ERAD水平基因开关的设计与验证
验证条件降解决定子融合能否通过ERAD途径实现可调控的蛋白分泌。
将多种降解决定子(泛素标签、hPEST、NS3/NS4A、ecDHFR突变体等)融合到NanoLuc的N端或C端,在HEK-293细胞中检测基础降解效率和不同化学抑制剂对分泌的影响。
ERAD-level gene switches for on-demand protein secretion and rapidly controlled gene therapies.
包含体外细胞系实验、小鼠体内AAV递送模型、原代细胞及人血样本,并进行了功能验证和机制验证。
HEK-293T细胞系 多种哺乳动物细胞系(U251、KPC、U-87 MG、N2a、Hepa1-6) AAV2/8、AAV2/Myo、AAV2/9n注射的雄性小鼠模型 高血压小鼠模型
TMP剂量:0-4 mg/kg(口服灌胃),部分实验使用12 mg/kg/day AAV注射剂量:3*10^11 vg/只,静脉或鞘内注射 检测时间点:TMP刺激后30分钟至2小时追踪蛋白分泌动力学 细胞转染质粒量:用于优化TMP诱导的NanoLuc分泌 高血压模型建立:饮用水中持续给予1 mg/mL L-NAME一个月
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证条件降解决定子融合能否通过ERAD途径实现可调控的蛋白分泌。
将多种降解决定子(泛素标签、hPEST、NS3/NS4A、ecDHFR突变体等)融合到NanoLuc的N端或C端,在HEK-293细胞中检测基础降解效率和不同化学抑制剂对分泌的影响。
评估ecDHFRN18T,A19V作为降解决定子时TMP对蛋白分泌的调控性能。
在HEK-293及其他细胞系中,将ecDHFRN18T,A19V标记的NanoLuc或治疗蛋白转染,用不同浓度TMP处理,检测分泌水平、动力学、可逆性及对不同治疗蛋白的适用性。
验证ERAD基因开关在AAV递送后能否在小鼠体内实现TMP依赖的长期可逆调控。
将ecDHFRN18T,A19V标记的SEAP装入AAV2/8、AAV2/Myo、AAV2/9n载体,静脉或鞘内注射小鼠,监测TMP给药后SEAP表达水平及长期调控效果。
评估ERAD基因开关调控ssTNK和ssANP分泌在体外溶栓和体内降压中的效果。
构建Type-C TMP诱导型ssTNK和Type-N/C TMP诱导型ssANP表达载体,在细胞中检测分泌和活性;通过AAV2/Myo递送ssTNK或ssANP至小鼠,检测TMP诱导的蛋白分泌及溶栓或降压效果。
测试ERAD基因开关调控ssHwTx分泌在小鼠中提供按需镇痛的效果。
构建Type-N TMP诱导型ssHwTx表达载体,通过AAV2/9n鞘内注射至小鼠,口服TMP后评估热痛和机械痛行为及慢性炎症痛模型中的镇痛效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 载体构建 | 无缝克隆试剂盒 | Beyotime Biotechnology | D7010M |
| KOD One PCR预混液 | Toyobo Inc. | KMM-201 | |
| T4 DNA连接酶 | New England Biolabs | M0202L | |
| TIANprep质粒小提试剂盒 | TIANGEN Biotech | GDP103-03 | |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Thermo Fisher Scientific | 12100046 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141 | |
| 青霉素/链霉素溶液 | Beyotime Biotechnology | ST488 | |
| RPMI 1640培养基 | VivaCell Biosciences | C3010 | |
| 0.05%胰蛋白酶-EDTA | Sangon Biotech | A610629-0050 | |
| Countess II细胞计数仪 | Thermo Fisher Scientific | AMQAX1000 | |
| 荧光成像 | O.C.T.包埋剂 | Sakura Finetek Inc. | 4583 |
| DAPI染色液 | Beyotime Biotechnology | C1006 | |
| Nikon ECLIPSE Ts2荧光显微镜 | Nikon | -- | |
| Zeiss LSM 980 Airyscan共聚焦显微镜 | Carl Zeiss Microscopy | -- | |
| RT-PCR | HiScript II Q RT SuperMix for qPCR | Vazyme Biotech | R223-01 |
| ChamQ Universal SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech | Q711-02 | |
| Applied Biosystems QuantStudio 1实时PCR系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Western blot | 抗His标签(鼠单克隆) | Abclonal | AE003 |
| 抗PIGK(兔单克隆) | Abcam | ab201693 | |
| 抗α-微管蛋白(兔单克隆) | Abclonal | A6830 | |
| 抗GAPDH(鼠单克隆) | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | Beyotime Biotechnology | A0208 | |
| HRP标记山羊抗小鼠IgG | Beyotime Biotechnology | A0216 | |
| BeyoECL Moon试剂 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| Amersham Imager 600成像系统 | GE Healthcare | -- | |
| 蛋白定量 | Nano-Glo®荧光素酶检测系统 | Promega | N1120 |
| SEAP化学发光检测试剂盒 | Abcam | AB133077 | |
| 人IgG Fc ELISA试剂盒 | Immunology Consultants Laboratory Inc. | E-80G | |
| 生物活性GLP-1 ELISA试剂盒 | Merck Millipore | EGLP-35K | |
| 小鼠TSLP ELISA试剂盒 | Solarbio Life Sciences | SEKM-0139 | |
| Invitrogen人tPA ELISA试剂盒 | ThermoFisher Scientific | BMS258-2 | |
| 人促红细胞生成素ELISA试剂盒 | Abcam | ab274397 | |
| 溶栓实验 | Chrono-log比色皿 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 血压测量 | 尾套体积描记法血压计 | Beijing Zhongshi Dichuang Technology Development Co., Ltd | ZS-BPIV |
| 机械痛实验 | BIO-EVF4电子von Frey仪 | BIOSEB Inc. | -- |
| 慢性炎症痛实验 | 30G Hamilton注射器 | Hamilton | HA-80508-13 |
| 组织病理学分析 | Leica RM2235切片机 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TMP诱导型蛋白分泌细胞实验 | TMP浓度(0或40 μM)、转染质粒量、检测时间(48小时)、细胞系种类 阅读提示:Methods细胞培养与转染部分;Fig. 2a-c和图注 |
| AAV介导的小鼠体内实验 | AAV血清型(AAV2/8、AAV2/Myo、AAV2/9n)、注射剂量(3*10^11 vg)、注射途径(静脉或鞘内)、TMP给药剂量(0-4 mg/kg或12 mg/kg/day)、检测时间点 阅读提示:Methods动物实验部分;Fig. 3d-e和图注;Supplementary Data 4 |
| 高血压小鼠模型 | L-NAME浓度(1 mg/mL)、给药时间(一个月)、血压入选标准(SBP>125 mmHg) 阅读提示:Methods动物实验部分 |
| 疼痛行为学实验 | 热痛刺激温度(52°C)、机械痛von Frey测量方法、福尔马林浓度(5%)、注射体积(10 μL)、行为评分时间 阅读提示:Methods动物实验部分;Fig. 6图注 |
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源(ATCC或上海模式生物中心)、培养基成分(DMEM+10% FBS+1% PenStrep)、转染试剂(未明确说明)、质粒量 阅读提示:Methods细胞培养与转染部分;Supplementary Data 4 |