肝KMT5C表达与糖异生表型观察
确定KMT5C在肝脏的表达是否受禁食和肥胖状态调控。
检测禁食、再喂养及ob/ob、db/db、高脂饮食小鼠肝脏KMT5C与H4K20me3蛋白水平,并分离肝细胞与非实质细胞检测KMT5C分布。
Non-catalytic mechanisms of KMT5C regulating hepatic gluconeogenesis.
含体外原代肝细胞、肝特异敲除小鼠、AAV过表达、糖尿病模型及患者肝样本,并有功能与机制验证
小鼠原代肝细胞 肝特异性Kmt5c敲除小鼠 db/db与高脂饮食小鼠模型 2型糖尿病患者肝样本
肝特异性Kmt5c敲除小鼠禁食24 h后空腹血糖及糖异生基因蛋白水平 原代肝细胞以丙酮酸/乳酸或甘油为底物的葡萄糖产生 KMT5C G140Y/W174A催化失活突变体与A-196抑制剂对糖异生的影响 AAV8-TBG介导肝内KMT5C或Mut过表达的PTT与GcTT MG132处理后PGC-1α泛素化水平及CHX追踪的半衰期
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定KMT5C在肝脏的表达是否受禁食和肥胖状态调控。
检测禁食、再喂养及ob/ob、db/db、高脂饮食小鼠肝脏KMT5C与H4K20me3蛋白水平,并分离肝细胞与非实质细胞检测KMT5C分布。
验证KMT5C缺失是否削弱肝细胞糖异生。
在HepG2、原代肝细胞及肝特异性Kmt5c敲除小鼠中检测糖异生基因表达与葡萄糖产生。
在生理条件下验证肝KMT5C缺失对血糖和糖异生的影响。
对肝特异性Kmt5c敲除小鼠进行禁食血糖测定、PTT、GlTT、GcTT及激素水平检测。
判断KMT5C促糖异生是否依赖其催化活性。
比较KMT5C与催化失活突变体G140Y/W174A过表达效果,并用A-196抑制甲基转移酶活性,结合ChIP检测启动子结合与H4K20me3富集。
阐明KMT5C调控PGC-1α蛋白水平的机制。
检测PGC-1α蛋白与mRNA水平、共免疫沉淀、MST测定结合亲和力、MG132处理及CHX追踪泛素化和半衰期。
验证KMT5C是否通过竞争RNF34结合PGC-1α C端发挥作用。
截短体免疫共沉淀定位结合区域,敲低RNF34检测PGC-1α水平、葡萄糖输出及体内糖异生。
评估KMT5C在糖尿病状态下对糖异生的作用及临床相关性。
在db/db小鼠和高脂饮食小鼠中敲低或敲除KMT5C,检测血糖、耐受试验及糖异生基因;分析T2DM患者肝样本KMT5C水平与空腹血糖相关性。
确定禁食和胰高血糖素诱导Kmt5c表达的转录机制。
检测禁食不同时间Kmt5c mRNA,ChIP检测CREB1结合Kmt5c启动子,并干扰Creb1或Crtc2检测Kmt5c表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肝组织甘油三酯检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Applygen | E1025 |
| 血清胰岛素检测 | 胰岛素ELISA试剂盒 | Mercodia | 10-1113-01 |
| 血清皮质酮检测 | 皮质酮ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng | H205-1-1 |
| 血清胰高血糖素检测 | 胰高血糖素ELISA试剂盒 | Sangon biotech | HY-P0082 |
| 血清游离脂肪酸检测 | 游离脂肪酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A042-2-1 |
| 血清甘油检测 | 甘油检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | F005-1-1 |
| 肝组织组蛋白提取 | 组蛋白提取试剂盒 | EpiQuik | OP-0006-100 |
| 质粒纯化 | 去内毒素试剂盒 | Vazyme | DC202 |
| 原代肝细胞分离 | 胶原酶 | Sigma | C5138 |
| 细胞培养 | 鼠尾胶原 | Corning | C5138 |
| 胎牛血清 | Hyclone | #30396.03 | |
| 青霉素/链霉素 | Hyclone | #SV30010 | |
| 免疫沉淀 | PGC-1α抗体 | Novus | NBP1-04676 |
| Flag磁珠 | Smart-Lifesciences | SA068001 | |
| HA磁珠 | Smart-Lifesciences | SA042001 | |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA磁珠 | Smart Life Sciences | SA004005 |
| 10 kDa离心过滤器 | Merk | UFC9010 | |
| 微量热泳动 | 红色-tris-NTA第二代His标签标记试剂盒 | NanoTemper | #MO-L018 |
| 毛细管 | NanoTemper | #MO-K022 | |
| Monolith X仪器 | NanoTemper | -- | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | PEI转染试剂 | Life-iLab | AC04L091 |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Beyotime | RG029 | |
| 葡萄糖产生检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Applygen | E1010 |
| ChIP | H4K20me3抗体 | Abcam | ab9053 |
| KMT5C抗体 | Abcam | ab91224 | |
| HA抗体 | Santa Cruz | sc-805X | |
| 正常兔IgG | Sigma | -- | |
| QIAquick PCR纯化试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 超声破碎 | 超声破碎仪 | Cole Parmer | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 |
| 抗HSP90抗体 | Proteintech | 13171-AP | |
| 抗PGC-1α抗体 | Proteintech | 66369-1-Ig | |
| 抗PC抗体 | Proteintech | 16588-1-AP | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-2-Ig | |
| 抗α-Tubulin抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 抗组蛋白H4抗体 | Proteintech | 16047-1-AP | |
| 抗泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| 抗KMT5C抗体 | Abclonal | WH140428 | |
| 抗FOXO1抗体 | Abclonal | A25985 | |
| 抗CREB1抗体 | Abclonal | A11064 | |
| 抗PCK1抗体 | Abclonal | A2036 | |
| 抗G6PC抗体 | Abclonal | A16234 | |
| 抗ACLY抗体 | Abclonal | A22273 | |
| 免疫沉淀 | 抗RNF34抗体 | Novus bio | NBP2-56413 |
| Western blot | 抗HNF-4α抗体 | Santa Cruz | sc-374229 |
| 抗CRTC2抗体 | Santa Cruz | sc-271912 | |
| 抗PPARα抗体 | abcam | ab314112 | |
| 抗H4K20me3抗体 | active motif | 39672 | |
| 抗兔IgG二抗 | Vazyme | RA1008 | |
| 抗鼠IgG二抗 | Vazyme | RA1009 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Vazyme | #R401-01 |
| HiScript II Q RT SuperMix | Vazyme | R222-01 | |
| SYBR Green SuperMix | Vazyme | #Q711 | |
| 药物处理 | A-196 | MCE | HY-100201 |
| 病毒浓缩 | 0.22 μM滤器 | millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 肝KMT5C表达与糖异生表型 | 小鼠品系、性别、周龄、禁食与再喂养时间、肥胖模型(HFD 12周) 阅读提示:Fig. 1a–d图注与Methods动物研究小节 |
| 原代肝细胞糖异生功能 | 原代肝细胞分离方法、Cre或Kmt5c慢病毒/腺病毒处理时间、胰高血糖素浓度与处理时间、底物种类及浓度 阅读提示:Fig. 1f–k、Fig. 3a–d图注与Methods肝细胞分离培养及肝葡萄糖产生实验小节 |
| 体内糖异生耐受试验 | 禁食时长、注射剂量(葡萄糖、丙酮酸钠、甘油、胰高血糖素、胰岛素)、各模型剂量差异 阅读提示:Methods中GTT、PTT、GlTT、GcTT、ITT小节 |
| 甲基转移酶活性非依赖性验证 | KMT5C Mut(G140Y/W174A)、A-196剂量与处理时间、AAV8注射剂量与检测时间点 阅读提示:Fig. 3图注与Methods腺相关病毒、腺病毒和慢病毒小节 |
| PGC-1α泛素化与半衰期机制 | MG132浓度与处理时间、CHX浓度、免疫沉淀条件、MST蛋白浓度 阅读提示:Fig. 4、Fig. 5图注与Methods免疫沉淀、微量热泳动小节 |
| RNF34竞争结合机制 | PGC-1α C端截短体片段、shRNF34序列、AAV8-TBG-shRNF34注射后检测时间 阅读提示:Fig. 5图注与Methods质粒及病毒小节 |
| 糖尿病模型与患者样本 | db/db小鼠周龄与腺病毒注射方案、HFD喂养时间、患者纳入排除标准、样本量 阅读提示:Fig. 6图注、Methods动物研究与人体研究小节以及Supplementary Table 1 |
| CREB1-CRTC2转录调控Kmt5c | 禁食时间点、shRNA序列、 hydrodynamic尾静脉注射质粒剂量与体积 阅读提示:Fig. 7图注与Methods动物研究、质粒小节 |