建立诱导型Gpx4敲除小鼠并评估表型
验证Gpx4在体内的必要性及敲除是否引起急性肾衰竭和死亡。
使用CreERT2;Gpx4fl/fl小鼠,他莫昔芬喂养诱导Gpx4敲除,监测生存、肾脏形态、蛋白尿和组织学。
Inactivation of the ferroptosis regulator Gpx4 triggers acute renal failure in mice.
包含诱导型Gpx4−/−小鼠、细胞模型、人细胞及肝缺血/再灌注模型,并有功能与机制验证
TAM诱导型Gpx4−/−小鼠胚胎成纤维细胞(Pfa1) TAM诱导型Gpx4−/−小鼠 人肾近端小管上皮细胞(HRPTEpiCs)和HK-2细胞 小鼠肝缺血/再灌注模型
TAM诱导Gpx4敲除:Pfa1细胞用1 μM TAM处理,72 h后检测细胞活力 Liproxstatin-1体内给药:10 mg kg−1,每日腹腔注射,从TAM第4天开始 肝缺血/再灌注模型:C57BL/6J小鼠,缺血90 min后再灌注24 h 细胞活力检测:AquaBluer或LDH释放,通常处理后72 h(FINs处理24 h) 脂质过氧化检测:BODIPY 581/591 C11染色,48 h后流式分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Gpx4在体内的必要性及敲除是否引起急性肾衰竭和死亡。
使用CreERT2;Gpx4fl/fl小鼠,他莫昔芬喂养诱导Gpx4敲除,监测生存、肾脏形态、蛋白尿和组织学。
明确Gpx4缺失诱导的细胞死亡是否依赖caspase、Rip1/Rip3或铁死亡通路。
在Pfa1细胞中TAM诱导Gpx4敲除,使用z-VAD-FMK、Nec1、Fer1、DFO、αToc等抑制剂,并敲低Rip1/Rip3。
表征Gpx4缺失诱导的铁死亡中的脂质氧化特征。
使用BODIPY 581/591 C11检测脂质过氧化,LC-MS/MS定量HETE释放,氧化脂质组学分析肾脏磷脂氢过氧化物。
发现具有体内活性的铁死亡抑制剂。
在TAM诱导的Gpx4−/− MEFs中筛选>40,000个小分子,鉴定螺喹喔啉胺衍生物Liproxstatin-1,并测试其特异性及ADME参数。
评估Liproxstatin-1对Gpx4−/−小鼠急性肾衰竭、肝缺血/再灌注损伤及人肾小管细胞铁死亡的作用。
Gpx4−/−小鼠每日腹腔注射Liproxstatin-1(10 mg kg−1),监测生存和TUNEL;肝缺血/再灌注模型检测AST/ALT和坏死面积;HRPTEpiCs和HK-2细胞中测试Liproxstatin-1对RSL3诱导铁死亡的 rescue。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| AquaBluer细胞活力检测染料 | MultiTarget Pharmaceuticals, LLC | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞毒性检测试剂盒(LDH) | Roche Diagnostics Deutschland | -- |
| Western blot | 抗Gpx4抗体(1B4) | -- | -- |
| 抗Gpx4抗体(ab125066) | Abcam | ab125066 | |
| 抗Rip3抗体(hGTX107574) | Genetex | hGTX107574 | |
| 抗Rip1抗体(3493) | Cell Signaling Technologies | 3493 | |
| 抗β-actin抗体(A5441) | Sigma | A5441 | |
| 免疫组化 | 兔抗磷酸化组蛋白H3抗体(9701) | Cell Signaling Technology | 9701 |
| 大鼠抗F4/80抗体(BM4007) | Acris Antibodies GmbH | BM4007 | |
| 兔抗Cleaved Caspase-3抗体(9664) | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 兔抗Gpx4抗体(3649-1) | Epitomics | 3649-1 | |
| 生物素化兔抗大鼠IgG(BA-4000) | Vector Laboratories | BA-4000 | |
| 生物素化山羊抗兔IgG(BA-1000) | Vector Laboratories | BA-1000 | |
| Vector ABC试剂盒 | Vector Laboratories | -- | |
| Vector DAB试剂盒 | Vector Laboratories | -- | |
| TUNEL检测 | ApopTag过氧化物酶原位凋亡检测试剂盒(S7100) | Serologicals, Millipore | S7100 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Invitrogen | -- |
| 线粒体靶向BODIPY 581/591 C11 | -- | -- | |
| 流式分析 | BD FACS Canto II流式细胞仪 | BD | -- |
| 透射电子显微镜 | Zeiss Libra 120 Plus透射电子显微镜 | Carl Zeiss NTS GmbH | -- |
| siRNA转染 | Hyperfect转染试剂 | Qiagen | -- |
| Ripk1 siRNA(GS19766) | Qiagen | GS19766 | |
| Ripk3 siRNA(GS56532) | Qiagen | GS56532 | |
| Scp2 siRNA(GS20280) | Qiagen | GS20280 | |
| On-Target Plus SMARTpool人GPX4 siRNA(L-011676-00-0005) | Thermo Scientific Dharmacon | L-011676-00-0005 | |
| LC-MS/MS | C18 Spherisorb ODS2色谱柱(5 μm,150 × 4.6 mm) | Waters | -- |
| Applied Biosystems 4000 Q-Trap质谱仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 氧化脂质组学 | QExactive轨道阱质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
| LXQ离子阱质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 血清生化检测 | Architect ci8200自动分析仪 | Abbott | -- |
| Dimension 1500 Vista分析仪 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 诱导型Gpx4敲除小鼠模型 | 小鼠品系(CreERT2;Gpx4fl/fl)、年龄(>8周)、性别(雌雄均有)、他莫昔芬给药方式(饮食)及持续时间;对照为CreERT2;Gpx4+/fl 阅读提示:Methods“Inducible disruption of Gpx4 in mice”及Figure 1c图注 |
| 细胞活力及铁死亡抑制剂处理 | 细胞系(Pfa1)、TAM浓度(1 μM)、接种密度(1,000 cells/well)、抑制剂浓度范围、检测时间(72 h)及检测方法(AquaBluer) 阅读提示:Methods“Cell viability assays and inhibitor studies”及Figure 1b、2a图注 |
| Liproxstatin-1体内给药 | 给药剂量(10 mg kg−1)、给药途径(i.p.)、给药频率(每日一次)、起始时间(TAM第4天)、溶剂(1% DMSO in PBS)及生存分析统计方法 阅读提示:Methods“Animal experiments (in vivo rescue experiment)”及Figure 7c图注 |
| 肝缺血/再灌注模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、年龄(8–10周)、缺血时间(90 min)、再灌注时间(24 h)、检测指标(AST/ALT、坏死面积) 阅读提示:Methods“Animal experiments (liver ischaemia/reperfusion)”及Figure 7e图注 |
| 脂质过氧化检测 | 探针(BODIPY 581/591 C11)、染色时间(1 h)、检测时间点(48 h)、流式细胞仪型号(BD FACS Canto II) 阅读提示:Methods“Staining for lipid peroxidation in cells by flow cytometry”及Figure 3a图注 |