TMEM120A表达与定位分析
确定TMEM120A在脂肪组织中的表达特征及亚细胞定位。
检测小鼠各组织Tmem120a mRNA和蛋白水平,分析人脂肪组织单核RNA测序数据,并在C3H10T1/2脂肪细胞中通过共定位和亚细胞分级验证ER定位。
TMEM120A maintains adipose tissue lipid homeostasis through ER CoA channeling.
包含体外细胞模型、体内脂肪细胞特异性敲除小鼠模型、人类样本分析及多种功能与机制验证。
C3H10T1/2脂肪细胞 HEK293T细胞 脂肪细胞特异性TMEM120A敲除小鼠 人类皮下脂肪组织样本
TMEM120A与ACSL1/ACSL3在ER的相互作用及W193A突变的影响 异丙肾上腺素刺激下13C-棕榈酸掺入TG的再酯化率 ER富集微体组分中CoA水平的改变 小鼠体内CL316,243刺激后血清FFA和甘油水平 高脂饮食12周后体重、脂肪组织重量及能量消耗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TMEM120A在脂肪组织中的表达特征及亚细胞定位。
检测小鼠各组织Tmem120a mRNA和蛋白水平,分析人脂肪组织单核RNA测序数据,并在C3H10T1/2脂肪细胞中通过共定位和亚细胞分级验证ER定位。
验证TMEM120A是否具有脂肪酸延伸酶活性及其CoA结合能力。
在HEK293T细胞微粒体中用13C-丙二酰辅酶A进行体外脂肪酸延伸实验,并以AlphaFold3建模TMEM120A与CoA衍生物的复合物。
探究TMEM120A是否与ACSL1/ACSL3在ER相互作用并影响其定位。
免疫共沉淀、亚细胞分级、双分子荧光互补实验,检测过表达或敲低TMEM120A对ACSL1/3在ER分布的影响。
评估TMEM120A在脂解过程中对脂肪酸再酯化、ER应激和脂解的调控。
用13C-棕榈酸示踪TG合成,检测ER CoA水平、ER应激标志物、ROS水平、脂解产物释放及cAMP-PKA信号。
研究TMEM120A在体内对脂解、能量消耗及高脂饮食诱导代谢紊乱的影响。
构建Adipoq-Cre介导的脂肪细胞特异性敲除小鼠,进行CL316,243刺激、间接测热、高脂饮食喂养及代谢指标检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Welgene | LM001-07 |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000044 | |
| 青霉素/链霉素 | Welgene | LS202-02 | |
| 脂肪细胞分化 | 骨形态发生蛋白4 | R&D systems | 314-BP-050 |
| 异丁基甲基黄嘌呤 | Sigma | I5879-1G | |
| 地塞米松 | Cayman | 11015 | |
| 胰岛素 | Sigma | I9278 | |
| 吲哚美辛 | Cayman | 70270 | |
| 三碘甲状腺原氨酸 | Cayman | 16028 | |
| 诱导过表达 | 多西环素 | Sigma | D9891-5G |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | Santa Cruz | sc-134220 |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Sigma | P8833 |
| 转染 | jetPRIME转染试剂 | Polyplus | 114-15 |
| 脂肪酸再酯化示踪 | 13C-棕榈酸 | Sigma | 292125 |
| 棕榈酸 | Sigma | P5585 | |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Invitrogen | D399 |
| 辅酶A检测 | 辅酶A检测试剂盒 | Abcam | ab102504 |
| 免疫荧光 | 内质网红色荧光探针 | -- | -- |
| 线粒体红色荧光探针 | -- | -- | |
| 细胞膜深红色染料 | -- | -- | |
| 中性脂质深红色染料 | Invitrogen | H34477 | |
| 免疫印迹 | 抗TMEM120A抗体 | Proteintech | 68229-1-Ig |
| 抗ACSL3抗体 | Proteintech | 20710-1-AP | |
| 抗ACSL1抗体 | Cell Signaling Technology | 9189 | |
| 抗BiP抗体 | Cell Signaling Technology | 3177 | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 2895 | |
| 抗磷酸化HSL (Ser660)抗体 | Cell Signaling Technology | 45804S | |
| 抗磷酸化Perilipin 1 (Ser522)抗体 | Vala Sciences | 4856 | |
| 抗UCP1抗体 | Alpha Diagnostics | UCP11-A | |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗兔IgG二抗 | Invitrogen | 31460 | |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗小鼠IgG轻链特异性二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-174 | |
| 免疫沉淀 | 抗c-Myc琼脂糖 | Thermo | 20168 |
| c-Myc肽 | Thermo | 26184 | |
| 流式细胞术 | 抗CD45抗体 | Invitrogen | 11-0451-82 |
| 抗CD11b抗体 | BioLegend | 101206 | |
| 抗CD11c抗体 | BioLegend | 117310 | |
| 抗CD206抗体 | BioLegend | 141717 | |
| cAMP检测 | 直接竞争ELISA | Enzo | ADI-900-066 |
| 肝甘油三酯检测 | 甘油试剂 | Sigma | F6428 |
| 葡萄糖耐量试验 | D-(+)-葡萄糖 | Sigma | 49139 |
| Gluco Doctor Top血糖仪 | Allmedicus | AGM-4100 | |
| 组织学 | 酒精性伊红Y溶液 | BBC Biochemical | 3610 |
| TUNEL实验 | TUNEL检测试剂盒-HRP-DAB | Abcam | ab206386 |
| 脂解实验 | NEFA-HR(2)检测试剂盒 | Wako Diagnostics | 438-91691 |
| 游离甘油试剂 | Sigma | F6428 | |
| 脂肪酸延伸实验 | 13C-丙二酰辅酶A | -- | -- |
| 棕榈酰辅酶A | -- | -- | |
| LC-MS/MS | Agilent 6495D三重四极杆LC-MS/MS系统 | Agilent | -- |
| Waters ACQUITY UPLC BEH C18色谱柱 | Waters | -- | |
| 间接测热 | PhenoMaster代谢笼 | TSE Systems | -- |
| 体成分分析 | EchoMRI-700核磁共振体成分分析仪 | Echo Medical Systems | -- |
| 单核RNA测序 | Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒 | 10X Genomics | PN-1000269 |
| CellPlex试剂 | 10X Genomics | PN-1000261 | |
| RNA测序 | TruSeq mRNA文库构建试剂盒 | Illumina | -- |
| qPCR | iQ SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 170-8884 |
| 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 | |
| Western blot | PRO-PREP蛋白提取缓冲液 | iNtRON Biotechnology | 17081 |
| SIGMAFAST蛋白酶抑制剂 | Sigma | S8820 | |
| PhoSTOP磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906845001 | |
| RIPA裂解缓冲液 | Thermo Fisher | 89900 | |
| BCA蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342染料 | Thermo | 62249 |
| Permafluor封片剂 | Thermo Fisher Scientific | TA-030-FM |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外脂肪酸再酯化示踪 | 13C-棕榈酸浓度100 μM、处理时间2小时、异丙肾上腺素10 μM、无标记棕榈酸作为同位素阴性对照 阅读提示:Methods 'Stable isotope tracing of FA re-esterification via 13C-palmitate labeling'章节及Fig. 3L图注 |
| 小鼠体内脂解刺激 | CL316,243剂量1 mg/kg、腹腔注射、处理4小时、小鼠8周龄雄性 阅读提示:Methods 'Animal studies'章节及Fig. 5B图注 |
| 高脂饮食诱导肥胖模型 | 高脂饮食60%脂肪、喂养12周、起始8周龄、对照正常饮食 阅读提示:Methods 'Animal studies'章节及Fig. 7A图注 |
| TMEM120A过表达诱导 | 多西环素2 μg/mL处理48小时、脂肪细胞分化后诱导 阅读提示:Methods 'Cell culture and differentiation'章节及Fig. 2B-D图注 |
| ER应激检测 | DGAT1抑制剂A922500 5 μM预处理1小时、异丙肾上腺素10 μM处理3-4小时 阅读提示:Methods 'Cell culture and differentiation'章节及Fig. 3N-P图注 |