高糖诱导ADSL-INSIG1/2相互作用的鉴定
确定高糖条件下与INSIG1/2结合的蛋白及其结合条件。
在高糖培养的Huh7细胞中免疫沉淀Flag-INSIG1/INSIG2,质谱鉴定结合蛋白,并用免疫共沉淀和细胞分级验证ADSL与INSIG1/2的结合及内质网转位。
INSIG1/2 succination mediated by the moonlighting function of ADSL promotes lipogenesis and liver tumorigenesis.
涵盖HCC细胞系、基因编辑细胞、小鼠移植瘤与转基因模型、患者HCC样本及多组学与分子模拟验证
Huh7人肝细胞癌细胞系 HCCLM3人肝细胞癌细胞系 athymic BALB/c nude小鼠皮下及肝内移植瘤模型 FVB/N小鼠AKT/c-Met hydrodynamic转基因HCC模型
高糖处理浓度25 mM,低糖预处理1.25 mM 16 h;抑制剂预处理30 min ADSL S407A/S407D、A291V等突变体在ADSL敲低细胞中的回补表达 INSIG1 C167S/INSIG2 C111S及C167D/C111D CRISPR/Cas9敲入细胞 小鼠移植瘤每组n=6,接种后28天评估肿瘤体积 Elsulfavirine 10 mg/kg每日灌胃,联合Lenvatinib 10 mg/kg每日灌胃20天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定高糖条件下与INSIG1/2结合的蛋白及其结合条件。
在高糖培养的Huh7细胞中免疫沉淀Flag-INSIG1/INSIG2,质谱鉴定结合蛋白,并用免疫共沉淀和细胞分级验证ADSL与INSIG1/2的结合及内质网转位。
确定葡萄糖诱导ADSL磷酸化的激酶及关键磷酸化位点。
用PKC抑制剂和PKCε敲低/回补实验验证PKCε的作用;体外激酶实验和质谱鉴定ADSL S407位点;构建S407A/S407D突变体检测其内质网转位和与INSIG1/2的结合。
验证ADSL的酶活性是否参与高糖诱导的SREBP激活和脂肪生成。
在ADSL敲低细胞中回补WT、S407A、A291V等突变体,检测SCAP-INSIG解离、SCAP高尔基体转位、SREBP-1切割/核转位/转录活性、下游基因表达、14C-葡萄糖掺入TG/FA及脂滴数量。
确定ADSL产生的富马酸是否使INSIG1/2琥珀酰化及其对氧固醇结合的调控。
用LC-MS/MS鉴定INSIG1 C167和INSIG2 C111琥珀酰化位点;用特异性抗体检测高糖、ADSL突变体和DMF处理下的琥珀酰化;用[3H]25-羟基胆固醇结合实验检测琥珀酰化对INSIG与氧固醇结合的影响;用分子动力学模拟分析scC111-INSIG2-SCAP复合物稳定性。
验证INSIG1/2 C167/C111琥珀酰化是否介导高糖诱导的SREBP激活和HCC进展。
在INSIG1 C167S/INSIG2 C111S敲入细胞中检测SCAP-INSIG解离、SREBP-1切割/核转位/转录活性、下游基因表达、14C-葡萄糖掺入脂质和脂滴;用小鼠移植瘤和AKT/c-Met转基因模型检测肿瘤生长。
筛选并验证可阻断ADSL-INSIG1/2相互作用的小分子抑制剂。
通过药效团和分子对接虚拟筛选FDA批准药物库,选出Tezacaftor、Elsulfavirine和Pyrithioxin;用GST pulldown、免疫共沉淀、分子动力学模拟、靶点结合和热位移实验验证Elsulfavirine与INSIG1/2结合并破坏ADSL-INSIG2复合物;检测其对SREBP-1激活和脂质合成的影响。
评估Elsulfavirine单药及联合Lenvatinib对HCC肿瘤生长的抑制作用。
在Huh7皮下移植瘤小鼠中分组给予对照、Lenvatinib、Elsulfavirine或联合处理,检测肿瘤体积、重量、Ki-67、凋亡及SREBP-1和脂质合成酶表达;在Hepa1-6荷瘤模型中进行验证。
评估ADSL pS407、INSIG1/2琥珀酰化和SREBP-1核表达与HCC临床特征及预后的关系。
对30对HCC及癌旁组织和84例切除HCC肿瘤进行IHC,检测PKCε pS729、ADSL pS407、INSIG1/2 scC167/C111和SREBP-1表达,并与总生存期进行Kaplan-Meier分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹和免疫沉淀 | 抗ADSL兔抗体 | Abcam | ab154872 |
| 抗INSIG1兔抗体 | Abcam | ab70784 | |
| 抗PKCε S729兔抗体 | Abcam | ab63387 | |
| 抗Calnexin兔抗体 | Abcam | ab22595 | |
| 抗SREBP-1兔抗体 | Abcam | ab28481 | |
| 抗SCAP兔抗体 | Abcam | ab125186 | |
| 抗PKCε抗体 | Cell Signaling Technology | #2683 | |
| 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | #3724 | |
| 抗PKCα兔抗体 | ABclonal | A0267 | |
| 小鼠抗ADSL抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365623 | |
| 抗SREBP-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13551 | |
| 细胞培养和药物处理 | U0126 | MedChemExpress | -- |
| MK-2206 | MedChemExpress | -- | |
| SU6656 | MedChemExpress | -- | |
| AEB071 | MedChemExpress | -- | |
| Elsulfavirine | MedChemExpress | -- | |
| Tezacaftor | MedChemExpress | -- | |
| 吡硫醇 | MedChemExpress | -- | |
| 仑伐替尼 | Selleck Chemicals | -- | |
| 托瑞司他 | MedChemExpress | -- | |
| 普萘洛尔 | MedChemExpress | -- | |
| 雷帕霉素 | MedChemExpress | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | MedChemExpress | -- | |
| 体外激酶实验 | ATP-γ-S | Abcam | ab138911 |
| 重组活性PKCε | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫沉淀和pull-down | 抗Flag M2琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| 3×Flag肽 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 链霉亲和素磁珠 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Ni-NTA琼脂糖 | Qiagen | -- | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488山羊抗兔抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11008 |
| Alexa Fluor 594山羊抗兔抗体 | Thermo Fisher Scientific | A11012 | |
| BODIPY | Thermo Fisher Scientific | D3922 | |
| 脂滴染色 | DAPI | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞培养和转染 | Lipo8000转染试剂 | Beyotime | -- |
| 细胞培养和筛选 | 潮霉素 | EMD Biosciences | 400053 |
| 嘌呤霉素 | EMD Biosciences | 540222 | |
| G418 | EMD Biosciences | 345810 | |
| 内质网分级分离 | 内质网分离试剂盒 | Sigma-Aldrich | ER0100 |
| 富马酸检测 | 富马酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK060 |
| 胆固醇处理 | 胆固醇 | Sigma-Aldrich | C8667 |
| Diacylglycerol检测 | 二酰甘油检测试剂盒 | Abcam | ab242293 |
| Western blot | 抗硫代磷酸酯抗体 | Abcam | ab92570 |
| 免疫组织化学 | 抗INSIG2抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-41707 |
| 免疫荧光 | 抗Golgin97抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-9767-82 |
| 免疫印迹 | 抗PDH E1 Alpha抗体 | Proteintech | 18068-1-AP |
| 抗ACLY抗体 | Proteintech | 15421-1-AP | |
| 免疫印迹和免疫沉淀 | 抗ADSL pS407抗体 | ABclonal Biotechnology | -- |
| 抗INSIG1/2 scC167/C111特异性抗体 | ABclonal Biotechnology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 高糖处理与抑制剂预处理 | 低糖预处理浓度1.25 mM及时间16 h;高糖浓度25 mM;U0126 20 μM、MK-2206 10 μM、SU6656 4 μM、AEB071 5 μM预处理30 min 阅读提示:Methods中Cell culture and transfection小节及Figure 1图注 |
| ADSL突变体回补实验 | ADSL shRNA靶序列及回补的Flag-rADSL WT、S407A、S407D、A291V等突变体;嘌呤霉素和潮霉素筛选浓度 阅读提示:Methods中DNA construction and mutagenesis及Cell culture and transfection小节 |
| INSIG1/2敲入细胞构建 | sgRNA靶序列、ssODN序列及单细胞克隆筛选方法;INSIG1 C167S/INSIG2 C111S敲入验证 阅读提示:Methods中CRISPR-Cas9-mediated genome editing小节及Supplementary Fig. 6a–d |
| [3H]25-羟基胆固醇结合实验 | 纯化His-INSIG1/2用量1.2 μg;[3H]25-羟基胆固醇浓度10–500 nM;4 h室温孵育;n=4生物学重复 阅读提示:Methods中[3H]25-hydroxycholesterol binding assay小节及Figure 3e–h图注 |
| 小鼠移植瘤实验 | Huh7细胞接种数量1×10^6;基质胶比例33%;每组n=6;接种后28天评估;Elsulfavirine和Lenvatinib剂量10 mg/kg每日灌胃20天 阅读提示:Methods中Animal studies小节及Figure 7a,b,g,h图注 |
| AKT/c-Met转基因HCC模型 | 质粒用量:pT3-EF1a-ADSL 20 μg、myr-AKT 20 μg、c-Met 20 μg、SB 2.4 μg; hydrodynamic注射体积2 ml;14周后评估 阅读提示:Methods中Animal studies小节及Supplementary Fig. 11k–m |