建立LASV替代性小鼠攻击模型
在BSL-2条件下建立可产生类似人类LASV病毒载量的可检测病毒血症模型,用于研究交叉反应性免疫。
构建表达不同LASV谱系GPC或嵌合GPC的重组LCMV,比较其在小鼠体内的病毒血症动力学;并检测LASV与LCMV GPC之间的血清学交叉反应。
B cell immunity to the Lassa virus glycoprotein is a correlate of vaccination-induced virus control in mice.
包含体外结合与中和检测、B细胞过继转移、超突变缺陷小鼠、单细胞V(D)J测序及多种重组病毒攻击模型,并含功能验证
C57BL/6 J野生型小鼠 HkiL BCR敲入单克隆B细胞过继转移模型 TgL BCR限制性受体小鼠 重组LCMV/LASV嵌合病毒攻击模型
CD8 T细胞在免疫前和攻击前均被清除,以分离抗体介导的病毒载量控制作用 rLCMV/LASVLIIA或rLCMV/VSVG、rLCMV-Arm、rVSVΔG-LASV-GPC等免疫组的对照设置 攻击后连续监测rLCMV/LASVLIVC病毒血症动态 HkiL细胞过继转移数量为10⁴个/受体(约500个定植细胞/脾),CFSE标记实验使用2×10⁵个 HkiL-AIDG23S小鼠用于评估体细胞超突变对保护作用的限速作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在BSL-2条件下建立可产生类似人类LASV病毒载量的可检测病毒血症模型,用于研究交叉反应性免疫。
构建表达不同LASV谱系GPC或嵌合GPC的重组LCMV,比较其在小鼠体内的病毒血症动力学;并检测LASV与LCMV GPC之间的血清学交叉反应。
检验LASV谱系间GPC交叉反应性抗体能否抑制异源LASV-GPC病毒的病毒血症。
用无病毒血症的rLCMV/LASVLIIA或对照rLCMV/VSVG免疫CD8 T细胞清除的小鼠,四周后用rLCMV/LASVLIVC攻击,监测病毒血症、LASV-GPC特异性IgG和中和抗体。
确认病毒血症控制依赖抗体分泌,并独立于中和抗体活性。
使用sIgM−/−xAID−/−小鼠(B细胞不能分泌免疫球蛋白)重复免疫-攻击实验;并用ADCC替代实验检测FcγRIV介导的效应细胞激活。
在单克隆水平追踪LCMV-GP1特异性B细胞对LASV-GPC的增殖与亲和成熟。
将CFSE标记的HkiL脾细胞过继转移至感染不同重组病毒的小鼠,检测增殖;并用TgL受体小鼠检测HkiL细胞在LASV-GPC免疫后的亲和成熟和中和活性。
确定先前激活的HkiL细胞能否在LASV-GPC启动后控制病毒血症,以及体细胞超突变是否为限速步骤。
比较rLCMV/LASVLIIA与rLCMVA启动的HkiL细胞在rLCMV/LASVLIVC攻击后的病毒血症;使用超突变缺陷的HkiLAIDG23S细胞重复实验;scRNAseq分析V(D)J突变负荷和克隆多样性。
验证临床阶段LASV疫苗候选是否可独立于CD8 T细胞诱导B细胞介导的病毒载量控制。
CD8 T细胞清除的WT小鼠接种rVSVΔG-LASV-GPC或rVSV-EGFP对照,五周后用rLCMV/LASVLIVC(及LIC、LIIIC)攻击;并用HkiL细胞转移系统评估亲和成熟。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | FreeStyle 293-F悬浮细胞 | Gibco/ ThermoFisher | R790-07 |
| HyClone CDM4HEK293培养基 | Cytiva | SH30858.02 | |
| GlutaMax | Gibco | 35050038 | |
| Vero E6细胞 | ECACC | 85020206 | |
| BHK-21细胞(克隆13) | ECACC | 85011433 | |
| 克隆构建 | in-Fusion Snap组装预混液试剂盒 | Takara Bio Inc | 638946 |
| 病毒RNA提取 | QIAamp病毒RNA迷你试剂盒 | QIAGEN | -- |
| SuperScript IV第一链合成系统 | Thermofisher | -- | |
| Phusion聚合酶 | New England Biolabs | -- | |
| QIAquick凝胶提取试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| 流式分析 | Zombie UV可固定活力试剂盒 | Biolegend | -- |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- | |
| LSRFortessa流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- | |
| Aurora流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| eBioscience一步固定/裂解液 | eBioscience | -- | |
| 单细胞分选 | EasySep小鼠链霉亲和素RapidSpheres分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19860 |
| FACSAria III细胞分选仪 | Becton Dickinson | -- | |
| BD FACSDiscover S8细胞分选仪 | Becton Dickinson | -- | |
| ViaStain AOPI染色液 | Nexcelom Bioscience | CS2-0106-5ml | |
| PD100细胞计数板 | Nexcelom Bioscience | CHT4-PD100-003 | |
| 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody芯片 | Becton Dickinson | -- |
| 5200片段分析仪 | Agilent | M5310AA | |
| HS NGS片段试剂盒(1-6000 bp) | Agilent | DNF-474-1000 | |
| Qubit 4荧光定量仪 | Thermo Fisher Scientific | Q33238 | |
| Qubit 1X dsDNA HS检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | Q33231 | |
| Aviti测序系统 | Element Biosciences | -- | |
| Aviti 2×75测序试剂盒Cloudbreak FS High Output | Element Biosciences | 860-00015 | |
| ELISA | 山羊抗人IgG | Jackson Immunoresearch | 109-005-098 |
| Tween-20 | Sigma | P9416 | |
| ABTS | Thermo Scientific | 34026 | |
| SDS | Sigma | 71729 | |
| Infinite M Plex酶标仪 | TECAN | -- | |
| Strep-TactinXT | Iba | -- | |
| 抗体纯化 | ÄKTAprime plus纯化系统 | GE healthcare | -- |
| 中和试验 | Immunospot S6仪器 | C.T.L. | -- |
| ADCC实验 | mFcγRIV ADCC报告基因生物检测 | Promega | -- |
| Tecan Spark酶标仪 | Tecan Group AG | -- | |
| 血液采样 | Multivette 600血清凝胶管 | Starstedt | -- |
| 肝素钠 | B. Braun | B01AB01 | |
| 流式分析 | 抗小鼠MHC-H2 I类抗体(克隆M1/42) | Becton Dickinson | 626545 |
| 抗CD138抗体 | Milteny | 130-108-989 | |
| 抗CD45.1抗体(克隆A20) | BioLegend | 110718 | |
| 抗B220抗体(克隆RA3-6B2) | BioLegend | 103246 | |
| 抗TCR-β抗体(克隆H57-597) | BioLegend | 109224 | |
| 抗CD45.2抗体(克隆104) | Becton Dickinson | 757503 | |
| DAPI | BioLegend | 422801 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 免疫与病毒攻击模型 | rLCMV/LASV各谱系病毒剂量≥10⁷ FFU静脉注射;LCMV-Armstrong 10³ FFU;rVSV病毒10⁶ PFU;CD8 T细胞清除YTS169.4首剂0.4 mg、攻击前后0.2 mg 阅读提示:Methods 'Virus infections, CD8 T cell depletion, adoptive B cell transfer and blood sampling'及图1–7图注 |
| HkiL细胞过继转移 | 转移细胞数10⁴个/受体(约500定植细胞/脾,5%定植率);CFSE标记实验2×10⁵个;受体为TgL小鼠 阅读提示:Methods 'Virus infections, CD8 T cell depletion, adoptive B cell transfer and blood sampling',Fig. 3D, 4A, 7F图注 |
| 病毒血症与抗体检测 | 病毒血症灶形成试验用NIH 3T3细胞;ELISA检测LASV-GPC IgG以AUC定量;中和试验以IC50报告 阅读提示:Methods 'Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)'、'Monoclonal antibodies and virus neutralization assays'及图注 |
| 超突变缺陷实验 | HkiLAIDG23S细胞携带AIDG23S点突变;与HkiL细胞平行比较攻击后病毒血症和nAb比值 阅读提示:Fig. 6A–E及Methods 'Animals and ethics statement'中HkiL-AIDG23S小鼠描述 |
| 单细胞RNA测序分析 | 分选CD138-B220+CD45.1+CD45.2-DAPI- HkiL B细胞;克隆型定义为六个CDR100%序列一致;按最小样本量790细胞做100次bootstrap计算Gini-Simpson指数 阅读提示:Methods 'Single-cell RNA sequencing'和'Analysis of single cell RNA sequencing data',Fig. 5图注 |