KMT5C调控肝糖异生的非催化机制

Non-catalytic mechanisms of KMT5C regulating hepatic gluconeogenesis.

作者信息Qingwen Zhao, Xuan Cui, Qi Zhu, Feiyan Li, Ran Bao, Ting Shi, Haojie Liu, Wenjing Lv, Yingjiang Xu, Yue Gao, Qi-Qun Tang, Min Zhang, Dongning Pan
PMID39929827
发布时间2025-02-10
DOI10.1038/s41467-025-56696-y

实验完整度

高

含体外原代肝细胞、肝特异敲除小鼠、AAV过表达、糖尿病模型及患者肝样本,并有功能与机制验证

主要模型

小鼠原代肝细胞 肝特异性Kmt5c敲除小鼠 db/db与高脂饮食小鼠模型 2型糖尿病患者肝样本

重点核对

肝特异性Kmt5c敲除小鼠禁食24 h后空腹血糖及糖异生基因蛋白水平 原代肝细胞以丙酮酸/乳酸或甘油为底物的葡萄糖产生 KMT5C G140Y/W174A催化失活突变体与A-196抑制剂对糖异生的影响 AAV8-TBG介导肝内KMT5C或Mut过表达的PTT与GcTT MG132处理后PGC-1α泛素化水平及CHX追踪的半衰期

摘要

赖氨酸甲基转移酶KMT5C催化组蛋白H4第20位赖氨酸三甲基化(H4K20me3)的形成,该表观遗传标记通常与基因抑制及异染色质维持相关。KMT5C在多种组织中广泛表达,但其在肝脏中的功能作用尚未被探索。本研究发现Kmt5c是肝脏中受禁食和胰高血糖素诱导的基因,可调控肝糖异生。肝细胞中KMT5C缺失导致禁食期间糖异生基因表达下调和葡萄糖输出受损。KMT5C通过减少泛素化介导的PGC-1α降解来促进糖异生,这出乎意料地不依赖其甲基转移酶活性。实际上,KMT5C阻碍E3连接酶RNF34与PGC-1α C端结合及随后的泛素化相关降解。糖尿病小鼠模型和患者肝脏中KMT5C水平升高,敲低KMT5C可有益地降低糖异生和空腹血糖水平。总之,本研究通过影响PGC-1α稳定性,将KMT5C鉴定为肝糖异生调控因子。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
KMT5C在肝脏中是否调控肝糖异生,及其作用是否依赖甲基转移酶活性。
核心机制
KMT5C与E3泛素连接酶RNF34竞争结合PGC-1α C端(565-797氨基酸),减少PGC-1α泛素化及蛋白酶体降解,从而稳定PGC-1α并促进糖异生基因表达;该作用不依赖其甲基转移酶活性。
主要证据
原代肝细胞与肝特异性敲除小鼠中糖异生基因表达和葡萄糖输出下降;催化失活突变体及A-196处理显示不依赖甲基转移酶活性;共免疫沉淀、MST(Kd 1.733 μM)、泛素化与半衰期实验证明KMT5C竞争RNF34稳定PGC-1α;db/db小鼠和T2DM患者肝脏KMT5C升高。
研究意义
作者提出升高的KMT5C可能作为降低T2DM患者血糖的潜在治疗靶点,并提示靶向KMT5C-PGC-1α相互作用可能不影响H4K20me3水平而改善糖稳态。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

肝KMT5C表达与糖异生表型观察

确定KMT5C在肝脏的表达是否受禁食和肥胖状态调控。

检测禁食、再喂养及ob/ob、db/db、高脂饮食小鼠肝脏KMT5C与H4K20me3蛋白水平,并分离肝细胞与非实质细胞检测KMT5C分布。

2

KMT5C缺失对糖异生基因与葡萄糖输出的影响

验证KMT5C缺失是否削弱肝细胞糖异生。

在HepG2、原代肝细胞及肝特异性Kmt5c敲除小鼠中检测糖异生基因表达与葡萄糖产生。

3

体内肝特异性敲除的糖异生功能验证

在生理条件下验证肝KMT5C缺失对血糖和糖异生的影响。

对肝特异性Kmt5c敲除小鼠进行禁食血糖测定、PTT、GlTT、GcTT及激素水平检测。

4

甲基转移酶活性非依赖性验证

判断KMT5C促糖异生是否依赖其催化活性。

比较KMT5C与催化失活突变体G140Y/W174A过表达效果,并用A-196抑制甲基转移酶活性,结合ChIP检测启动子结合与H4K20me3富集。

5

PGC-1α稳定性与泛素化机制验证

阐明KMT5C调控PGC-1α蛋白水平的机制。

检测PGC-1α蛋白与mRNA水平、共免疫沉淀、MST测定结合亲和力、MG132处理及CHX追踪泛素化和半衰期。

6

RNF34竞争结合机制验证

验证KMT5C是否通过竞争RNF34结合PGC-1α C端发挥作用。

截短体免疫共沉淀定位结合区域,敲低RNF34检测PGC-1α水平、葡萄糖输出及体内糖异生。

7

糖尿病模型与患者样本验证

评估KMT5C在糖尿病状态下对糖异生的作用及临床相关性。

在db/db小鼠和高脂饮食小鼠中敲低或敲除KMT5C,检测血糖、耐受试验及糖异生基因;分析T2DM患者肝样本KMT5C水平与空腹血糖相关性。

8

CREB1-CRTC2转录调控Kmt5c

确定禁食和胰高血糖素诱导Kmt5c表达的转录机制。

检测禁食不同时间Kmt5c mRNA,ChIP检测CREB1结合Kmt5c启动子,并干扰Creb1或Crtc2检测Kmt5c表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
甘油三酯检测试剂盒ApplygenE1025
胰岛素ELISA试剂盒Mercodia10-1113-01
皮质酮ELISA试剂盒Nanjing JianchengH205-1-1
胰高血糖素ELISA试剂盒Sangon biotechHY-P0082
游离脂肪酸检测试剂盒Nanjing JianchengA042-2-1
甘油检测试剂盒Nanjing JianchengF005-1-1
组蛋白提取试剂盒EpiQuikOP-0006-100
去内毒素试剂盒VazymeDC202
胶原酶SigmaC5138
鼠尾胶原CorningC5138
胎牛血清Hyclone#30396.03
青霉素/链霉素Hyclone#SV30010
PGC-1α抗体NovusNBP1-04676
Flag磁珠Smart-LifesciencesSA068001
HA磁珠Smart-LifesciencesSA042001
Ni-NTA磁珠Smart Life SciencesSA004005
10 kDa离心过滤器MerkUFC9010
红色-tris-NTA第二代His标签标记试剂盒NanoTemper#MO-L018
毛细管NanoTemper#MO-K022
Monolith X仪器NanoTemper--
PEI转染试剂Life-iLabAC04L091
双荧光素酶报告基因检测系统BeyotimeRG029
葡萄糖检测试剂盒ApplygenE1010
H4K20me3抗体Abcamab9053
KMT5C抗体Abcamab91224
HA抗体Santa Cruzsc-805X
正常兔IgGSigma--
QIAquick PCR纯化试剂盒Qiagen--
超声破碎仪Cole Parmer--
BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0011
抗HSP90抗体Proteintech13171-AP
抗PGC-1α抗体Proteintech66369-1-Ig
抗PC抗体Proteintech16588-1-AP
抗Flag抗体Proteintech66008-2-Ig
抗α-Tubulin抗体Proteintech66031-1-Ig
抗组蛋白H4抗体Proteintech16047-1-AP
抗泛素抗体Proteintech10201-2-AP
抗KMT5C抗体AbclonalWH140428
抗FOXO1抗体AbclonalA25985
抗CREB1抗体AbclonalA11064
抗PCK1抗体AbclonalA2036
抗G6PC抗体AbclonalA16234
抗ACLY抗体AbclonalA22273
抗RNF34抗体Novus bioNBP2-56413
抗HNF-4α抗体Santa Cruzsc-374229
抗CRTC2抗体Santa Cruzsc-271912
抗PPARα抗体abcamab314112
抗H4K20me3抗体active motif39672
抗兔IgG二抗VazymeRA1008
抗鼠IgG二抗VazymeRA1009
Trizol试剂Vazyme#R401-01
HiScript II Q RT SuperMixVazymeR222-01
SYBR Green SuperMixVazyme#Q711
A-196MCEHY-100201
0.22 μM滤器millipore--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
肝KMT5C表达与糖异生表型
小鼠品系、性别、周龄、禁食与再喂养时间、肥胖模型(HFD 12周)
阅读提示:Fig. 1a–d图注与Methods动物研究小节
原代肝细胞糖异生功能
原代肝细胞分离方法、Cre或Kmt5c慢病毒/腺病毒处理时间、胰高血糖素浓度与处理时间、底物种类及浓度
阅读提示:Fig. 1f–k、Fig. 3a–d图注与Methods肝细胞分离培养及肝葡萄糖产生实验小节
体内糖异生耐受试验
禁食时长、注射剂量(葡萄糖、丙酮酸钠、甘油、胰高血糖素、胰岛素)、各模型剂量差异
阅读提示:Methods中GTT、PTT、GlTT、GcTT、ITT小节
甲基转移酶活性非依赖性验证
KMT5C Mut(G140Y/W174A)、A-196剂量与处理时间、AAV8注射剂量与检测时间点
阅读提示:Fig. 3图注与Methods腺相关病毒、腺病毒和慢病毒小节
PGC-1α泛素化与半衰期机制
MG132浓度与处理时间、CHX浓度、免疫沉淀条件、MST蛋白浓度
阅读提示:Fig. 4、Fig. 5图注与Methods免疫沉淀、微量热泳动小节
RNF34竞争结合机制
PGC-1α C端截短体片段、shRNF34序列、AAV8-TBG-shRNF34注射后检测时间
阅读提示:Fig. 5图注与Methods质粒及病毒小节
糖尿病模型与患者样本
db/db小鼠周龄与腺病毒注射方案、HFD喂养时间、患者纳入排除标准、样本量
阅读提示:Fig. 6图注、Methods动物研究与人体研究小节以及Supplementary Table 1
CREB1-CRTC2转录调控Kmt5c
禁食时间点、shRNA序列、 hydrodynamic尾静脉注射质粒剂量与体积
阅读提示:Fig. 7图注与Methods动物研究、质粒小节