FLVCR1b敲低与回补对GAPDH血红素装载的影响
验证FLVCR1b是否参与线粒体血红素向GAPDH的转移
在HEK293T和HeLa细胞中转染FLVCR1b siRNA,48 h后转染HA-TC-GAPDH等表达质粒,加入δ-ALA/Fe刺激线粒体血红素合成,用FlAsH荧光监测GAPDH血红素结合;在HEK293T中回补FLVCR1b表达。
Heme allocation in eukaryotic cells relies on mitochondrial heme export through FLVCR1b to cytosolic GAPDH.
使用HEK293T和HeLa细胞、分离小鼠线粒体及纯化蛋白重构体系,含敲低/回补、荧光动力学、PLA、免疫共沉淀等功能与机制验证
HEK293T细胞 HeLa细胞 分离的小鼠脑和肝线粒体 纯化蛋白体外重构体系
FLVCR1b siRNA敲低效率及回补后蛋白表达恢复(Western blot) δ-ALA/Fe刺激后HA-TC-GAPDH的FlAsH荧光淬灭动力学 PLA检测GAPDH-FLVCR1b结合在0、15、30、45、60、120 min的变化 分离线粒体中GAPDH诱导的14C-血红素释放及血红素向apo-sGCβ的递送 TANGO2敲低对GAPDH-FLVCR1b结合及下游血红素递送的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证FLVCR1b是否参与线粒体血红素向GAPDH的转移
在HEK293T和HeLa细胞中转染FLVCR1b siRNA,48 h后转染HA-TC-GAPDH等表达质粒,加入δ-ALA/Fe刺激线粒体血红素合成,用FlAsH荧光监测GAPDH血红素结合;在HEK293T中回补FLVCR1b表达。
验证GAPDH获取线粒体血红素后向下游客户蛋白递送是否依赖FLVCR1b
在FLVCR1b敲低的HEK293T细胞中表达TC-sGCβ和IDO1,加入δ-ALA/Fe后检测FlAsH-TC-sGCβ荧光变化和IDO1酶活(L-Trp转化为L-犬尿氨酸)及14C-血红素含量。
确定FLVCR1b在线粒体外膜和/或内膜的定位
分离小鼠脑和肝线粒体,进行蛋白酶K处理和线粒体亚组分分离,Western blot检测FLVCR1b、TOM70(外膜标志)和COX4(内膜标志)。
验证线粒体血红素输出过程中GAPDH与FLVCR1b是否发生动态结合
在HEK293T和HeLa细胞中加入δ-ALA/Fe刺激后,用PLA和免疫共沉淀检测GAPDH-FLVCR1b结合在0、15、30、45、60、120 min的变化;并用GAPDH与己糖激酶1的PLA检测GAPDH与线粒体表面的结合。
在重构体系中验证GAPDH与FLVCR1b结合触发线粒体血红素释放并递送至客户蛋白
分离小鼠脑和肝线粒体,与无细胞器的HEK293T细胞质及δ-ALA/ADP孵育进行体外血红素合成,重分离后加入纯化GAPDH或GST,检测14C-血红素释放;加入FlAsH-HA-TC-GAPDH检测血红素结合;加入GAPDH和FlAsH-apo-TC-sGCβ检测血红素递送。
验证TANGO2是否参与FLVCR1b向GAPDH的血红素转移
在HEK293T细胞中敲低TANGO2,检测线粒体血红素向HA-TC-GAPDH、TC-sGCβ和IDO1的递送;用PLA检测GAPDH-FLVCR1b结合及TANGO2-FLVCR1b结合;用TANGO2敲低细胞的胞质与分离线粒体孵育,检测GAPDH-FLVCR1b结合和血红素向HA-TC-GAPDH的转移。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | ATCC | 30-2002 |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| siRNA敲低 | FLVCR1b siRNA | Dharmacon | CTM840033 |
| GAPDH siRNA | Dharmacon | D-001830-02-20 | |
| PGRMC2 siRNA | Santa Cruz | sc-88944 | |
| TANGO2 siRNA | Sigma | EHU064871 | |
| 活细胞荧光标记 | FlAsH-EDT2荧光染料 | Cayman Chemicals | 20704 |
| Western blot | 抗FLVCR1b抗体 | Novus Biologicals | NB100-1481 |
| 抗FLVCR1a抗体 | Proteintech | 26841-1-AP | |
| 抗PGRMC2抗体 | Santa Cruz | sc-374624 | |
| 抗TANGO2抗体 | Proteintech | 27846-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling | 2118S | |
| 抗HADHA抗体 | Santa Cruz | sc-374497 | |
| 抗鸟苷酸环化酶β1(ER-19)抗体 | Sigma | G4405 | |
| 抗αβ-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling | 3724S | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 | |
| 抗TOM70抗体 | Cell Signaling | 65619S | |
| 抗COX IV抗体 | Cell Signaling | 4844S | |
| 山羊IgG同型对照 | Thermo Scientific | 02-6202 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| HRP标记抗小鼠二抗 | Bio-Rad | 170-6516 | |
| HRP标记抗兔二抗 | Bio-Rad | 1706515 | |
| HRP标记抗山羊二抗 | Bio-Rad | 1721034 | |
| ECL化学发光底物 | Thermo Scientific | 32106 | |
| 免疫共沉淀 | Protein G琼脂糖珠 | Cytiva | 17061801 |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 |
| 活细胞荧光检测 | 黑色壁96孔板 | Greiner Bio-One | 655090 |
| SYNERGY H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| 蛋白浓度测定 | Bradford试剂 | Bio-Rad | 500-0006 |
| DC蛋白测定试剂盒 | Bio-Rad | 5000111 | |
| 线粒体分离 | Percoll密度梯度介质 | Sigma Aldrich | P1644 |
| 线粒体处理 | 蛋白酶K | Thermo Fischer Scientific | EO0491 |
| 体外血红素合成 | 二磷酸腺苷 | Sigma | A2754 |
| IDO1活性检测 | L-犬尿氨酸标准品 | Sigma | K8625 |
| PLA | Duolink原位检测试剂 | Sigma Aldrich | DUO92013 |
| 抗兔MINUS探针 | Sigma Aldrich | DUO92005 | |
| 抗山羊PLUS探针 | Sigma Aldrich | DUO92003 | |
| AlexaFluor 488抗小鼠二抗 | ThermoFisher | A-21202 | |
| Duolink原位洗涤缓冲液A | Sigma Aldrich | DUO82046 | |
| 连接缓冲液 | Sigma Aldrich | DUO82009 | |
| 连接酶 | Sigma Aldrich | DUO82027 | |
| 扩增缓冲液 | Sigma Aldrich | DUO82012 | |
| 聚合酶 | Sigma Aldrich | DUO82028 | |
| 洗涤缓冲液B | Sigma Aldrich | DUO82048 | |
| 含DAPI的Duolink原位封片剂 | Sigma Aldrich | DUO82040 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| FLVCR1b敲低与回补 | siRNA终浓度100 nM、处理48 h;回补质粒转染时间与剂量 阅读提示:Methods中Transfection of siRNA and gene silencing及Figure 1 legend |
| δ-ALA/Fe刺激线粒体血红素合成 | δ-ALA 1 mM与柠檬酸铁100 μM的配制及加入时间 阅读提示:Methods中Live cell heme binding kinetics及Figure 1 legend |
| FlAsH荧光动力学检测 | FlAsH-EDT2 5 μM标记30 min;激发508 nm/发射528 nm;检测温度37 °C 阅读提示:Methods中Live cell heme binding kinetics |
| PLA检测GAPDH-FLVCR1b结合 | 抗体稀释比例、PLA时间点0–120 min、背景对照设置 阅读提示:Methods中Proximity ligation assay及Figure 2 legend |
| 分离线粒体血红素释放实验 | 线粒体5 mg蛋白、GAPDH或GST 20 μM、14C-δ-ALA 10 μM、孵育时间0–60 min 阅读提示:Methods中14C-heme efflux from purified mitochondria及Figure 3 legend |
| TANGO2敲低实验 | TANGO2 siRNA处理48 h;对GAPDH-FLVCR1b结合及下游递送的检测条件 阅读提示:Methods中Transfection of siRNA and gene silencing及Figure 4 legend |