mRNA合成与体外验证
验证体外转录mRNA能否在PDAC细胞和CAF中表达并分泌功能性细胞因子。
合成经m¹ΨTP修饰和纤维素纯化的细胞因子mRNA,转染KPC肿瘤细胞和CAF,检测分泌细胞因子水平。
Multiplexed cytokine and antigen mRNA administration generates durable anti-tumor immunity against pancreatic cancer.
包含体外细胞实验、多种移植瘤模型、自体GEMM模型及NK/CD8清除功能验证
KPC1原位移植PDAC小鼠模型 KPCY 2838c3原位移植PDAC小鼠模型 KPC GEMM自发PDAC小鼠模型 KPC1皮下移植PDAC小鼠模型
瘤内注射剂量:游离mRNA混合物中每种mRNA 10 µg,总剂量50-80 µg;对照Scramble mRNA 50-80 µg 给药方案:每3天或每周两次瘤内注射,或每周一次静脉注射NP包裹mRNA,持续2周 NK和CD8+ T细胞清除:anti-NK1.1抗体(PK136)250 µg、anti-CD8抗体(2.43)200 µg,每周两次腹腔注射 动物模型:8-12周龄雌性C57BL/6小鼠,KPC1(4×10^4)或KPCY 2838c3(1×10^5)细胞原位接种;KPC GEMM雌雄均可,3-6月龄 检测终点:流式细胞术分析免疫细胞频率和功能,超声成像评估肿瘤体积,Kaplan-Meier生存分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证体外转录mRNA能否在PDAC细胞和CAF中表达并分泌功能性细胞因子。
合成经m¹ΨTP修饰和纤维素纯化的细胞因子mRNA,转染KPC肿瘤细胞和CAF,检测分泌细胞因子水平。
评估瘤内注射细胞因子mRNA混合物在PDAC肿瘤中的局部表达、全身暴露和耐受性。
KPC1原位移植瘤小鼠接受单次瘤内注射6种细胞因子mRNA混合物或Scramble mRNA,检测肿瘤、肝脏和血液中细胞因子水平及体重变化。
确定促进NK和CD8+ T细胞迁移、IFNγ产生及肿瘤细胞MHC-I表达所需的细胞因子组合。
用单种或组合细胞因子mRNA转染KPC细胞,进行Transwell迁移实验、NK/CD8+ T细胞共培养和MHC-I流式检测。
评估重复瘤内注射细胞因子mRNA混合物对PDAC TME免疫细胞组成、肿瘤生长和纤维化的影响。
KPC1原位移植瘤小鼠每3天接受瘤内注射Scramble、单种细胞因子mRNA或5/6种细胞因子mRNA混合物,12天后分析肿瘤免疫细胞、组织学和肿瘤体积。
测试单次瘤内注射5种细胞因子mRNA混合物在KPCY 2838c3“热”PDAC模型中的免疫激活和生存获益。
KPCY 2838c3原位移植瘤小鼠接受单次瘤内注射5C mRNA或Scramble mRNA,72小时分析免疫细胞,14天评估肿瘤生长,并监测生存。
研究联合肿瘤相关抗原mRNA是否增强细胞因子mRNA混合物的抗原提呈和T细胞抗肿瘤免疫。
KPC1原位移植瘤小鼠每3天接受瘤内注射Scramble、3A、5C或5C+3A mRNA混合物,12天后分析免疫细胞、肿瘤坏死和生长。
评估细胞因子和抗原mRNA联合治疗对肿瘤引流淋巴结中DC抗原提呈和T细胞启动的影响。
KPC1皮下移植瘤小鼠每3天接受瘤内注射Scramble、3A、5C或5C+3A mRNA混合物,12天后分析tdLN重量、免疫细胞频率和功能。
确定单次瘤内注射5C+3A mRNA混合物是否足以产生NK和CD8+ T细胞依赖的抗肿瘤效果和生存获益。
KPC1原位移植瘤小鼠接受单次瘤内注射5C+3A mRNA或Scramble mRNA,部分小鼠同时接受NK1.1或CD8清除抗体,监测肿瘤生长和生存。
评估静脉注射NP包裹的细胞因子/抗原mRNA在PDAC移植瘤和GEMM模型中的生物分布、表达、免疫激活和抗肿瘤效果。
KPC1原位移植瘤和KPC GEMM小鼠接受每周一次静脉注射NP包裹的Scramble、5C、3A或5C+3A mRNA,分析肿瘤细胞因子/抗原表达、免疫细胞、肿瘤生长和生存。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| mRNA合成 | T7 RNA聚合酶 | New England Biolabs | E2050L |
| N1-甲基假尿苷-5′-三磷酸 | TriLink | N-1081-1 | |
| mScript™ mRNA生产系统 | CellScript | IMMY240625 | |
| mRNA纯化 | 纤维素柱层析 | Messenger Bio | EMBARK100 |
| mRNA转染 | Lipofectamine MessengerMax试剂 | ThermoFisher | LMRNA001 |
| NP合成 | D-Lin-MC3-DMA | Cayman Chemical | 25325 |
| 二硬脂酰磷脂酰胆碱 | Avanti | 850365C | |
| DMG-PEG | Avanti | 880151P | |
| NP表征 | Quant-it RiboGreen | Invitrogen | R11490 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11995073 |
| 胎牛血清 | Sigma | F0926-500ML | |
| 青霉素-链霉素 | Corning | 30-002-Cl | |
| 胶原蛋白 | Advanced BioMatrix | 5005 | |
| 药物处理 | 曲美替尼 | Selleck chemicals | S2673 |
| 帕博西尼 | Selleck chemicals | S1116 | |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | 354230 |
| 乳酸林格氏液 | ThermoFisher | J67572.AP | |
| NK细胞清除 | 抗NK1.1抗体(PK136) | BioXcell | BE0036 |
| CD8+ T细胞清除 | 抗CD8抗体(2.43) | BioXcell | BE0061 |
| 细胞因子检测 | 小鼠细胞因子/趋化因子44重Discovery检测芯片 | Eve Technologies | MD44 |
| 小鼠细胞因子/趋化因子36重Discovery检测芯片 | Eve Technologies | MD36 | |
| 小鼠IL-18单重Discovery检测芯片 | Eve Technologies | MDIL18 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | 5000002 |
| NK细胞分离 | NK细胞分离试剂盒II | Miltenyi Biotec | 130-115-818 |
| CD8+ T细胞分离 | CD8a+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 |
| 流式细胞术 | 抗H-2Kᵇ抗体 | eBioscience | 12-5958-80 |
| 抗IFNAR阻断抗体 | BioXcell | BE0241 | |
| 免疫组化 | 抗CD3抗体 | Abcam | ab5690 |
| 抗CD8抗体 | eBioscience | 4SM15 | |
| 抗NKp46抗体 | R&D Systems | AF2225 | |
| 抗颗粒酶B抗体 | Abcam | ab4059 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| 抗PDGFRβ抗体 | Cell Signaling Technology | 3169 | |
| 抗FAP抗体 | Abcam | ab53066 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 抗Cleaved Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗MUC-1抗体 | Invitrogen | MA5-11202 | |
| 抗间皮素抗体 | LS Bio | LS-C407883 | |
| 抗PSMA抗体 | Abcam | ab314142 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| mRNA合成与纯化 | IVT反应中m¹ΨTP替代UTP的比例、加帽试剂、纤维素纯化步骤;文中未明确说明m¹ΨTP与UTP的具体比例 阅读提示:Methods 'mRNA synthesis and purification' |
| 脂质纳米颗粒制备 | 脂质摩尔比(MC3 48%、DSPC 10%、胆固醇37%、DMG-PEG 5%)、微流控流速(内相12 µL/min,外相72 µL/min)、mRNA浓度20-200 µg/mL 阅读提示:Methods 'mRNA lipid nanoparticle (NP) generation and characterization' |
| 细胞培养与转染 | KPC1和KPCY 2838c3细胞来源及培养条件(DMEM+10% FBS+1% P/S,37°C,5% CO2);转染试剂Lipofectamine MessengerMax用量;文中未明确说明转染试剂与mRNA的比例 阅读提示:Methods 'Cell lines and compounds'和'mRNA transfection in vitro' |
| 原位移植瘤模型建立 | 细胞接种数量(KPC1 4×10^4,KPCY 2838c3 1×10^5)、Matrigel比例(1:1)、注射体积(25 µl)、小鼠品系和性别(雌性C57BL/6,8-12周龄) 阅读提示:Methods 'Pancreatic orthotopic transplant models' |
| 瘤内注射给药 | mRNA剂量(单种10 µg,混合物总50-80 µg)、注射体积(50 µl)、稀释液(Ringer’s lactate)、给药频率(每3天或每周两次) 阅读提示:Methods 'Intratumoral and systemic mRNA dosing in mice' |
| 静脉注射NP给药 | NP包裹mRNA剂量(每种约10 µg)、注射体积(200 µl)、给药频率(每周一次,共2周) 阅读提示:Methods 'Intratumoral and systemic mRNA dosing in mice' |
| NK和CD8+ T细胞清除 | 抗体克隆号(PK136、2.43)、剂量(250 µg、200 µg)、给药途径(腹腔注射)、频率(每周两次) 阅读提示:Methods 'NK and CD8 depletion in vivo' |
| 流式细胞术分析 | 抗体克隆号和稀释比例、刺激条件(PMA 20 ng/ml、ionomycin 1 µg/ml、monensin 2 µM,4小时)、固定破膜试剂 阅读提示:Methods 'Flow cytometry analysis' |
| 细胞因子芯片检测 | 样本类型(肿瘤组织、肝脏、血液)、样本处理(机械解离、BCA定量)、芯片型号(MD44、MD36、MDIL18) 阅读提示:Methods 'Cytokine array' |
| 超声成像 | 设备型号(Vevo 3100)、探头型号(MS250 13-24 MHz)、肿瘤体积定量软件 阅读提示:Methods 'Ultrasound imaging' |