生物传感器设计与构建
构建基于FRET、BRET和cpGFP的APLNR构象生物传感器,并比较其性能。
将mCitrine或cpGFP插入APLNR胞内环3的四个位点(F233、R234、K235、E236);FRET/BRET传感器C端截短至S343,cpGFP传感器保留全长C端;cpGFP两侧带LSSLI和NHDQL连接序列。
In vivo measurement of an Apelin gradient with a genetically encoded APLNR conformation biosensor.
包含体外HEK293细胞系药理验证、信号通路分析及斑马鱼胚胎体内功能与机制验证
HEK293A/HEK293T细胞系 稳定表达APLNR-cpGFP的HEK293T细胞系 斑马鱼胚胎(包括转基因品系)
Apelin刺激浓度10 µM(FRET/BRET/cpGFP初筛) Apelin和Apela的EC50值及ML-221的IC50/Ki值 斑马鱼热激诱导配体过表达时间:5.5 hpf热激30 min,6 hpf成像;或27 hpf热激45 min,28 hpf成像 斑马鱼胚胎mRNA注射量:APLNR(K235)-cpGFP 600 pg/胚胎,膜tomato 200 pg/胚胎 稳定细胞系筛选浓度:嘌呤霉素2 µg/ml两周后降至1 µg/ml
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建基于FRET、BRET和cpGFP的APLNR构象生物传感器,并比较其性能。
将mCitrine或cpGFP插入APLNR胞内环3的四个位点(F233、R234、K235、E236);FRET/BRET传感器C端截短至S343,cpGFP传感器保留全长C端;cpGFP两侧带LSSLI和NHDQL连接序列。
验证生物传感器对配体刺激的响应,并选择信噪比最优的传感器进行药理学表征。
在HEK293细胞中瞬时表达各传感器,用10 µM Apelin刺激,检测FRET比率、BRET比率或cpGFP荧光强度变化;对APLNR(F233)-cpGFP和APLNR(K235)-cpGFP进行Apelin和Apela的剂量响应实验及ML-221拮抗实验。
评估生物传感器在Gi1蛋白激活和Arrestin3招募方面的信号能力。
使用Gi1-CASE BRET传感器检测Apelin刺激下Gi1异三聚体解离;使用 bystander BRET和荧光成像检测Arrestin3招募。
验证生物传感器在体内响应配体激活并监测内源性Aplnr活性。
将APLNR(K235)-cpGFP mRNA与膜tomato mRNA共注射到单细胞期斑马鱼胚胎,利用热激诱导转基因品系过表达Apelin或Apela,共聚焦成像检测荧光变化;构建稳定转基因斑马鱼品系,在血管内皮细胞中表达生物传感器,比较ISV与DA/PCV的荧光强度;通过CRISPANT敲低apln/apela或热激过表达Apelin验证内源性活性。
测试生物传感器能否在体内测量Apelin配体浓度梯度。
在128细胞期将apln mRNA与Dextran-AF647共注射到单个卵裂球,6 hpf共聚焦成像,量化距Dextran阳性细胞不同距离细胞的cpGFP荧光强度。
开发比率型APLNR-cpGFP-mScarlet-I3生物传感器,以归一化表达水平差异。
将mScarlet-I3或p2A-mScarlet-I3融合到APLNR-cpGFP的C端,在HEK293A细胞中验证Apelin刺激下cpGFP/mScarlet-I3荧光比值变化,并注射到斑马鱼胚胎中比较ISV与DA/PCV的比值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 配体刺激 | [Pyr1]-Apelin-13 | BACHEM | 4029110 |
| Apela(19-32) | MedChemExpress | HY-P2106A | |
| 拮抗实验 | ML-221 | Cayman chemical | Cay27313 |
| 分子克隆 | Takara PrimeStar聚合酶 | Takara | R045 |
| ClonExpress超快速一步克隆试剂盒 | Vazyme | C116 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 31966047 |
| 青霉素-链霉素混合液 | Gibco | 15140-122 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| BRET检测 | furimazine储备液 | Promega | N1662 |
| 活细胞ELISA | 多克隆兔抗HA抗体 | Proteintech | #51064-2-AP |
| HRP标记的多克隆猪抗兔HRP抗体 | Dako | P0399; Lot #20058714 | |
| BMG ClarioStar Plus酶标仪 | BMG | -- | |
| Arrestin3招募BRET | 6H-F-腔肠素 | -- | -- |
| Tecan Spark 20 M酶标仪 | Tecan | -- | |
| 细胞转染 | Effectene转染试剂 | Qiagen | -- |
| 共聚焦成像 | Leica SP5共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| mRNA合成 | mMESSAGE mMACHINE SP6转录试剂盒 | Invitrogen | AM1340 |
| 斑马鱼注射 | Dextran-AlexaFluor647(10 kDa) | Invitrogen | D22914 |
| 斑马鱼麻醉 | 三卡因 | Sigma Aldrich | E10521 |
| 共聚焦成像 | Leica Stellaris 8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 整体成像 | Nikon SMZ18体视显微镜 | Nikon | -- |
| CRISPR/Cas9 | Cas9蛋白 | IDT | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外药理学验证 | Apelin和Apela的刺激浓度、EC50测定范围及ML-221的IC50/Ki值;细胞系(HEK293A vs HEK293T)和转染方式(瞬时 vs 稳定) 阅读提示:Methods中“APLNR-cpGFP measurements”和“Agonists and antagonists”小节;Fig. 2图注 |
| 斑马鱼体内配体过表达实验 | 热激时间(5.5 hpf 30 min或27 hpf 45 min)、成像时间(6 hpf或28 hpf)、mRNA注射量(APLNR(K235)-cpGFP 600 pg,膜tomato 200 pg) 阅读提示:Methods中“mRNA synthesis and microinjections”和“Tg(hsp70l:apln) or Tg(hsp70l:apela) overexpression”小节;Fig. 4和Fig. 5图注 |
| 斑马鱼CRISPANT实验 | crRNA浓度(apln 2.5 fmol,apela 0.625 fmol)、Cas9浓度(5 µM)、注射体积(文中未明确说明) 阅读提示:Methods中“crRNA design”小节;Fig. 5e,f图注 |
| Apelin梯度测量实验 | apln mRNA注射量(200 pg)、Dextran-AF647注射量(1 ng)、注射时期(128细胞期)、成像时间(6 hpf) 阅读提示:Methods中“mRNA synthesis and microinjections”小节;Fig. 6图注 |
| 比率型生物传感器体内验证 | 质粒注射量(40 pg)、tol2 mRNA量(30 pg)、成像时间(28 hpf) 阅读提示:Methods中“mRNA synthesis and microinjections”小节;Fig. 7e图注 |