验证sEV亚型存在
确认肿瘤细胞来源sEV存在分子组成偏倚的亚型
构建表达mGFP或Halo7标记的四跨膜蛋白(CD9、CD63、CD81)的PC-3和4175-LuT细胞,收集sEV,TIRFM单分子成像和双色共定位分析
Uptake of small extracellular vesicles by recipient cells is facilitated by paracrine adhesion signaling.
多细胞系体外模型,单分子/超分辨成像、生化验证及多种抑制剂功能验证机制链路
PC-3人前列腺癌细胞来源sEV与PZ-HPV-7正常前列腺细胞 4175-LuT人乳腺癌细胞来源sEV与WI-38人肺成纤维细胞 MSC来源sEV与多种受体细胞
sEV浓度:5×10^10 particles/mL(单颗粒追踪)或5.0×10^9 particles/mL(Ca2+成像) 抑制剂处理:PP2/PP3 10 μM 10 min;U73122/U73343 6 μM 15 min;2-APB 10 μM 10 min;FK506 10 μM;Dynasore 70 μM 30 min;TD-139 10 μM 30 min 受体细胞过表达显性负性突变体:dynamin DN、talin-1 DN sEV标记:Halo7-tag与TMR/SF650T/SF650B配体共价标记 检测终点:sEV内化荧光强度、Ca2+信号归一化、FAK-Y861磷酸化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认肿瘤细胞来源sEV存在分子组成偏倚的亚型
构建表达mGFP或Halo7标记的四跨膜蛋白(CD9、CD63、CD81)的PC-3和4175-LuT细胞,收集sEV,TIRFM单分子成像和双色共定位分析
比较不同亚型的直径和膜堆积特性
负染TEM、qNano、dSTORM测量直径;ApoC-TAMRA和α-synuclein(p2-23)-TAMRA探针检测膜缺陷
确定sEV内化是否依赖dynamin及内吞途径
单颗粒追踪sEV在细胞膜上的3D轨迹;过表达dynamin DN或Dynasore处理;pHrodo-dextran共定位
直接观察sEV与网格蛋白非依赖内吞区和小窝的共定位
PALM电影观察AP2α、CAV1、LAMP-2C标记的膜内陷,同时单颗粒追踪sEV;galectin-3抑制剂处理
验证sEV下方整合素β1和talin-1簇形成及下游信号
单分子成像整合素β1、talin-1、GPI、PLCγ2、FAK;Ca2+成像;抑制剂和显性负性突变体
确定Ca2+-钙调磷酸酶-dynamin轴促进sEV内化
抑制剂处理后检测sEV和dextran摄取;FK506处理并检测Ca2+响应
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | HAM F12培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | -- | |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 角质形成细胞无血清培养基 | Gibco | -- | |
| 牛垂体提取物 | Gibco | -- | |
| 人重组表皮生长因子 | Gibco | -- | |
| MSCGM培养基 | Lonza | PT-3238 | |
| MSCGM补充剂和生长因子 | Lonza | PT-4105 | |
| 质粒构建 | NEBuilder HiFi DNA组装系统 | New England Biolabs | -- |
| 转染 | 4D核转染仪 | LONZA | -- |
| SF缓冲液 | LONZA | -- | |
| SE缓冲液 | LONZA | -- | |
| 稳定细胞系筛选 | G418 | Nacalai Tesque | -- |
| 杀稻瘟菌素 | Invitrogen | -- | |
| 流式分选 | BD FACSMelody流式细胞仪 | BD | -- |
| sEV标记 | HaloTag TMR配体 | Promega | -- |
| HaloTag SF650T配体 | Goryo Chemical | -- | |
| HaloTag SF650B配体 | Goryo Chemical | -- | |
| sEV分离 | Centricon Plus 100 K超滤管 | Millipore | -- |
| Tim-4亲和珠 | Fujifilm Wako Chemical Co. | -- | |
| himac CF16RN离心机 | -- | -- | |
| himac CS100FNX超速离心机 | -- | -- | |
| 透射电镜 | JEM-2100F透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| qNano | qNano可调电阻脉冲传感仪 | Izon Science | -- |
| NP100孔 | Izon Science | -- | |
| 聚苯乙烯校准珠 | Izon Science | CPC100 | |
| Western blot | BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Bolt Bis-Tris Plus凝胶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Precision Plus Protein预染标准品 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| Blocking One封闭液 | Nacalai Tesque | -- | |
| 抗CD63抗体 | Cosmo Bio | SHI-EXO-M02 | |
| 抗CD81抗体 | Santa Cruz | sc-166029 | |
| 抗CD9抗体 | Abcam | ab263019 | |
| 抗GFP抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4301138 | |
| 抗Halo抗体 | Promega | G9281 | |
| 抗β-actin抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA1-140 | |
| HRP标记山羊抗小鼠IgG | Millipore | 12-349 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | Sigma-Aldrich | A0545 | |
| HRP标记驴抗兔IgG | Cytiva | NA934 | |
| ECL prime试剂 | GE Healthcare | -- | |
| FUSION-SOLO.7S成像系统 | Vilber-Loumat | -- | |
| 抗FAK抗体 | Abcam | ab40794 | |
| 抗pY861FAK抗体 | Invitrogen | 44-626 G | |
| 抗CD29抗体 | BD Biosciences | 610467 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白G偶联Dynabeads | Invitrogen | -- |
| 免疫荧光 | 小鼠抗活性整合素β1抗体(HUTS-4) | Millipore | -- |
| 小鼠抗talin 1抗体 | GeneTEX | 97H6 | |
| Alexa488标记小鼠IgG二抗 | Abcam | ab150077 | |
| 兔多克隆抗Halo抗体 | Promega | G928A | |
| 罗丹明标记兔IgG二抗 | Cappel | 55666 | |
| 小鼠caveolin-1抗体(克隆2297) | BD Biosciences | -- | |
| 抗galectin-3单克隆抗体(eBioM3/38) | eBioscience | -- | |
| Alexa Fluor 488标记大鼠IgG二抗 | Thermo Fisher Scientific | A21208 | |
| 抑制剂处理 | PP2 | Tokyo Kasei Kogyo | 529573 |
| PP3 | Tokyo Kasei Kogyo | 5334-30-5 | |
| 2-APB | Wako | -- | |
| U73122 | Cayman Chemical | -- | |
| U73343 | Cayman Chemical | -- | |
| FK506 | Wako | 06306071 | |
| Dynasore | Cell Signaling Technology | 46240 | |
| TD-139 | Selleck | -- | |
| sEV浓度校准 | 抗CD63 IgG抗体(8A12) | Cosmo bio | -- |
| 酪蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| sEV标记 | ExoSparkler外泌体膜标记试剂盒-Deep Red | Dojindo | -- |
| 显微镜成像 | Olympus IX-83显微镜 | Olympus | -- |
| 高速门控图像增强器 | Hamamatsu Photonics | -- | |
| sCMOS相机 | Hamamatsu Photonics | -- | |
| Nikon Ti倒置显微镜 | Nikon | -- | |
| qCMOS相机 | Hamamatsu Photonics | -- | |
| 荧光标记 | Cy3-DOPE | -- | -- |
| SF650T标记人转铁蛋白 | Protein tech | HZ-1317 | |
| SaraFluor650T NHS酯 | Goryo Chemical | -- | |
| NAP-5柱 | Cytiva | -- | |
| 钙成像 | Fluo8-H AM | AAT Bioquest | -- |
| 离子霉素 | Fujifilm Wako Chemical Co. | -- | |
| 溶酶体标记 | SiR-溶酶体探针 | Spirochrome | -- |
| 3D超分辨成像 | TetraSpeck微球 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Nano Z100压电载物台 | Mad City Labs | -- | |
| 脂质体制备 | 二肉豆蔻酰磷脂酰胆碱 | Avanti Polar Lipids, Inc. | -- |
| LiposoFast挤出器 | Avestin | -- | |
| 共聚焦显微镜 | FV1000-D共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| sEV亚型验证 | sEV标记蛋白表达水平:外源CD9/CD81约0.2倍内源,CD63约0.5倍内源;Halo7-TMR标记效率 阅读提示:Methods 'Isolation of sEVs from the cell culture supernatant' 及 Fig. 1c |
| sEV内化途径观察 | sEV浓度5×10^10 particles/mL;受体细胞密度1.0×10^6 cells;PALM成像参数5 ms/帧、5008帧 阅读提示:Methods 'Simultaneous dual-color observation of PALM movies...' 及 Fig. 3a-c |
| 抑制剂处理 | PP2/PP3 10 μM 10 min;U73122 6 μM 15 min;2-APB 10 μM 10 min;FK506 10 μM;Dynasore 70 μM 30 min;TD-139 10 μM 30 min 阅读提示:Methods 'Cell treatments with various reagents' |
| Ca2+成像 | Fluo-8H AM 5 μM 30 min;sEV浓度5.0×10^9 particles/mL;ionomycin 1 μM归一化 阅读提示:Methods 'Intracellular Ca2+ imaging' 及 Fig. 7 |
| sEV摄取定量 | sEV浓度5×10^9 particles/mL;观察时间30 min;pHrodo-dextran存在 阅读提示:Methods 'Determination of the number of sEVs bound to cell plasma membranes' 及 Fig. 8a-c |