条件性基因敲除小鼠构建与验证
在髓鞘化胶质细胞中特异性敲除Gtf2i并验证蛋白表达降低
将Gtf2i loxP小鼠与Cnp-Cre驱动小鼠杂交,获得Gtf2i-KO小鼠;通过免疫组化检测mOLs中Tfii-i表达,并通过髓鞘组分分析验证。
Gtf2i-encoded transcription factor Tfii-i regulates myelination via Sox10 and Mbp regulatory elements.
包含条件性基因敲除小鼠模型、离体原代细胞培养、ChIP-seq、3C-qPCR、电镜、电生理和行为学等多层级功能与机制验证
Gtf2i条件性敲除小鼠(Cnp-Cre;Gtf2if/f) mOL富集的原代细胞培养 离体皮层髓鞘组分
Gtf2i-KO小鼠在mOLs(CC1+细胞)中Tfii-i表达显著降低(免疫组化,n=5 control, n=4 KO) P30 Gtf2i-KO小鼠胼胝体轴突直径增大、髓鞘增厚(TEM,n=3,分别分析231和226个轴突) P30 Gtf2i-KO小鼠胼胝体fEPSP潜伏期缩短、斜率增大(在体电生理,n=7/组) Gtf2i-KO小鼠皮层髓鞘组分中Mbp蛋白和mRNA水平升高(Western blot,n=13 control/12 KO;qPCR,n=11 control/8 KO) mOLs中Tfii-i结合Mbp和Sox10调控元件(ChIP-seq,n=4-5只小鼠混合/基因型;3C-qPCR,n=3/4全皮层)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在髓鞘化胶质细胞中特异性敲除Gtf2i并验证蛋白表达降低
将Gtf2i loxP小鼠与Cnp-Cre驱动小鼠杂交,获得Gtf2i-KO小鼠;通过免疫组化检测mOLs中Tfii-i表达,并通过髓鞘组分分析验证。
评估Gtf2i缺失对胼胝体轴突和髓鞘超微结构的影响
通过透射电镜(TEM)观察P30小鼠胼胝体中线区域,量化g-ratio、轴突直径、髓鞘厚度、髓鞘化/非髓鞘化轴突比例以及郎飞结数量。
检测Gtf2i缺失是否影响胼胝体轴突传导速度
麻醉小鼠后,在一侧半球胼胝体放置刺激电极,对侧放置记录电极,记录场兴奋性突触后电位(fEPSP)。
评估Gtf2i缺失对坐骨神经胫神经分支髓鞘形成的影响
通过TEM观察P30小鼠坐骨神经胫神经分支,量化g-ratio、髓鞘厚度、轴突直径、髓鞘异常以及Remak束中非髓鞘化轴突数量。
评估Gtf2i缺失导致的行为学改变
进行转棒实验、旷场实验、高架零迷宫实验和三箱社交实验,评估运动协调、焦虑样行为和社交能力。
检测Gtf2i缺失后髓鞘蛋白组成和关键基因表达变化
纯化P30和P90小鼠皮层髓鞘组分,进行无标记定量质谱、Western blot和qPCR,检测Mbp、Mog、Sox10等表达水平。
验证Tfii-i对Sox10和Mbp表达的细胞自主调控作用
从Gtf2i条件敲除小鼠制备mOL富集原代培养,感染表达iCre的AAV或对照mCherry AAV,检测Tfii-i、Sox10、Mbp表达及细胞表面积。
在全基因组范围定位mOLs中Tfii-i结合位点,并验证其与Sox10启动子的空间相互作用
对分化的mOLs进行Tfii-i ChIP-seq,鉴定共识峰;进行3C-qPCR检测Sox10启动子与候选cREs的相互作用频率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 髓鞘分离 | 蛋白酶抑制剂 | Sigma-Aldrich | 539131 |
| Western blot | Quick Start Bradford 1X染料试剂 | Bio-Rad | 5000205 |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo-Fisher Scientific | 34577 | |
| 兔抗TfII-I抗体 | Cell Signaling | CST-4562S | |
| 大鼠抗Mbp抗体 | Merck | MAB386 | |
| 兔抗Mog抗体 | Abcam | AB32760 | |
| 兔抗微管蛋白抗体 | Abcam | AB108342 | |
| 兔抗微管蛋白β4抗体 | Abcam | AB179509 | |
| 山羊抗兔抗体 | Merck | AP132P | |
| 山羊抗大鼠抗体 | Merck | AP136P | |
| 免疫组织化学 | 小鼠抗APC(Ab-7,CC1)抗体 | Calbiochem | OP80 |
| 兔抗Olig2抗体 | Sigma-Aldrich | AB9610 | |
| 大鼠抗Pdgfrɑ(CD140a)抗体 | Invitrogen | 14-1401-82 | |
| 小鼠抗NeuN抗体 | Sigma-Aldrich | MAB-377 | |
| 小鼠抗Sox10抗体 | Santa Cruz | SC-365692 | |
| 鸡抗mCherry抗体 | Abcam | ab205402 | |
| 兔抗NaV 1.6抗体 | Alomone labs | ASC-009 | |
| 小鼠抗Caspr抗体 | Abcam | ab252535 | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 488 | Abcam | ab150077 | |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11001 | |
| 山羊抗大鼠Alexa Fluor 488 | Abcam | ab150165 | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A32732 | |
| 山羊抗鸡Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A32932 | |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A21424 | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21245 | |
| 山羊抗大鼠Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21247 | |
| VECTASHIELD Hardset抗荧光淬灭封片剂 | Vector Laboratories | -- | |
| 原代细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Sigma-Aldrich | D6421 |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | G7513 | |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | I0516 | |
| SM1添加剂 | STEMCELL technologies | 05711 | |
| 三碘甲状腺原氨酸 | Sigma-Aldrich | T5516 | |
| 胰蛋白酶A | Sigma-Aldrich | T4049 | |
| ChIP | 甘氨酸 | Cell Signaling | 7005S |
| Magna ChIP蛋白A+G磁珠 | Millipore | 16-663 | |
| 兔抗IgG抗体 | Cell Signaling | 3900S | |
| DNA纯化试剂盒 | Cell Signaling | 14209 | |
| qPCR | RNAlater保存液 | Invitrogen | AB-AM7020 |
| TRIzol试剂 | Thermo-Fisher Scientific | -- | |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo-Fisher Scientific | -- | |
| Fast SYBR Green预混液 | Thermo-Fisher Scientific | -- | |
| CFX Connect实时PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| NanoDrop One分光光度计 | Thermo-Fisher Scientific | -- | |
| 行为学 | 转棒仪 | Ugo Basile | 47650 |
| 电生理 | 双极不锈钢电极 | -- | -- |
| 电子显微镜 | JEM-1400Plus透射电子显微镜 | -- | -- |
| MRI | 7T MRI扫描仪 | Bruker | -- |
| 3C-qPCR | DpnII限制性内切酶 | New England Bio Labs | -- |
| T4连接酶 | Invitrogen | -- | |
| 蛋白酶K | Invitrogen | -- | |
| 质谱 | Hi3大肠杆菌标准品 | Waters Corporation | -- |
| Synapt G2-S四极杆飞行时间质谱仪 | Waters Corporation | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 条件性基因敲除小鼠构建 | Cnp-Cre驱动品系背景(C57Bl/6)、Gtf2i loxP品系背景(回交>15代至C57Bl/6J)、对照组基因型(Gtf2if/f;Cnp-Cre-/-) 阅读提示:Methods中Mouse handling小节及Introduction |
| CNS髓鞘电镜分析 | 取样位置(胼胝体中线,穹窿水平)、年龄(P30)、每组小鼠数(n=3)及分析轴突数(control 231,KO 226) 阅读提示:Methods中Electron microscopy小节及Fig. 2A图注 |
| 在体电生理记录 | 电极坐标(1.5 mm后于bregma,1 mm旁开中线,1000–1300 μm深)、刺激参数(150 μA,0.2 ms,0.2 Hz)、每组小鼠数(n=7) 阅读提示:Methods中In-vivo fEPSP recordings in the CC小节 |
| mOL富集原代培养及Gtf2i敲除 | AAV血清型及启动子(CBAP)、感染时间(DIV3,48小时)、T3浓度(340 ng/mL)、细胞密度(60–80k/孔) 阅读提示:Methods中Primary OPC and mOL cultures小节 |
| ChIP-seq | 抗体用量(5 μL rabbit anti-TFII-I)、染色质片段大小(200–800 bp)、共识峰定义(至少3/5样本中出现)、测序平台(Illumina NovaSeq S1) 阅读提示:Methods中ChIP-seq and ChIP-qPCR小节及ChIP-seq data analysis小节 |
| 3C-qPCR | 限制性内切酶(DpnII)、交联条件(1% PFA 10分钟)、归一化参考位点(Ercc3)、mOL样本混合策略(4个对照样本混合为1个文库) 阅读提示:Methods中Chromosomal conformation capture assay followed by qPCR小节 |
| 行为学测试 | 测试顺序及间隔(每只小鼠最多3项测试,间隔至少3天)、光照条件(旷场中心~60 lux,边缘~10 lux)、转棒加速参数(4–40 rpm,5分钟上限) 阅读提示:Methods中Behavioral tests及相关小节 |