ASB2在成年肝脏ILC1中高表达
确定ASB2在肝脏ILC1中的表达特征。
重新分析已发表scRNA-seq数据(GSE202475)比较胎儿和成年肝脏group 1 ILC;RT-qPCR检测Asb2α/Asb2β亚型;构建Asb2EGFP报告小鼠并用流式细胞术检测ASB2表达。
ASB2 inhibits lipid accumulation to promote ILC1 homeostatic fitness and anti-tumor immunity in the mouse liver.
包含scRNA-seq再分析、条件敲除小鼠、体外细胞实验、蛋白质组/转录组、Co-IP及肝转移模型功能验证
Ncr1Cre/+Asb2fl/fl条件敲除小鼠 MC38-luc结直肠癌肝转移小鼠模型 分选的小鼠肝脏ILC1细胞
Ncr1Cre/+Asb2fl/fl小鼠中Asb2在肝脏ILC1和cNK细胞中的条件性缺失验证 ASB2缺陷ILC1的存活率(Annexin V−7-AAD−)和活性caspase 3表达 ASB2缺陷ILC1的脂质含量(BODIPY 493/503)及DGAT1表达 A922500(3 μM,24 h)对ASB2缺陷ILC1存活的影响 MC38-luc细胞脾内注射后肝脏肿瘤负荷和生存期
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ASB2在肝脏ILC1中的表达特征。
重新分析已发表scRNA-seq数据(GSE202475)比较胎儿和成年肝脏group 1 ILC;RT-qPCR检测Asb2α/Asb2β亚型;构建Asb2EGFP报告小鼠并用流式细胞术检测ASB2表达。
验证ASB2对肝脏ILC1维持的必要性。
使用Ncr1Cre/+Asb2fl/fl、Ncr1CreERT2/+Asb2fl/fl和VavCre/+Asb2fl/fl小鼠,通过流式细胞术检测胎儿、新生儿和成年肝脏ILC1及cNK细胞频率和绝对数。
探究ASB2缺失减少ILC1数量的细胞机制。
检测Ki67增殖标志、体外培养后存活率(Annexin V−7-AAD−)和活性caspase 3表达。
揭示ASB2调控的下游代谢机制。
对分选肝脏ILC1进行bulk RNA-seq和label-free蛋白质组学;BODIPY 493/503检测中性脂质;检测CD36表达和脂肪酸摄取;Co-IP验证ASB2α与DGAT1相互作用。
验证脂质过度积累是否因果性损害ILC1存活。
体外用PA或SA处理ILC1诱导脂质积累,并用DGAT1抑制剂A922500处理,检测存活率。
评估ASB2在ILC1介导的抗肿瘤免疫中的作用。
脾内注射MC38-luc细胞建立肝转移模型,检测肿瘤负荷、生存期、ILC1数量/存活/脂质含量/受体表达/颗粒酶表达。
测试药理学抑制DGAT1对肝转移和ILC1功能的影响。
MC38-luc荷瘤C57BL/6小鼠腹腔注射A922500或DMSO对照,检测肿瘤负荷、生存期、ILC1频率/存活/抑制性受体表达;并在NCG小鼠中测试A922500直接效应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | Percoll密度梯度离心液 | Cytiva | 17089109 |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | Solarbio | R1010 |
| 肺组织消化 | I型胶原酶 | Sigma | C0130 |
| 肠组织消化 | IV型胶原酶 | Sigma | C5138 |
| DNase I | Sigma | D5025 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | VivaCell | C3010-0500 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10091-148 | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | 21985-023 | |
| 小鼠白细胞介素-15 | Peprotech | 210-15-10 μg | |
| 药物处理 | 棕榈酸 | Shanghai Siduorui Biotechnology | PA01 |
| 硬脂酸 | Shanghai Siduorui Biotechnology | SA01 | |
| A922500 | MedChemExpress | HY-10038 | |
| 流式分析 | BODIPY 493/503 | Thermo Fisher | D3922 |
| 脂质摄取检测 | BODIPY 500/510 C1, C12 | ThermoFisher | D3823 |
| BODIPY FL C16 | ThermoFisher | D3821 | |
| 胆固醇检测 | NBD胆固醇 | ThermoFisher | N1148 |
| 流式分析 | 流式细胞仪(X20, LSRFortessa) | BD Biosciences | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | ThermoFisher | 15596018 |
| RT-qPCR | M-MLV逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | 2382833 |
| SYBR Green Pro Taq HS预混液 | Accurate Biology | AG11702 | |
| LightCycler 96实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| Co-IP | 完全蛋白酶抑制剂混合物 | MedChemExpress | HY-K0010 |
| Flag-M2单克隆抗体偶联琼脂糖珠 | Sigma | A2220 | |
| 体内治疗 | 他莫昔芬 | MedChemExpress | 10540-29-1 |
| 玉米油 | Solarbio | C7030 | |
| 二甲基亚砜 | Solarbio | D8371 | |
| 流式分析 | 固定/透化试剂盒 | Invitrogen | 00-5523-00 |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | MilliporeSigma | P1585 | |
| 离子霉素 | MilliporeSigma | I0634-5 mg | |
| 莫能菌素 | MilliporeSigma | M5273-500mg |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 条件敲除小鼠模型 | Ncr1Cre/+Asb2fl/fl小鼠的遗传背景、敲除效率验证(mRNA水平)、年龄(6–14周)和性别匹配 阅读提示:Methods 'Mice and cell lines'及图2、补充图4 |
| 他莫昔芬诱导敲除 | 他莫昔芬剂量(2 mg/只,i.p.)、溶剂(玉米油200 μL)、注射天数(5天)和分析时间(21天后) 阅读提示:Methods 'In vivo treatment'及图2d,e |
| 体外ILC1培养与处理 | 培养基成分(RPMI 1640+10% FBS+青霉素/链霉素+50 μM β-巯基乙醇+10 ng/mL IL-15)、PA(100 μM)、SA(50 μM)、A922500(3 μM)处理时间24 h 阅读提示:Methods 'In vitro cell culture'及图4 |
| 肝转移模型 | MC38-luc细胞脾内注射数量(2×10^5或5×10^5)、注射后4分钟脾切除、检测时间点(第8、10、14、18、21天) 阅读提示:Methods 'Colorectal cancer liver metastases model and A922500 treatment'及图5、图6 |
| A922500体内治疗 | A922500剂量(10 mg/kg,250 μg)、给药途径(i.p.)、给药频率(每3天一次)、起始时间(第3天)和总次数(5-6次) 阅读提示:Methods 'Colorectal cancer liver metastases model and A922500 treatment'及图6b |
| 脂质含量检测 | BODIPY 493/503浓度(0.5 μg/mL或500 ng/mL)、染色温度和时间(37°C 15-20 min)、饥饿处理(无血清PBS 1 h) 阅读提示:Methods 'Lipid quantification'及图3e,f |