LTBP4在HF患者和TAC小鼠中的表达验证
验证LTBP4是否在心力衰竭中表达升高并定位至心肌细胞。
检测HFrEF患者左心室LTBP4蛋白、血浆LTBP4水平,TAC小鼠左心室LTBP4 mRNA和蛋白,免疫荧光共定位LTBP4与CTNT,并分析snRNA-seq数据集。
LTBP4 deficiency inhibits NLRP3 inflammasome activation in cardiomyocytes and attenuates heart failure in male mice.
含患者样本、snRNA-seq、多种细胞模型及心肌细胞特异性敲除小鼠TAC模型,并有功能与机制验证
HFrEF患者左心室组织和血浆样本 心肌细胞特异性Ltbp4诱导性敲除小鼠(Ltbp4cko)及Ltbp4fl/fl对照小鼠TAC模型 新生大鼠心肌细胞(NRCMs)和新生小鼠心肌细胞(NMCMs) H9C2、HEK293T和U2OS细胞系
TAC模型:雄性小鼠10–12周龄,TAC后14天和28天行超声心动图,28天取材,每组n=6 细胞处理:NRCMs用AngII 0、1、10、50、100 μM处理,H2O2 200 μM处理6 h,每组n=4–6生物学重复 心肌细胞特异性敲除:他莫昔芬30 mg/kg隔日腹腔注射共4次 SP1抑制:Plicamycin 0.4 mg/kg隔日腹腔注射共6次(TAC前2次、TAC后4次) NLRP3抑制:MCC950 10 μM处理,每组n=4–6生物学重复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LTBP4是否在心力衰竭中表达升高并定位至心肌细胞。
检测HFrEF患者左心室LTBP4蛋白、血浆LTBP4水平,TAC小鼠左心室LTBP4 mRNA和蛋白,免疫荧光共定位LTBP4与CTNT,并分析snRNA-seq数据集。
探究TAC和AngII诱导LTBP4表达升高的转录机制。
JASPAR数据库motif分析;NRCMs中转染Sp1 siRNA并给予AngII;TAC小鼠给予SP1抑制剂Plicamycin;检测LTBP4和SP1表达。
验证心肌细胞LTBP4缺失是否减轻心功能障碍和纤维化。
构建Myh6-CreERT2-Ltbp4fl/fl(Ltbp4cko)小鼠,他莫昔芬诱导敲除,10–12周龄雄性小鼠行TAC,超声心动图评估心功能,Masson、Picrosirius red和POSTN免疫荧光评估纤维化,qRT-PCR检测Col1a1和Col3a1。
探究LTBP4缺失保护心脏功能的潜在机制。
对TAC后Ltbp4cko和Ltbp4fl/fl小鼠心脏行RNA-seq和GO分析;ELISA检测血浆IL-1β;qRT-PCR检测Casp1、Il-1β、Il-18、Nlrp3;Western blot检测NLRP3、Cleaved-CASP1、COL1A1、α-SMA;CD45免疫荧光检测炎症细胞浸润。
验证LTBP4对心肌细胞NLRP3通路和细胞死亡的特异性作用。
NRCMs和NRCFs给予AngII或PE;NRCMs转染Ad-shLtbp4或Ad-LTBP4;H9C2细胞给予H2O2;Calcein-AM染色和LDH释放检测细胞死亡;CHX检测NLRP3蛋白稳定性;MCC950抑制NLRP3。
确定LTBP4通过细胞内形式还是分泌形式激活NLRP3通路。
构建信号肽缺失的LTBP4腺病毒(Ad-LTBP4Δ2-27aa),在NRCMs中比较其与全长LTBP4对NLRP3、Cleaved-CASP1和H2O2诱导细胞死亡的影响。
阐明LTBP4调控NLRP3炎症小体激活的分子机制。
BioGRID数据库分析;co-IP验证LTBP4与NLRP3、NEK7、DYNLT1相互作用;GST pull-down验证LTBP4与NLRP3直接结合;免疫荧光共定位;免疫共沉淀-质谱鉴定LTBP4相互作用蛋白;LTBP4截短体定位NEK7结合区域。
验证LTBP4是否促进NLRP3-NEK7结合和NLRP3炎症小体组装。
HEK293T细胞共转染LTBP4-FLAG、NLRP3-MYC和NEK7-HA行co-IP;U2OS细胞免疫荧光检测NLRP3-NEK7共定位;Ltbp4cko小鼠TAC后心脏co-IP检测NLRP3-NEK7相互作用;NRCMs中检测LTBP4过表达对NLRP3向MTOC易位及NLRP3-Pro-CASP1相互作用的影响;Ad-LTBP4Δ3(缺失1574-1624aa)功能验证。
在临床样本中验证LTBP4与NLRP3炎症小体的关系。
HFrEF患者心脏组织免疫荧光检测LTBP4和NLRP3共定位;血浆LTBP4与IL-1β相关性分析;GEO数据集GSE84796中LTBP4与NLRP3表达相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | Life technologies | 12800082 |
| 胎牛血清 | Gbico | 10099-141 | |
| II型胶原酶 | Life technologies | 17101015 | |
| 牛血清白蛋白 | Yeasen | 36101ES25 | |
| 0.25%胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25200072 | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | MCE | HY-13757A |
| 药物处理 | 血管紧张素II | MCE | HY-13948 |
| 尼日利亚菌素 | MCE | HY-127019 | |
| 过氧化氢 | Sigma-Aldrich | 88597 | |
| MCC950 | MCE | HY-12815 | |
| Ciliobrevin A | MCE | HY-100790 | |
| 普卡霉素 | -- | -- | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | MCE | HY-K0010 |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma-Aldrich | D9542-1MG |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T9284 | |
| 驴血清 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 017-000-121 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Vazyme Biotech | R401-01 |
| RT-qPCR | ReverTra Ace qPCR逆转录试剂盒 | Toyobo | FSQ-101 |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech | Q711 | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Gbico | L3000075 |
| Opti-MEM培养基 | Gbico | 31985088 | |
| jetPEI转染试剂 | Polyplus-transfection SA | 24765-1 | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G PLUS琼脂糖珠 | Santacruz | SC-2003 |
| 抗DYKDDDDK G1亲和树脂 | GenScript | L00432 | |
| 抗HA Nanoab琼脂糖珠 | Everylab | IP07 | |
| 抗MYC Nanoab琼脂糖珠 | Everylab | IP08 | |
| Western blot | 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling | 15101T |
| 免疫共沉淀 | 抗NEK7抗体 | Abcam | ab133514 |
| 免疫荧光 | 抗心肌肌钙蛋白T抗体 | Abcam | ab8295 |
| 抗LTBP4抗体 | Abmart | PHY6049 | |
| 抗NLRP3抗体 | Proteintech | 68102-1-Ig | |
| 抗POSTN抗体 | Proteintech | 19899-1-AP | |
| 抗FLAG抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| 抗HA抗体 | huaxingbio | HX1820 | |
| 抗CMYC抗体 | ACE Biotechnology | BP0001-01 | |
| FLAG-488 | GenScript | A01809 | |
| Alexa Fluor 488标记抗小鼠 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 715-545-150 | |
| Alexa Fluor 488标记抗兔 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-545-152 | |
| Alexa Fluor 594标记抗小鼠 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 715-585-150 | |
| Alexa Fluor 594标记抗兔 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-585-152 | |
| Alexa Fluor 647标记抗兔 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-605-152 | |
| 组织染色 | Masson三色染色试剂盒 | Yeasen | 60532ES74 |
| 天狼星红染色试剂盒 | Solarbio | G1472 | |
| 细胞活力检测 | 钙黄绿素-AM | Beyotime | C2012 |
| 细胞死亡检测 | LDH释放试剂盒 | MCE | HY-K1090 |
| ELISA | 人LTBP4 ELISA试剂盒 | ABclonal | RK11421 |
| 小鼠LTBP4 ELISA试剂盒 | Uping Bio | SYP-M2169 | |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Huabio | EH0006 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | ABclonal | EM0001 | |
| 超声心动图 | Vevo 3100超声成像系统 | FUJIFILM VisualSonics Inc. | 30 MHz, 450 probes |
| Western blot | Tanon-5200成像系统 | Tanon Science & Technology Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TAC小鼠模型 | 小鼠性别、周龄、TAC狭窄针头规格、观察时间点、样本量 阅读提示:Methods中Transverse aortic constriction (TAC) model小节及Fig. 2B图注 |
| 心肌细胞特异性Ltbp4敲除 | 他莫昔芬剂量、给药频率、注射次数、敲除验证方法 阅读提示:Methods中Animals小节和Transverse aortic constriction (TAC) model小节 |
| 细胞刺激与抑制剂处理 | AngII、PE、H2O2、Nigericin、MCC950、CilioA、CHX的浓度和处理时间 阅读提示:Methods中Cell culture小节及各Figure图注 |
| 腺病毒转染 | 病毒MOI、转染时间、对照病毒类型 阅读提示:Methods中Virus infection小节 |
| co-IP与GST pull-down | 抗体用量、孵育时间、洗涤条件、截短体构建 阅读提示:Methods中Immunoprecipitation and western blotting及Glutathione s-transferase (GST) pull-down assays小节,Fig. 6和Fig. 7图注 |