筛选OA相关RNA结合蛋白
鉴定骨关节炎中失调的关键RNA结合蛋白
对DMM小鼠模型和老年诱导OA模型进行RNA-seq,筛选差异表达的RNA结合蛋白,并在人OA软骨中验证MSI2表达。
Circular RNA-based protein replacement therapy mitigates osteoarthritis in male mice.
包含体外软骨细胞、DMM小鼠模型、Msi2基因敲除与条件敲除小鼠、人OA软骨样本及AAV和ivcRNA两种递送验证
DMM诱导的雄性C57BL/6小鼠骨关节炎模型 Msi2软骨细胞特异性条件敲除小鼠 人骨关节炎软骨组织样本 小鼠原代关节软骨细胞及软骨微团培养
DMM模型中ivc-IRES4-Msi2-LNPs每周关节腔注射一次,8周后取材分析 ivcRNA注射剂量为100 ng或300 ng,低于mRNA治疗的5-50 μg AAV2/9-Msi2关节腔注射10 μL(1×10^10 vg) DMM手术在8-12周龄雄性C57BL/6小鼠进行 SM-102-LNPs脂质摩尔比SM-102:DSPC:胆固醇:DMG-PEG2000为50:10:38.5:1.5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定骨关节炎中失调的关键RNA结合蛋白
对DMM小鼠模型和老年诱导OA模型进行RNA-seq,筛选差异表达的RNA结合蛋白,并在人OA软骨中验证MSI2表达。
明确MSI2缺失是否影响软骨细胞代谢并加剧OA
在Msi2敲低软骨细胞、Msi2全身敲除小鼠和软骨细胞特异性条件敲除小鼠中检测软骨代谢标志物,并在DMM手术后进行组织学分析。
验证补充MSI2能否缓解DMM诱导的OA
DMM术后1周关节腔注射AAV-EGFP、AAV-Msi2或AAV-Msi2RBDmut,8周后通过micro-CT和SO&FG染色评估OA表型。
验证ivcRNA能否在关节腔内递送并在软骨细胞中实现持久蛋白表达
基于Ana_PIE_27nt系统合成ivcRNA,用LNPs包封后关节腔注射,通过生物发光成像、RT-qPCR和免疫荧光检测fLuc、mCherry和EGFP表达。
评估基于ivcRNA的MSI2蛋白替代疗法对DMM诱导OA的治疗效果
筛选最佳翻译的ivc-IRES4-Msi2,用LNPs包封后每周关节腔注射DMM小鼠,8周后通过micro-CT、SO&FG染色和免疫组化评估OA表型及MSI2表达。
明确MSI2是否通过结合Sox5 3'UTR促进SOX5翻译
通过RIP实验检测MSI2与Sox5 3'UTR的结合,用3'UTR报告基因和ActD实验验证翻译水平调控,并在Msi2缺陷软骨中检测SOX5和HMGB2表达。
验证补充MSI2下游效应分子SOX5能否缓解OA
筛选最佳翻译的ivc-IRES3-Sox5,用LNPs包封后每周关节腔注射DMM小鼠,7周后通过micro-CT、SO&FG染色和免疫组化评估OA表型及SOX5表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ivcRNA合成 | RiboMAX大规模RNA生产系统-T7 | Promega | P1300 |
| ivcRNA纯化 | Hipure RNA纯化微量试剂盒 | Magen | R2144-03 |
| ivcRNA浓缩 | Amicon超滤管 | Milipore | UFC810024 |
| LNP制备 | NanoGenerator Flex-M微流控混合系统 | PreciGenome | -- |
| SM-102可电离脂质 | MCE | -- | |
| 胆固醇 | Sigma | -- | |
| DMG-PEG2000 | -- | -- | |
| 活体生物发光成像 | D-荧光素 | PerkinElmer | 122799 |
| IVIS Spectrum CT活体成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 关节腔注射 | 5 μL微量注射器 | Hamilton | 7634-01 |
| Micro-CT分析 | SkyScan1176微型CT系统 | Bruker Biospin | -- |
| 免疫荧光染色 | 驴抗兔Alexa Fluor 488/561二抗 | Molecular Probes | -- |
| DAPI | Sigma | D8417 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Dako | S3023 | |
| Western blot | 抗Flag抗体 | Sigma | F-3165 |
| Western blot/免疫组化 | 抗MSI2抗体 | Abcam | ab76148 |
| 抗SOX5抗体 | Abcam | ab94396 | |
| 抗HMGB2抗体 | Abcam | ab124670 | |
| 免疫组化 | 抗MMP13抗体 | Proteintech | 18165-1-AP |
| 抗聚集蛋白聚糖抗体 | Proteintech | 13880-1-AP | |
| 抗ADAMTS5抗体 | Invitrogen | PA5-14350 | |
| 抗mCherry抗体 | SICGEN | AB8181-200 | |
| 抗GFP抗体 | Proteintech | 66002-1 | |
| Western blot | 抗VINCULIN抗体 | Merk | V4505 |
| 抗ACTIN抗体 | Sigma | A3854 | |
| 软骨分化培养 | TGFβ3 | Peprotech | 100-36E |
| 地塞米松 | Sigma | D1756 | |
| L-抗坏血酸2-磷酸 | Sigma | A8960 | |
| 脯氨酸 | Sigma | P5607 | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Cyagen | ITSS-10201-10 | |
| 阿利新蓝染色 | 阿利新蓝 | Sigma | A5268 |
| 质粒提取 | SPARKeasy Superpure Midi质粒提取试剂盒 | Shandong Sparkjade Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 模板线性化 | XbaI限制性内切酶 | NEB | R0145L |
| poly(A)加尾 | 大肠杆菌Poly(A)聚合酶 | Tinzyme | GMP-M012 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DMM模型构建 | 小鼠周龄和性别(8-12周龄雄性C57BL/6)、手术方式(内侧半月板韧带切断)、术后分析时间点(8周) 阅读提示:Methods中DMM model小节及Fig. 1d、3e、4i图注 |
| ivcRNA-LNPs制备 | 脂质摩尔比(SM-102:DSPC:胆固醇:DMG-PEG2000为50:10:38.5:1.5)、N/P比6:1、流速4 mL/min、缓冲液pH 4.5 阅读提示:Methods中Lipid nanoparticle Formulation小节 |
| ivcRNA关节腔注射 | 注射剂量(100 ng或300 ng)、注射频率(每周一次)、注射体积(5 μL) 阅读提示:Fig. 3e、Supplementary Fig. 7g及Results中对应描述 |
| AAV关节腔注射 | AAV血清型(AAV2/9)、剂量(10 μL,1×10^10 vg)、注射时间(DMM术后1周) 阅读提示:Methods中AAV injection小节及Fig. 1j图注 |
| Msi2条件敲除诱导 | 他莫昔芬诱导起始时间(2周龄)、诱导天数(5天)、基因型(Col2-CreERT2; Msi2fl/fl) 阅读提示:Methods中Mouse lines小节 |