条件性BCL-2转基因小鼠构建与成纤维细胞特异性表达验证
验证人BCL-2可在成纤维细胞中条件性表达并定位于线粒体。
构建CFP/BCL-2stopfl/fl小鼠,与PDGFRα-CreERT2或Col1a1-CreERT2杂交,他莫昔芬诱导后检测BCL-2、CFP表达及细胞类型特异性。
Conditional BCL-2 Expression in Fibroblasts Promotes Persistent Pulmonary Fibrosis which is Reversible by Therapeutic BCL-2 Inhibition.
含条件性转基因小鼠、两种Cre驱动、bulk RNA-seq、空间转录组、人IPF组织及ABT-199体内治疗验证
PDGFRα-CreERT2;CFP/BCL-2stopfl/+小鼠 Col1a1-CreERT2;CFP/BCL-2stopfl/+小鼠 博来霉素诱导肺纤维化小鼠模型 人IPF肺组织及对照肺组织
博来霉素气管内滴注剂量1.5 U/kg,溶于无菌生理盐水,体积50 μL 他莫昔芬腹腔注射0.25 mg/g体重,溶于玉米油,从博来霉素后第4天开始,第4–21天共5次注射 ABT-199以100 mg/kg每日口服灌胃28天,从纤维化建立后第5周开始 PDGFRα-CFP/BCL-2+小鼠博来霉素组每时间点n=5, saline组n=4;PDGFRα-CFP/BCL-2-小鼠博来霉素组每时间点n=5, saline组n=4–6 成纤维细胞凋亡检测采用PDGFRα/PDGFRβ/TUNEL共染色,计数10张图像/动物
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证人BCL-2可在成纤维细胞中条件性表达并定位于线粒体。
构建CFP/BCL-2stopfl/fl小鼠,与PDGFRα-CreERT2或Col1a1-CreERT2杂交,他莫昔芬诱导后检测BCL-2、CFP表达及细胞类型特异性。
检测BCL-2表达是否使成纤维细胞抵抗线粒体和死亡受体途径诱导的凋亡。
原代肺成纤维细胞分别用staurosporine或Jo2联合TNF-α/IFNγ处理,检测caspase-3/7活性。
检测条件性BCL-2表达是否减少纤维化肺中成纤维细胞凋亡。
博来霉素或生理盐水滴注PDGFRα-CFP/BCL-2fl/+小鼠,他莫昔芬或玉米油处理,3周时PDGFRα/PDGFRβ/TUNEL共染色。
确定BCL-2驱动的成纤维细胞持续存在是否阻止肺修复并导致持续性纤维化。
博来霉素滴注后0–12周定量PDGFRα+成纤维细胞、PDGFRα+/β+成纤维细胞和PDGFRβ+周细胞,检测羟脯氨酸、Masson三色染色、CCSP/KRT8和pro-SPC染色。
检测BCL-2表达成纤维细胞是否获得持续促纤维化和衰老相关转录程序。
分选 naïve、博来霉素后3周和6周的肺成纤维细胞进行bulk RNA-seq,GO富集分析和衰老基因评分。
检测BCL-2表达成纤维细胞是否表达衰老标志物,并在人IPF肺中验证。
免疫染色p16INK、p21WAF、SA-β-gal与BCL-2/PDGFRα/PDGFRβ;对人IPF和对照肺进行空间转录组及免疫染色。
确定衰老表型是否也出现在其他持续性纤维化模型中。
分析重复博来霉素滴注后24周和Col1a1-CreERT2;Fas−/−小鼠博来霉素后6周的成纤维细胞bulk RNA-seq及免疫染色。
检测ABT-199能否清除衰老抗凋亡成纤维细胞并逆转已建立的纤维化。
博来霉素滴注PDGFRα-CFP/BCL-2+小鼠,5周后给予ABT-199或vehicle口服灌胃4周,检测成纤维细胞数量、羟脯氨酸、micro-CT、动脉氧饱和度和衰老标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 他莫昔芬诱导 | 他莫昔芬 | Sigma Aldrich | -- |
| 他莫昔芬溶剂对照 | 玉米油 | Sigma Aldrich | -- |
| 标准饲料 | 2919饲料 | Inotiv | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 线粒体染色 | 线粒体红色荧光探针 | Invitrogen/ThermoFisher | M7512 |
| 肌动蛋白染色 | 鬼笔环肽(AF488) | Invitrogen/ThermoFisher | #A12379 |
| Western blot | 抗BCL-2抗体 | Abcam | #59348 |
| 抗GFP抗体 | AvesLab | #GFP-1020 | |
| 抗β-actin抗体 | Millipore | #MAB150 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | #8245 | |
| 抗Tom70抗体 | Cell Signaling | #65675 | |
| 细胞处理 | 肿瘤坏死因子α | -- | -- |
| 干扰素γ | -- | -- | |
| Jo2抗Fas抗体 | BD Pharmingen | -- | |
| 星形孢菌素 | Sigma Aldrich | -- | |
| Caspase活性检测 | Caspase-Glo试剂盒 | Promega | -- |
| 肺纤维化诱导 | 博来霉素 | Amneal Biosciences | -- |
| ABT-199治疗 | ABT-199 | -- | -- |
| ABT-199溶剂 | Phosal 50 PG | -- | -- |
| 聚乙二醇400 | -- | -- | |
| 乙醇 | -- | -- | |
| 组织消化 | 胶原酶 | Sigma Aldrich | C2139 |
| 弹性蛋白酶 | Worthington | LS002274 | |
| 中性蛋白酶 | Worthington | LS02104 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | ThermoFisher | 2520056 | |
| DNase I | Worthington | LS006331 | |
| 流式细胞术 | 抗CD45抗体 | -- | 17-0451-82 |
| 抗CD326/EpCAM抗体 | -- | 17-5791-80 | |
| 抗CD31抗体 | BD Biosciences | 541814 | |
| 抗PDGFRα/CD140a抗体 | -- | 25-1401-82 | |
| 抗PDGFRβ/CD140b抗体 | ThermoFisher | -- | |
| 免疫荧光染色 | M.O.M免疫检测封闭试剂盒 | Vector Laboratories | #BMK-2202 |
| 抗BCL-2抗体(鼠) | BioRad | #MCA1550 | |
| 抗Bcl-2抗体(兔) | Cell Signaling Technology | #3498 | |
| 抗PDGFRα抗体 | Cell Signaling | #3174S | |
| 抗PDGFRβ抗体 | R&D Systems | #AF1032 | |
| 抗αSMA抗体 | Sigma Aldrich | #2547 | |
| 抗p16INK抗体 | Abcam | #ab211542 | |
| 抗p21WAF抗体 | Abcam | #ab188224 | |
| 抗β-半乳糖苷酶抗体 | Cell Signaling | #27198 | |
| 抗CCSP抗体 | Seven Hills Bioreagents | #WRAB-3950 | |
| 抗pro-SPC抗体 | Millipore | #AB3786 | |
| 抗Krt8抗体 | DSHB | #AB531826 | |
| 抗CD45抗体(大鼠) | Invitrogen | 17-0451-82 | |
| 抗CD31抗体(大鼠) | Invitrogen | #14-0311-82 | |
| 山羊抗小鼠-A647二抗 | Invitrogen | A21236 | |
| 驴抗兔-A555二抗 | Invitrogen | A31572 | |
| 山羊抗大鼠-A555二抗 | Invitrogen | A21434 | |
| 驴抗山羊-A647二抗 | Invitrogen | A21447 | |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Promega | -- |
| 封片 | 含DAPI的Fluoroshield封片剂 | Vector Laboratories | -- |
| 细胞分选富集 | CD45磁珠 | Miltenyi Biotech | 130-052-301 |
| CD31磁珠 | Miltenyi Biotech | 130-097-418 | |
| CD326磁珠 | Miltenyi Biotech | 130-105-958 | |
| 测序 | NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| 空间转录组 | Nanostring CosMx数字空间分析仪 | Nanostring | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 博来霉素诱导肺纤维化 | 博来霉素剂量1.5 U/kg、体积50 μL、气管内滴注;小鼠8–10周龄 阅读提示:Methods 'Assessment of fibrotic lung disease' |
| 他莫昔芬诱导Cre重组 | 他莫昔芬0.25 mg/g体重腹腔注射,从博来霉素后第4天开始,第4–21天共5次注射;对照为玉米油 阅读提示:Methods 'Mice' |
| ABT-199治疗 | ABT-199 100 mg/kg每日口服灌胃28天,从博来霉素后第5周开始;vehicle组成 阅读提示:Methods 'Assessment of fibrotic lung disease' |
| 成纤维细胞凋亡检测 | PDGFRα/PDGFRβ/TUNEL共染色,计数10张图像/动物,排除气道上皮TUNEL+细胞 阅读提示:Methods 'Immunofluorescent staining' |
| bulk RNA-seq | 每组n=4生物学重复;分选Lin-活细胞至少300,000个;DESeq2分析FDR≤0.05 阅读提示:Methods 'Bulk RNA sequencing'及图5、6图注 |
| 空间转录组 | n=13对照、n=15 IPF;使用Nanostring CosMx;衰老模块10基因 阅读提示:Methods 'Spatial transcriptomic analysis'及图6图注 |