真核细胞中的血红素分配依赖于线粒体血红素经FLVCR1b向胞质GAPDH的输出

Heme allocation in eukaryotic cells relies on mitochondrial heme export through FLVCR1b to cytosolic GAPDH.

作者信息Dhanya Thamaraparambil Jayaram, Pranav Sivaram, Pranjal Biswas, Yue Dai, Elizabeth A Sweeny, Dennis J Stuehr
PMID40858607
发布时间2025-08-26
DOI10.1038/s41467-025-62819-2

实验完整度

高

使用HEK293T和HeLa细胞、分离小鼠线粒体及纯化蛋白重构体系,含敲低/回补、荧光动力学、PLA、免疫共沉淀等功能与机制验证

主要模型

HEK293T细胞 HeLa细胞 分离的小鼠脑和肝线粒体 纯化蛋白体外重构体系

重点核对

FLVCR1b siRNA敲低效率及回补后蛋白表达恢复(Western blot) δ-ALA/Fe刺激后HA-TC-GAPDH的FlAsH荧光淬灭动力学 PLA检测GAPDH-FLVCR1b结合在0、15、30、45、60、120 min的变化 分离线粒体中GAPDH诱导的14C-血红素释放及血红素向apo-sGCβ的递送 TANGO2敲低对GAPDH-FLVCR1b结合及下游血红素递送的影响

摘要

血红素是一种含铁辅因子,在线粒体中生成,必须离开该细胞器才能到达其他细胞区室中的蛋白质靶标。由于胞质GAPDH对线粒体血红素的结合使其能够在细胞中分布,我们试图揭示血红素如何到达GAPDH。利用两种人细胞系和一种其血红素结合可通过荧光追踪的GAPDH报告蛋白进行的实验表明,线粒体蛋白FLVCR1b与GAPDH结合的先升后降协同作用,为GAPDH提供血红素。FLVCR1b的缺失会减弱GAPDH与线粒体的结合,并阻止GAPDH和细胞血红素蛋白接收血红素。GAPDH获取血红素还需要TANGO2蛋白,后者与FLVCR1b相互作用,推测支持血红素输出。在分离的线粒体中,GAPDH与FLVCR1b结合,触发血红素释放并递送至客户血红素蛋白。将FLVCR1b确定为GAPDH的线粒体血红素来源,揭示了这种必需辅因子在真核细胞内到达多个蛋白质靶标的途径。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
线粒体产生的血红素如何到达胞质GAPDH,进而分配给其他血红素蛋白?
核心机制
线粒体膜蛋白FLVCR1b与TANGO2协同将线粒体血红素输出至胞质GAPDH;GAPDH与FLVCR1b的结合随血红素合成刺激而升高并随血红素装载而下降,GAPDH获取血红素后可将其递送至客户血红素蛋白。
主要证据
在HEK293T和HeLa细胞中,FLVCR1b敲低抑制线粒体血红素向HA-TC-GAPDH及下游sGCβ、IDO1的递送,回补可恢复;PLA和免疫共沉淀显示GAPDH-FLVCR1b结合动态变化;分离小鼠线粒体中GAPDH触发14C-血红素释放并递送至apo-sGCβ;TANGO2敲低抑制上述过程。
研究意义
揭示FLVCR1b是GAPDH的线粒体血红素来源,阐明了真核细胞内血红素从线粒体输出并广泛分配至多个蛋白质靶标的主要途径。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

FLVCR1b敲低与回补对GAPDH血红素装载的影响

验证FLVCR1b是否参与线粒体血红素向GAPDH的转移

在HEK293T和HeLa细胞中转染FLVCR1b siRNA,48 h后转染HA-TC-GAPDH等表达质粒,加入δ-ALA/Fe刺激线粒体血红素合成,用FlAsH荧光监测GAPDH血红素结合;在HEK293T中回补FLVCR1b表达。

2

FLVCR1b敲低对下游血红素蛋白血红素递送的影响

验证GAPDH获取线粒体血红素后向下游客户蛋白递送是否依赖FLVCR1b

在FLVCR1b敲低的HEK293T细胞中表达TC-sGCβ和IDO1,加入δ-ALA/Fe后检测FlAsH-TC-sGCβ荧光变化和IDO1酶活(L-Trp转化为L-犬尿氨酸)及14C-血红素含量。

3

FLVCR1b的线粒体膜定位分析

确定FLVCR1b在线粒体外膜和/或内膜的定位

分离小鼠脑和肝线粒体,进行蛋白酶K处理和线粒体亚组分分离,Western blot检测FLVCR1b、TOM70(外膜标志)和COX4(内膜标志)。

4

GAPDH与FLVCR1b结合的动态分析

验证线粒体血红素输出过程中GAPDH与FLVCR1b是否发生动态结合

在HEK293T和HeLa细胞中加入δ-ALA/Fe刺激后,用PLA和免疫共沉淀检测GAPDH-FLVCR1b结合在0、15、30、45、60、120 min的变化;并用GAPDH与己糖激酶1的PLA检测GAPDH与线粒体表面的结合。

5

分离线粒体中GAPDH诱导的血红素输出与递送

在重构体系中验证GAPDH与FLVCR1b结合触发线粒体血红素释放并递送至客户蛋白

分离小鼠脑和肝线粒体,与无细胞器的HEK293T细胞质及δ-ALA/ADP孵育进行体外血红素合成,重分离后加入纯化GAPDH或GST,检测14C-血红素释放;加入FlAsH-HA-TC-GAPDH检测血红素结合;加入GAPDH和FlAsH-apo-TC-sGCβ检测血红素递送。

6

TANGO2在FLVCR1b介导的血红素输出中的作用

验证TANGO2是否参与FLVCR1b向GAPDH的血红素转移

在HEK293T细胞中敲低TANGO2,检测线粒体血红素向HA-TC-GAPDH、TC-sGCβ和IDO1的递送;用PLA检测GAPDH-FLVCR1b结合及TANGO2-FLVCR1b结合;用TANGO2敲低细胞的胞质与分离线粒体孵育,检测GAPDH-FLVCR1b结合和血红素向HA-TC-GAPDH的转移。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Dulbecco改良Eagle培养基ATCC30-2002
胎牛血清Gibco--
Lipofectamine 2000转染试剂Invitrogen11668019
FLVCR1b siRNADharmaconCTM840033
GAPDH siRNADharmaconD-001830-02-20
PGRMC2 siRNASanta Cruzsc-88944
TANGO2 siRNASigmaEHU064871
FlAsH-EDT2荧光染料Cayman Chemicals20704
抗FLVCR1b抗体Novus BiologicalsNB100-1481
抗FLVCR1a抗体Proteintech26841-1-AP
抗PGRMC2抗体Santa Cruzsc-374624
抗TANGO2抗体Proteintech27846-1-AP
抗GAPDH抗体Cell Signaling2118S
抗HADHA抗体Santa Cruzsc-374497
抗鸟苷酸环化酶β1(ER-19)抗体SigmaG4405
抗αβ-肌动蛋白抗体Santa Cruzsc-47778
抗HA抗体Cell Signaling3724S
抗FLAG抗体SigmaF1804
抗TOM70抗体Cell Signaling65619S
抗COX IV抗体Cell Signaling4844S
山羊IgG同型对照Thermo Scientific02-6202
抗α-微管蛋白抗体Proteintech66031-1-Ig
HRP标记抗小鼠二抗Bio-Rad170-6516
HRP标记抗兔二抗Bio-Rad1706515
HRP标记抗山羊二抗Bio-Rad1721034
ECL化学发光底物Thermo Scientific32106
Protein G琼脂糖珠Cytiva17061801
PVDF膜Bio-Rad1620177
黑色壁96孔板Greiner Bio-One655090
SYNERGY H1酶标仪BioTek--
Bradford试剂Bio-Rad500-0006
DC蛋白测定试剂盒Bio-Rad5000111
Percoll密度梯度介质Sigma AldrichP1644
蛋白酶KThermo Fischer ScientificEO0491
二磷酸腺苷SigmaA2754
L-犬尿氨酸标准品SigmaK8625
Duolink原位检测试剂Sigma AldrichDUO92013
抗兔MINUS探针Sigma AldrichDUO92005
抗山羊PLUS探针Sigma AldrichDUO92003
AlexaFluor 488抗小鼠二抗ThermoFisherA-21202
Duolink原位洗涤缓冲液ASigma AldrichDUO82046
连接缓冲液Sigma AldrichDUO82009
连接酶Sigma AldrichDUO82027
扩增缓冲液Sigma AldrichDUO82012
聚合酶Sigma AldrichDUO82028
洗涤缓冲液BSigma AldrichDUO82048
含DAPI的Duolink原位封片剂Sigma AldrichDUO82040

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
FLVCR1b敲低与回补
siRNA终浓度100 nM、处理48 h;回补质粒转染时间与剂量
阅读提示:Methods中Transfection of siRNA and gene silencing及Figure 1 legend
δ-ALA/Fe刺激线粒体血红素合成
δ-ALA 1 mM与柠檬酸铁100 μM的配制及加入时间
阅读提示:Methods中Live cell heme binding kinetics及Figure 1 legend
FlAsH荧光动力学检测
FlAsH-EDT2 5 μM标记30 min;激发508 nm/发射528 nm;检测温度37 °C
阅读提示:Methods中Live cell heme binding kinetics
PLA检测GAPDH-FLVCR1b结合
抗体稀释比例、PLA时间点0–120 min、背景对照设置
阅读提示:Methods中Proximity ligation assay及Figure 2 legend
分离线粒体血红素释放实验
线粒体5 mg蛋白、GAPDH或GST 20 μM、14C-δ-ALA 10 μM、孵育时间0–60 min
阅读提示:Methods中14C-heme efflux from purified mitochondria及Figure 3 legend
TANGO2敲低实验
TANGO2 siRNA处理48 h;对GAPDH-FLVCR1b结合及下游递送的检测条件
阅读提示:Methods中Transfection of siRNA and gene silencing及Figure 4 legend