胁迫下表型鉴定
验证WLG对干旱、盐和热胁迫耐受性的正调控作用
在苗期和生殖期对wlg突变体、WLG过表达株系及ZH11进行干旱、盐、热及复合胁迫处理,统计存活率、种子结实率和单株产量
WLG coordinates multi-stress tolerance in rice by regulating DST-dependent H2O2 homeostasis and stomatal aperture.
包含水稻突变体、过表达株系、原生质体、酵母双杂交、Co-IP、体外泛素化、体内降解、CRISPR双突变体遗传上位性分析及田间试验等多层级验证。
水稻ZH11及wlg突变体(wlg-1、wlg-2) WLG过表达株系(OE8、OE10)和WLGhap.A/hap.B互补株系 wlg dst-c双突变体及dst-c单突变体 水稻原生质体和本氏烟(N. benthamiana)瞬时表达体系
干旱、盐、热胁迫处理的具体时长和强度(如四叶期断水5–10天、120 mM NaCl 3–5天、45°C 2–4天) 生殖期胁迫处理条件(如50 mM NaCl、43°C每天4小时持续3–5天)及种子结实率和单株产量统计 H2DCFDA染色检测保卫细胞H2O2的浓度(50 μM)和染色时间(10分钟) 体内/体外泛素化及降解实验的体系组分(E1、E2、Ub、MG132)和孵育时间(30°C 2小时) 气孔导度和蒸腾速率测定时LI-6400XT叶室参数(光强500 μmol m−2 s−1、RH 60%、CO2 450 ppm)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证WLG对干旱、盐和热胁迫耐受性的正调控作用
在苗期和生殖期对wlg突变体、WLG过表达株系及ZH11进行干旱、盐、热及复合胁迫处理,统计存活率、种子结实率和单株产量
探究WLG对气孔导度、蒸腾速率、H2O2积累和钠离子含量的影响
利用LI-6400XT测定气孔导度和蒸腾速率,H2DCFDA染色检测保卫细胞H2O2,SEM观察气孔开度,测定地上部和根部Na+含量
验证WLG与DST的物理互作及WLG介导的DST泛素化和降解
酵母双杂交筛选、Co-IP、Pull-down、体内外泛素化实验、细胞-free降解实验、MG132抑制实验及质谱鉴定泛素化位点
确定WLG与DST在同一遗传通路中的上下游关系
构建wlg dst-c双突变体,比较wlg-1、dst-c、双突变体的Prx24表达、H2O2水平、气孔导度及胁迫存活率
比较WLGhap.A和WLGhap.B对DST降解及胁迫耐受性的差异
利用自然群体材料、互补株系、Split-LUC、体外泛素化和降解实验比较两种单倍型的功能
验证DST通过EAR基序转录抑制WLG表达
双荧光素酶实验、ChIP-qPCR、EMSA及EAR基序缺失突变体分析
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| H2O2检测 | H2DCFDA荧光探针 | -- | -- |
| 细胞壁消化 | 纤维素酶R10 | Yakult Pharmaceutical | -- |
| 离析酶R10 | Yakult Pharmaceutical | -- | |
| RT-qPCR | TRIpure RNA提取试剂 | Aidlab | -- |
| MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| SYBR Green预混液 | ABclonal | -- | |
| Western blot | 抗FLAG抗体 | Abclonal | AE005 |
| 抗GFP抗体 | Abclonal | AE012 | |
| 抗HA抗体 | Abclonal | AE105 | |
| 抗His抗体 | Abclonal | AE003 | |
| 抗MBP抗体 | Abclonal | AE016 | |
| 抗HptII抗体 | ZENBIO | 201071 | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3933 | |
| 抗植物肌动蛋白抗体 | Abbkine | ABL1050 | |
| 抗磷酸化丝氨酸/苏氨酸抗体 | ECM Biosciences | PP2551 | |
| Thermo Scientific Pierce ECL试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| 蛋白纯化 | GFP-Trp beads | Smart Lifesciences | -- |
| dextrin偶联 beads | Smart Lifesciences | -- | |
| Ni-NTA Beads 6FF | Smart Lifesciences | -- | |
| 镍琼脂糖 | Smart Lifesciences | -- | |
| 双荧光素酶 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1960 |
| SOD和POD活性测定 | SOD活性检测试剂盒 | Geruisi Biotechnology | G0102F |
| POD活性检测试剂盒 | Geruisi Biotechnology | G0108F | |
| 气孔导度测定 | LI-6400XT便携式光合作用测定系统 | Li-Cor | LI-6400XT |
| 共聚焦显微镜 | Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica | SP8 |
| 扫描电镜 | 日立Regulus 8100扫描电镜 | HITACHI | Regulus 8100 |
| 荧光成像 | Lumazone Pylon 2048B CCD成像系统 | Roper Scientific | Pylon 2048B |
| ChIP-qPCR | Bioruptor超声破碎仪 | Diagenode | -- |
| EMSA | Typhoon Trio成像仪 | Amersham Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 苗期胁迫处理 | 干旱、盐、热胁迫的具体处理时长和强度(如断水5–10天、120 mM NaCl 3–5天、45°C 2–4天) 阅读提示:Methods中“Stress performance evaluation”部分 |
| 生殖期胁迫处理 | 生殖期盐浓度(50 mM NaCl)、热胁迫温度和时间(43°C每天4小时持续3–5天)及干旱土壤含水量(约10%持续7天) 阅读提示:Methods中“Stress performance evaluation”部分 |
| 保卫细胞H2O2检测 | H2DCFDA染色浓度(50 μM)、孵育时间(10分钟)和温度(28°C黑暗) 阅读提示:Methods中“Detection of H2O2 production in guard cells”部分 |
| 气孔导度测定 | LI-6400XT叶室参数:光强500 μmol m−2 s−1,RH 60%,温度30°C,CO2 450 ppm,流速200 μmol s−1 阅读提示:Methods中“Measurement of stomatal conductance and transpiration rates”部分 |
| 泛素化与降解实验 | 体外泛素化反应组分浓度(E1 50 ng、E2 100 ng、Ub 5 μg)及孵育条件(30°C 2小时);MG132使用浓度(200 mM) 阅读提示:Methods中“In vitro ubiquitination assays”和“Semi-in vitro ubiquitination assay”部分 |