玻璃表面修饰与病毒固定
建立稳定的病毒-细胞界面以延长观察时间
清洗活化玻片,用硅烷-PEG5000-NHS与硅烷-PEG200以1:1混合修饰,将荧光标记的IAV与0.5 mM cRGD混合后固定于玻片,并验证病毒颗粒完整性和固定效率。
Single influenza A viruses induce nanoscale cellular reprogramming at the virus-cell interface.
体外细胞模型结合单分子超分辨成像验证受体动力学、内吞蛋白招募和肌动蛋白重塑,但无动物或患者样本验证。
A549人肺上皮细胞(野生型及表达EGFR-GFP/mEos3.2的衍生细胞) MDA-MB-231细胞(表达AP2-RFP和ClC-GFP) 固定在玻璃表面的甲型流感病毒A/Puerto Rico/8/34 (H1N1)
病毒固定:DiD标记IAV与0.5 mM cRGD混合,在硅烷-PEG-NHS修饰玻片上4°C孵育16小时或室温1小时 细胞接种:每腔室25,000个细胞,接种于固定病毒上 唾液酸酶处理:250 mU/ml sialidase处理1小时 sptPALM成像:每个细胞采集10,000帧,分析病毒周围800×800 nm区域内EGFR扩散系数 STORM成像:使用phalloidin-A647标记F-actin,在光切换缓冲液中成像
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立稳定的病毒-细胞界面以延长观察时间
清洗活化玻片,用硅烷-PEG5000-NHS与硅烷-PEG200以1:1混合修饰,将荧光标记的IAV与0.5 mM cRGD混合后固定于玻片,并验证病毒颗粒完整性和固定效率。
使细胞在固定病毒上方生长以形成病毒-细胞界面
将A549细胞接种于固定有病毒的玻片上,利用cRGD促进细胞粘附,通过共聚焦显微镜确认细胞位于病毒上方。
验证IAV是否通过唾液酸依赖方式招募EGFR并改变其移动性
在表达EGFR-GFP或EGFR-mEos3.2的A549细胞上,用TIRF和sptPALM成像,分析病毒周围EGFR的积累、扩散系数和固定比例,并用唾液酸酶处理验证依赖性。
验证固定病毒是否诱导内吞机器组分的局部招募
在表达epsin1-GFP的A549细胞或表达AP2-RFP和ClC-GFP的MDA-MB-231细胞上,用活细胞TIRF成像,量化病毒位点共定位和信号波动频率。
探究病毒结合位点肌动蛋白细胞骨架的局部重组
固定细胞用phalloidin-A647染色后进行STORM成像,活细胞表达LifeAct-GFP进行TIRF延时成像,分析病毒周围F-actin结构变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒标记 | DiD荧光染料 | Invitrogen | V22889 |
| DiO荧光染料 | Invitrogen | V22889 | |
| DiI荧光染料 | Invitrogen | V22889 | |
| 病毒纯化 | NAP-5凝胶过滤柱 | Cytiva | 17-0853-01 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 10566016 |
| 胎牛血清 | Capricorn | FBS-LE-12A | |
| 嘌呤霉素 | Gibco | A1113803 | |
| DMEM/F-12培养基 | Gibco | 10565018 | |
| 细胞传代 | 0.5%胰蛋白酶/EDTA | Gibco | 25300054 |
| 细胞饥饿 | 无FCS无酚红培养基 | Gibco | 31053028 |
| 唾液酸酶处理 | 唾液酸酶 | Roche | 11585886001 |
| 病毒固定 | 硅烷-PEG5000-NHS | tebu-bio | -- |
| 硅烷-PEG2000 | tebu-bio | -- | |
| 细胞粘附 | 环状RGD肽 | MedChemExpress | HY-P0023 |
| 荧光微球 | TetraSpeck荧光微球 | Invitrogen | T7279 |
| 免疫染色 | 抗NP抗体 | Merck | MAB8257 |
| 抗H1抗体 | Thermo Fischer | PA534929 | |
| F-actin染色 | 鬼笔环肽-A647 | Thermo Fisher | A22287 |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| 质粒 | psPAX2包装质粒 | Addgene | #12260 |
| pMD2.G包膜质粒 | Addgene | #12259 | |
| pLVX-M-puro载体 | Addgene | #125839 | |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | TR-1003-G |
| 细胞粘附实验 | Hoechst染料 | -- | -- |
| 活细胞成像 | Epsin1-GFP质粒 | addgene | #22228 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒固定 | 硅烷-PEG5000-NHS与硅烷-PEG200混合比例(1:1)、病毒孵育温度和时间(4°C 16小时或室温1小时)、cRGD浓度(0.5 mM) 阅读提示:Methods: Glass slide preparation, Virus labeling and sample chamber preparation; Fig. 1b |
| 唾液酸酶处理 | 唾液酸酶浓度(250 mU/ml)、处理时间(1小时)、处理阶段(饥饿培养基中) 阅读提示:Methods: Cell lines and culture; Fig. 2d |
| sptPALM成像与分析 | 采集帧数(10,000帧)、积分时间(30 ms)、扩散系数计算区域(病毒周围800×800 nm)、不移动受体阈值(D1-3 < 0.01 µm²/s) 阅读提示:Methods: sptPALM; Fig. 2d |
| 内吞蛋白招募成像 | 细胞类型(A549表达epsin1-GFP或MDA-MB-231表达AP2-RFP/ClC-GFP)、成像时长(10分钟)、共定位量化方法 阅读提示:Methods: Live cell CME visualization; Fig. 3b, d |
| F-actin STORM成像 | phalloidin-A647浓度(0.56 µM)、孵育时间(2小时)、STORM缓冲液组分及浓度 阅读提示:Methods: F-actin labeling and imaging; Fig. 4b |