患者与小鼠甲状腺组织蛋白组分析
鉴定自身免疫性甲状腺炎中的差异蛋白表达及线粒体相关改变
比较自身免疫性甲状腺炎患者与健康对照甲状腺组织,以及NOD.H-2h4小鼠高碘组与正常组的甲状腺组织蛋白组,并进行功能富集分析
Mitophagy mitigates mitochondrial DNA-induced activation of cGAS-STING in autoimmune thyroiditis.
含患者甲状腺组织蛋白组与免疫组化、NOD.H-2h4小鼠模型、Pink1/Park2敲除小鼠、Nthy-ori3-1细胞体外实验及机制验证
Nthy-ori3-1甲状腺滤泡上皮细胞 NOD.H-2h4小鼠高碘诱导自身免疫性甲状腺炎模型 Pink1或Park2敲除NOD.H-2h4小鼠 人桥本甲状腺炎甲状腺组织及正常对照组织
高碘饮水浓度0.05%碘化钠,持续8周 C-176每日腹腔注射562.5 nmol,连续2周,溶剂为DMSO NaI处理Nthy-ori3-1细胞浓度40 mM,处理24 h或72 h 人甲状腺样本:63例桥本甲状腺炎与40例正常对照 Pink1/Park2敲除小鼠回交至NOD.H-2h4背景超过10代
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定自身免疫性甲状腺炎中的差异蛋白表达及线粒体相关改变
比较自身免疫性甲状腺炎患者与健康对照甲状腺组织,以及NOD.H-2h4小鼠高碘组与正常组的甲状腺组织蛋白组,并进行功能富集分析
观察线粒体损伤及含线粒体自噬体水平
采用透射电镜观察患者与小鼠甲状腺组织,计数损伤线粒体及含自噬泡的线粒体
验证自身免疫性甲状腺炎中PINK1-Parkin依赖性线粒体自噬是否被激活
Western blot检测甲状腺组织PINK1、Parkin、TOM20、TIM23、FUNDC1、NIX表达,并以过量碘处理甲状腺滤泡上皮细胞观察线粒体自噬
评估cGAS-STING与线粒体自噬标志物在临床样本中的表达及与疾病进展的关系
对STING、p-TBK1、p-IRF3、PINK1、Parkin进行免疫组化染色评分,并与临床指标行相关性分析
确定PINK1/Parkin介导的线粒体自噬对自身免疫性甲状腺炎的保护作用
比较WT、Pink1−/−与Park2−/− ISAT小鼠的线粒体蛋白水平、超微结构、淋巴细胞浸润及血清自身抗体
阐明线粒体功能障碍诱导线粒体自噬的上游信号与直接底物
检测NaI及DIDS处理下ATM/CHK2磷酸化,免疫共沉淀与PLA验证CHK2-TAX1BP1互作,体外激酶实验与质谱鉴定TAX1BP1 Ser722磷酸化,并用WT、S722A、S722D进行功能回补
确定线粒体自噬是否抑制mtDNA释放及下游cGAS-STING激活
PicoGreen与MitoTracker共定位、胞质mtDNA qPCR、BAX/BAK及VDAC/mPTP抑制剂处理,检测STING-TBK1-IRF3磷酸化及血清IFNβ1、IL-6
检验药理抑制STING能否减缓自身免疫性甲状腺炎进展
在Pink1−/−与Park2−/− ISAT小鼠中给予C-176,检测TBK1/IRF3磷酸化、血清IFNβ1与IL-6、甲状腺炎症及自身抗体
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗PINK1抗体 | Cell Signaling Technology | 6946 |
| 抗Parkin抗体 | Cell Signaling Technology | 4211 | |
| 抗TOM20抗体 | Cell Signaling Technology | 42406 | |
| 抗磷酸化ATM Ser1981抗体 | Cell Signaling Technology | 13050 | |
| 抗ATM抗体 | Cell Signaling Technology | 2873 | |
| 抗磷酸化CHK2 Thr68抗体 | Cell Signaling Technology | 2661 | |
| 抗CHK2抗体 | Cell Signaling Technology | 3440 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抗磷酸化TBK1 Ser172抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| 抗TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3504 | |
| 抗磷酸化IRF3 Ser396抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| 抗IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| 抗NIX抗体 | Cell Signaling Technology | 12396 | |
| 抗TAX1BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 5105 | |
| 抗NDP52抗体 | Cell Signaling Technology | 60732 | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3933 | |
| 抗α-Tubulin抗体 | Cell Signaling Technology | 2144 | |
| 抗OPTN抗体 | Proteintech Technology | 10837-1-AP | |
| 抗BAX抗体 | Proteintech Technology | 50599-2-lg | |
| 抗BAK抗体 | Proteintech Technology | 29552-1-AP | |
| 抗TIM23抗体 | NOVUS Biologicals | NBP2-13432 | |
| 抗FUNDC1抗体 | NOVUS Biologicals | NBP1-56430 | |
| 抗p62抗体 | Sigma | P0067 | |
| 抗Parkin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32282 | |
| 抗Flag标签抗体 | Shanghai Genomics Technology | SG4110-16 | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G琼脂糖 | Santa Cruz | -- |
| 磷酸化抗体纯化 | SulfoLink偶联树脂 | Thermo Scientific | -- |
| 药物处理 | CHK2抑制剂II | Sigma | -- |
| BAX抑制剂BAI1 | MedChemExpress | -- | |
| VDAC抑制剂VBIT-4 | MedChemExpress | -- | |
| 环孢素A | MedChemExpress | -- | |
| 4,4'-二异硫氰酸二苯乙烯-2,2'-二磺酸 | MedChemExpress | -- | |
| 动物实验 | C-176 | MedChemExpress | -- |
| 胞质提取 | 洋地黄皂苷 | MedChemExpress | -- |
| mtDNA提取 | QIAQuick核苷酸去除柱 | QIAGEN | -- |
| qPCR | TB Green预混Ex Taq II | TaKaRa | RR820A |
| QuantStudio 6 Flex实时PCR系统 | Roche | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 增强化学发光底物 | Tanon | 180-5001 | |
| MicroChemi 4.2成像系统 | DNR | -- | |
| 体外激酶实验 | His-CHK2 | Thermo Fisher Scientific | PV3367 |
| 透射电镜 | Poly/bed 812环氧树脂 | Polysciences | 02597-50 |
| JEOL JEM1210透射电子显微镜 | JEOL | -- | |
| 荧光显微成像 | Nikon A1RHD25倒置荧光显微镜 | Nikon | -- |
| mtDNA与线粒体染色 | MitoTracker Red | Yeasen Biotechnology | -- |
| PicoGreen | Yeasen Biotechnology | -- | |
| 邻位连接 assay | NaveniFlex Cell MR Atto647N | Navinci | -- |
| 蛋白组学 | Orbitrap Exploris 480质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
| EASY-nLC 1200超高效液相色谱系统 | ThermoFisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 高碘诱导自身免疫性甲状腺炎小鼠模型 | 高碘饮水浓度0.05%碘化钠、处理8周、小鼠4–5周龄、每组样本量与随机分组 阅读提示:Methods 中 Cell lines and mice 小节;Fig. 1d 与 Fig. 3 图注 |
| Pink1/Park2敲除小鼠遗传背景 | 敲除品系回交至NOD.H-2h4背景超过10代、每代PCR基因分型 阅读提示:Methods 中 Cell lines and mice 小节 |
| C-176体内给药 | 剂量562.5 nmol/日、溶剂DMSO 200 μL、连续2周、给药途径为每日注射 阅读提示:Methods 中 Cell lines and mice 小节;Fig. 6a 图注 |
| Nthy-ori3-1细胞NaI处理 | NaI浓度40 mM、处理时间24 h或72 h、培养基为RPMI-1640含10% FBS 阅读提示:Methods 中 Cell lines and mice 与 Detection of mtDNA in cytosolic extracts 小节;Fig. 4 图注 |
| 人甲状腺样本免疫组化 | 桥本甲状腺炎63例与正常对照40例、取材2019–2023年、染色评分由两名盲法评估者独立完成 阅读提示:Methods 中 Human thyroid samples 与 Immunohistochemical staining 小节 |
| mtDNA泄漏通道抑制剂实验 | BAI1 5 μM、VBIT-4 5 μM、CsA 2.5 μM的处理条件 阅读提示:Results 中 Mitophagy suppresses mtDNA release-induced cGAS-STING activation 小节及 Supplementary Fig. 9 |