构建TMEM65报告小鼠及条件敲除小鼠
在体内研究TMEM65的组织表达及功能缺失影响。
构建TMEM65-V5敲入报告小鼠,以及基于Tmem65fl/fl与CMV-Cre、Nestin-Cre、Myf6-Cre杂交的全身、神经、肌肉特异性敲除小鼠。
Loss of TMEM65 in mice causes mitochondrial disease mediated by mitochondrial Ca2.
构建全身、神经、肌肉特异性敲除及报告小鼠,结合存活、代谢、蛋白组和线粒体钙功能验证,并有MCU敲除挽救实验。
全身性Tmem65敲除小鼠(Tmem65−/−) 神经系统特异性Tmem65敲除小鼠(Tmem65fl/fl::NesCre) 骨骼肌特异性Tmem65敲除小鼠(Tmem65fl/fl::Myf6Cre) Tmem65−/−::Mcu−/−双敲除小鼠
Tmem65−/−小鼠平均寿命21.7±3.6天,介于P11-P30死亡 Tmem65fl/fl::NesCre小鼠平均寿命20.5±2.3天,介于P18-P29死亡 2月龄Tmem65fl/fl::Myf6Cre小鼠FDB肌纤维线粒体Ca2+水平升高 Tmem65fl/fl::Myf6Cre小鼠线粒体Na+依赖Ca2+外排丧失,脑线粒体同样减少 Tmem65−/−::Mcu−/−小鼠寿命延长至>1年,运动能力恢复
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体内研究TMEM65的组织表达及功能缺失影响。
构建TMEM65-V5敲入报告小鼠,以及基于Tmem65fl/fl与CMV-Cre、Nestin-Cre、Myf6-Cre杂交的全身、神经、肌肉特异性敲除小鼠。
确认TMEM65蛋白在组织中的表达及亚细胞定位。
Western blot检测TMEM65-V5小鼠组织蛋白表达,免疫荧光分析脑和心脏组织及分离肌纤维中的线粒体共定位。
确定TMEM65缺失的整体生理后果及神经元作用。
监测体重、存活、抓力、癫痫行为,并进行脑MRI和H&E染色。
确定TMEM65在骨骼肌维持中的作用。
监测体重、肌肉质量、肌纤维横截面积、肌球蛋白亚型、代谢笼参数和自主跑轮活动。
揭示肌肉特异性敲除后的分子变化。
对2月龄和10月龄比目鱼肌进行TMT质谱蛋白质组学分析,并进行GO富集分析和Western blot验证。
验证TMEM65缺失对线粒体Ca2+摄取、保留和外排的影响。
使用Rhod-2和MitoTracker Green测量FDB肌纤维线粒体Ca2+,在分离线粒体中进行Ca2+摄取和外排实验,并检测膜电位和氧化磷酸化功能。
检验阻断线粒体Ca2+内流能否挽救TMEM65缺失表型。
将Tmem65−/−与Mcu−/−杂交,评估存活、体重、抓力、代谢、跑轮能力和肌纤维类型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | 啮齿动物饲料 | LabDiet | 5021 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | 20–188 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | P8340 | |
| NuPAGE 10% Bis-Tris蛋白凝胶 | Life Technologies | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| XCell II转印模块 | Invitrogen | -- | |
| 封闭液 | Li-Cor | P/N927-40000 | |
| IRDye二抗 | Li-Cor | -- | |
| Azure c600成像系统 | Azure Biosystems | -- | |
| Chameleon duo预染蛋白梯 | Li-Cor | 928-60000 | |
| 抗TMEM65抗体 | Sigma-Aldrich | HPA025020 | |
| 抗TMEM65抗体 | Invitrogen | PA5-112762 | |
| 抗V5抗体 | Life Technologies | R960-25 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Li-Cor | P/N 926-42212 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| 抗MCU抗体 | Sigma-Aldrich | HPA016480 | |
| 抗LETM1抗体 | Proteintech | 16024-1-AP | |
| 抗NCLX抗体 | Proteintech | 21430-1-AP | |
| 抗GHITM抗体 | Proteintech | 16296-1-AP | |
| 抗复合物IV亚基IV抗体 | Invitrogen | A21348 | |
| Oxphos啮齿动物Western blot抗体混合物 | Invitrogen | 45-8099 | |
| 抗热休克蛋白60抗体 | Invitrogen | PA5-79414 | |
| 抗VDAC抗体 | Cell Signaling Technology | 4611 | |
| 免疫共沉淀 | Dynabeads免疫共沉淀试剂盒 | Life Technology | 14321D |
| 免疫荧光 | ProLong Gold抗淬灭封片剂 | Life Technologies | -- |
| 抗ATP5A抗体 | Abcam | ab14748 | |
| 抗V5抗体 | Cell Signal Technology | 13202S | |
| 抗TMEM65抗体 | Sigma-Aldrich | HPA025020 | |
| 抗Desmin抗体 | Sigma-Aldrich | D1033 | |
| 抗Connexin 43抗体 | Abcam | ab11370 | |
| 抗I型肌球蛋白重链抗体 | DSHB | BA-D5 | |
| 抗IIa型肌球蛋白重链抗体 | DSHB | SC-71 | |
| 抗IIb型肌球蛋白重链抗体 | DSHB | BF-F3 | |
| 抗Laminin抗体 | Sigma-Aldrich | L9393 | |
| 线粒体钙成像 | Rhod-2-AM | Thermo Fisher Scientific | -- |
| MitoTracker Green | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 线粒体分离 | 枯草杆菌蛋白酶A | Sigma-Aldrich | P3910 |
| 线粒体钙摄取/外排 | Calcium Green-5N | -- | -- |
| CLARIOstar Plus酶标仪 | BMG Labtech | -- | |
| 线粒体钙外排 | Ru360 | -- | -- |
| 线粒体膜电位 | 四甲基罗丹明甲酯 | -- | -- |
| MitoTracker Green | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 氧消耗测量 | Oxygraph+系统 | Hansatech Instruments | -- |
| 质谱 | TMT 16plex标记试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Orbitrap Fusion Lumos三合一质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MRI | 马根维显 | Bayer HealthCare Pharmaceuticals | -- |
| 14 T Bruker显微成像系统 | Bruker | -- | |
| 超声心动图 | Vevo2100超声系统 | VisualSonics | -- |
| 30 MHz超声探头 | VisualSonics | MS-400 | |
| 代谢笼 | Oxymax-CLAMS系统 | Columbus Instruments | -- |
| 体成分分析 | EchoMRI体成分分析仪 | -- | -- |
| 自主跑轮 | 低剖面无线跑轮 | Med Associates Inc. | -- |
| 家庭笼监测 | PhenoTyper家庭笼 | Noldus | -- |
| 基因分型 | Cas9 mRNA | TriLink | L-7606 |
| 质粒 | C端Flag标签人NCLX质粒 | OriGene | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 存活分析 | 小鼠品系背景、基因型、样本量(Tmem65−/− n=45,对照n=31;Tmem65fl/fl::NesCre n=32,对照n=17;Tmem65−/−::Mcu−/− n=10等)及观察终点 阅读提示:Methods中Animal studies及Generation of transgenic mice小节;Fig. 1g、Fig. 2f、Fig. 6b图注 |
| 线粒体钙外排实验 | 线粒体蛋白量100 μg、Ca2+负荷50 μM、Ru360 3 μM、NaCl 20 mM、Calcium Green-5N 1 μM、呼吸缓冲液组成 阅读提示:Methods中Measurement of Ca2+ uptake/retention capacity and Ca2+ efflux from isolated mitochondria小节;Fig. 5e/f图注 |
| 肌肉特异性敲除表型分析 | 小鼠年龄(2、6、10月龄等)、性别、样本量、检测指标(体重、肌纤维横截面积、肌球蛋白亚型、代谢笼参数) 阅读提示:Methods中Indirect calorimetry、Running wheel、Mass spectrometry小节;Fig. 3、Fig. 4图注 |
| MCU敲除挽救实验 | Tmem65−/−::Mcu+/+、Tmem65−/−::Mcu+/−、Tmem65−/−::Mcu−/−的基因型、样本量、检测时间点(存活、抓力P20-21、代谢3.5月龄、跑轮4.5月龄、肌纤维6月龄) 阅读提示:Methods中Inverted grip suspension test、Indirect calorimetry、Running wheel小节;Fig. 6图注 |
| 蛋白质组学分析 | 小鼠年龄(2月龄和10月龄)、样本量(2月龄对照和KO各n=4,10月龄对照n=3、KO n=4)、TMT标记、质谱平台和差异分析阈值 阅读提示:Methods中Mass spectrometry和Gene ontology analyses小节;Fig. 4图注 |