建立多西他赛耐药PDX模型
在体内模拟前列腺癌对多西他赛的初始响应和复发耐药
将LuCaP35CR和LuCaP70CR PDX移植到去势雄性scid小鼠,待肿瘤达500 mm3后给予多西他赛30 mg/kg腹腔注射每21天,直至肿瘤达约1500-2000 mm3,末次给药后2周 harvest 耐药肿瘤,并与未治疗对照肿瘤进行RNA-seq和LP-WGS。
FOXJ1 mediates taxane resistance through regulation of microtubule dynamics.
包含PDX体内模型、细胞系体外功能验证、机制探究及临床队列分析
LuCaP35CR和LuCaP70CR去势抵抗性前列腺癌PDX模型 LNCaP和DU145前列腺癌细胞系 LNCaP皮下异种移植瘤模型 CHAARTED临床试验患者队列
PDX模型:LuCaP35CR和LuCaP70CR在去势雄性scid小鼠中皮下移植,多西他赛30 mg/kg腹腔注射每21天一次 LNCaP异种移植:FOXJ1_OE或EV细胞皮下接种裸鼠,肿瘤达500 mm3后多西他赛30 mg/kg腹腔注射 FOXJ1敲低:使用shRNA-01、shRNA-02(LNCaP)或shRNA-01、shRNA-02、shRNA-03(DU145) 多西他赛体外处理浓度和时间:如10 nM或50 nM处理24小时(具体实验不同) Flutax-2结合实验:1 µM FITC-conjugated paclitaxel处理5分钟,洗脱后时间-lapse成像
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体内模拟前列腺癌对多西他赛的初始响应和复发耐药
将LuCaP35CR和LuCaP70CR PDX移植到去势雄性scid小鼠,待肿瘤达500 mm3后给予多西他赛30 mg/kg腹腔注射每21天,直至肿瘤达约1500-2000 mm3,末次给药后2周 harvest 耐药肿瘤,并与未治疗对照肿瘤进行RNA-seq和LP-WGS。
确定FOXJ1过表达是否赋予多西他赛耐药并影响微管成束
建立FOXJ1稳定过表达的LNCaP细胞,通过集落形成实验、流式细胞术检测G2/M比例、pH3S10免疫印迹和微管聚合实验评估多西他赛敏感性及微管成束。
确定内源性FOXJ1下调是否增加多西他赛敏感性及药物结合
在LNCaP和DU145中使用shRNA敲低FOXJ1,通过集落形成、流式细胞术、共聚焦显微镜和Flutax-2结合实验评估多西他赛敏感性、微管成束和药物结合。
确定FOXJ1是否调节非纤毛细胞中的基础微管动力学
在DU145 FOXJ1 KD和对照细胞中,通过乙酰化α-tubulin免疫印迹和EB1-EGFP活细胞成像分析微管生长速率、彗星长度和轨迹。
确定FOXJ1过表达是否在体内导致多西他赛耐药
建立LNCaP FOXJ1_OE和EV皮下异种移植瘤,肿瘤达500 mm3后给予多西他赛30 mg/kg腹腔注射,监测肿瘤生长,并通过免疫荧光评估微管药物-靶点结合。
确定TPPP3是否作为FOXJ1下游效应基因贡献于多西他赛耐药
建立TPPP3过表达LNCaP细胞,通过流式细胞术、微管聚合实验和异种移植瘤实验评估多西他赛敏感性及微管成束。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 多西他赛 | TargetMol | T1034 |
| 卡巴他赛 | TargetMol | T2543 | |
| 长春新碱 | TargetMol | T6721 | |
| 秋水仙碱 | TargetMol | T0320 | |
| 美登素 | TargetMol | T21351 | |
| 埃博霉素 | TargetMol | T6490 | |
| 奥拉帕利 | TargetMol | T3015 | |
| 顺铂 | TargetMol | T1058 | |
| 卡铂 | TargetMol | T1564 | |
| 动物实验 | 多西他赛 | SelleckChem | -- |
| 质粒构建 | pReceiver-Lv241载体 | GeneCopoeia | -- |
| shRNA | FOXJ1 shRNA-01 | Sigma-Aldrich | TCRN0000420413 |
| FOXJ1 shRNA-02 | Sigma-Aldrich | TCRN0000015305 | |
| FOXJ1 shRNA-03 | Sigma-Aldrich | TCRN0000015305 | |
| EB1-EGFP标记 | EB1-EGFP慢病毒颗粒 | VectorBuilder | VB230531-1518prn |
| 微管标记 | 微管追踪深红 | Invitrogen | T34077 |
| 免疫荧光 | 抗β-微管蛋白抗体(克隆YL1/2) | EMD Millipore | Mab1864-I |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗大鼠二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-11006 | |
| Flutax-2结合实验 | FITC标记的紫杉醇(Flutax-2) | Thermo Fisher Scientific | P22310 |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 |
| 抗Vinculin抗体 | Santa Cruz | sc-73614 | |
| 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5335 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Abcam | ab7291 | |
| 抗FOXJ1抗体 | R&D Systems | AF3619 | |
| 抗TPPP3抗体 | Thermo Fisher | PA5-24925 | |
| 抗磷酸化组蛋白H3(ser10)抗体 | Cell Signaling Technology | 9701 | |
| 抗CLIP-170抗体(克隆E-8) | Santa Cruz | -- | |
| 抗兔HRP偶联抗体 | Promega | W401B | |
| 抗小鼠HRP偶联抗体 | Promega | W402B | |
| 抗山羊HRP偶联抗体 | R&D systems | A15999 | |
| qPCR | TaqMan RNA-to-CT 1-Step试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| FOXJ1 Taqman探针 | Thermo Fisher | Hs00230964_m1 | |
| TPPP3 Taqman探针 | Thermo Fisher | Hs00372228_g1 | |
| GMNC Taqman探针 | Thermo Fisher | Hs04970928_m1 | |
| HES1 Taqman探针 | Thermo Fisher | Hs00172878_m1 | |
| HEY1 Taqman探针 | Thermo Fisher | Hs05047713_s1 | |
| GAPDH对照探针 | Thermo Fisher | 4326317E | |
| RNA/DNA提取 | Allprep DNA/RNA迷你试剂盒 | Qiagen | Q33238 |
| 免疫荧光 | EnVision FLEX靶标修复液(高pH) | Dako | DM828 |
| 细胞培养 | Matrigel(Corning基底膜基质) | Corning | CLS 354234 |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | BioLegend | -- |
| 集落形成 | 结晶紫 | Sigma Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PDX模型建立与多西他赛处理 | PDX模型来源(LuCaP35CR和LuCaP70CR)、宿主小鼠品系和性别(去势雄性scid小鼠)、多西他赛剂量(30 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药间隔(每21天)、harvest时间(末次给药后2周) 阅读提示:Methods 'Patient-derived xenograft generation and treatment'及Fig. 1A, B图注 |
| LNCaP异种移植瘤多西他赛处理 | 细胞接种量(~2×10^6)、基质胶浓度(50%)、小鼠品系(雄性裸鼠)、多西他赛剂量(30 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药时间点(第9天和第21天或第30天)、每组小鼠数量(6只或3只) 阅读提示:Methods 'LNCaP xenograft generation and treatment'及Fig. 5A, 6F图注 |
| FOXJ1敲低实验 | shRNA序列编号(shRNA-01: TCRN0000420413; shRNA-02和shRNA-03: TCRN0000015305)、细胞系(LNCaP和DU145)、多西他赛处理浓度和时间(如50 nM 24小时) 阅读提示:Methods 'Plasmids and cell lines'及Fig. 3图注 |
| 微管聚合实验 | 多西他赛或卡巴他赛处理浓度(过夜)、低盐缓冲液成分、离心速度和时间(15,000 rpm 5分钟)、Western blot检测α-tubulin 阅读提示:Methods 'Tubulin polymerization assay' |
| Flutax-2结合实验 | Flutax-2浓度(1 µM)、处理时间(5分钟)、洗脱后成像时间点(0, 15, 30, 60, 90分钟) 阅读提示:Methods 'Native cytoskeleton imaging'及Fig. 3I, J图注 |
| EB1-EGFP成像 | EB1-EGFP慢病毒感染复数(MOI=1)、Tubulin Tracker Deep Red浓度(1 µM)、成像帧率(每0.5秒一帧,共10秒) 阅读提示:Methods 'EB1 imaging and quantification'及Fig. 4B-G图注 |