologies | -- | |
| Y27632 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 小鼠重组VEGF | Miltenyi Biotec | -- | |
| 人重组FGF-2 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 活体成像 | CnT-PR培养基 | CELLnTEC Advanced Cell Systems | -- |
| 人重组EGF | Novus | NBP2-34952 | |
| AFM | MLCT探针 | Bruker Daltonics | -- |
| JPK NanoWizard 2原子力显微镜 | Bruker Nano | -- | |
| 共聚焦成像 | SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| LSM80共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 活体成像 | Andor Dragonfly 505转盘共聚焦显微镜 | Oxford Instruments | -- |
| 激光烧蚀 | Zeiss LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 遗传敲除小鼠 | Myh9 floxed小鼠来源(EM:02572)、K14-Cre和Twist2-Cre品系(JAX stock #008712)、胚胎期定义(阴道栓为E0) 阅读提示:Methods 'Mice'小节 |
| 皮肤外植体药物处理 | 药物浓度和时间:mitomycin C 1 μg/ml 3小时,blebbistatin 10 nM 24小时,GM6001 10 μM 48小时;外植体培养气液界面 阅读提示:Methods 'Skin explants'小节及对应图注 |
| 激光烧蚀 | 激光参数:800 nm,75%功率;成像间隔1秒,持续40秒,烧蚀前5秒开始;使用E14.5和E15.5胚胎 阅读提示:Methods 'Laser ablation'小节 |
| 微加工和压缩实验 | 微柱直径100 μm、高度20 μm;压缩使用500 g硅圆柱,3或16小时;细胞培养基为3C培养基 阅读提示:Methods 'Cell culture, microfabrication and hydrogels'小节 |
| AFM测量 | 使用16-μm厚冰冻切片,MLCT探针(弹簧常数0.07 N/m),力至3 nN,压痕深度500 nm,泊松比0.5 阅读提示:Methods 'AFM'小节 |