OA相关软骨细胞中UDP-GlcNAc转运蛋白表达分析
探究OA中UDP-GlcNAc转运蛋白的表达变化及其与胞质UDP-GlcNAc滞留的关系。
分析公共转录组数据集(人OA软骨、IL-1β处理软骨细胞、动物OA模型)中UDP-GlcNAc转运蛋白表达;在衰老软骨细胞中检测转运蛋白mRNA及UDP-GlcNAc的亚细胞分布。
Regulation of senescence-associated secretory phenotypes in osteoarthritis by cytosolic UDP-GlcNAc retention and O-GlcNAcylation.
包含人类OA软骨样本、多种小鼠OA模型、原代软骨细胞及细胞系,并有基因敲除、药物干预和机制验证(O-GlcNAcylation位点、自噬降解)
人OA软骨样本(女性患者) 小鼠原代软骨细胞 人软骨细胞系C28/I2 小鼠DMM诱导的创伤后OA模型
DMM手术诱导小鼠OA,术后6或8周评估 Gata4 fl/fl; Col2a1-CreERT2或Prg4-CreERT2小鼠经他莫昔芬诱导敲除 thiamet-G(20 nmol)或ST045849(2 nmol)关节腔内注射,每周一次 葡萄糖胺硫酸盐饮水补充5 mg/mL 细胞衰老诱导:多柔比星100 nM或2 μM?(文中0.2-1.0 μM处理14天),博来霉素50 μg/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究OA中UDP-GlcNAc转运蛋白的表达变化及其与胞质UDP-GlcNAc滞留的关系。
分析公共转录组数据集(人OA软骨、IL-1β处理软骨细胞、动物OA模型)中UDP-GlcNAc转运蛋白表达;在衰老软骨细胞中检测转运蛋白mRNA及UDP-GlcNAc的亚细胞分布。
验证衰老诱导的O-GlcNAcylation是否调控SASP而不影响衰老进入。
在衰老软骨细胞中检测全局O-GlcNAcylation水平;使用OGT抑制剂ST045849或OGA抑制剂thiamet-G调节O-GlcNAcylation,检测衰老标志物和SASP因子表达;通过GSEA分析转录组。
确定GATA4的O-GlcNAcylation位点及其对GATA4稳定性和转录活性的影响。
通过质谱鉴定GATA4 O-GlcNAcylation位点;构建S212A和S406A突变体;使用CHX追踪、免疫共沉淀和GATA报道基因试验验证O-GlcNAcylation对GATA4稳定性、与p62结合及转录活性的影响。
在体内验证软骨细胞中Gata4在OA发病中的作用。
构建他莫昔芬诱导的软骨细胞特异性Gata4敲除小鼠(Col2a1-CreERT2和Prg4-CreERT2),进行DMM手术诱导OA,评估关节病理、疼痛行为及分子变化。
验证调节O-GlcNAcylation水平对OA进展的治疗潜力。
关节腔内注射thiamet-G(增加O-GlcNAcylation)或ST045849(抑制OGT),评估OA表型和疼痛;使用葡萄糖胺补充实验验证过量底物对OA的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | 26140079 | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 两性霉素B | -- | -- | |
| 链霉蛋白酶 | Roche | 11459643001 | |
| 胶原酶 | Sigma Aldrich | C6885 | |
| I-S型透明质酸酶 | Sigma Aldrich | H3506 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| HEPES | -- | -- | |
| 诱导衰老 | 多柔比星 | Cayman | 15007 |
| 博来霉素 | -- | -- | |
| 过氧化氢 | Sigma Aldrich | H3410 | |
| 药物处理 | thiamet-G | Sigma Aldrich | SML0244 |
| ST045849 | Tim Tec | ST045849 | |
| 6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸 | Sigma Aldrich | D2141 | |
| NSC140905 | AA Blocks | AA01FPKH | |
| 诱导敲除 | 他莫昔芬 | Sigma Aldrich | T5648 |
| 玉米油 | Sigma Aldrich | C8267 | |
| 水凝胶制备 | 6-O-棕榈酰-L-抗坏血酸 | Sigma Aldrich | 76183 |
| 二甲基亚砜 | Sigma Aldrich | 276855 | |
| 免疫荧光 | 正常山羊血清 | Sigma Aldrich | S26 |
| DAPI | -- | -- | |
| ProLong Gold抗淬灭封片剂 | ThermoFisher Scientific | P10144 | |
| 免疫组化 | O-GlcNAc抗体(克隆RL2) | Abcam | ab2739 |
| p16INK4a抗体 | Proteintech | 10883-1-AP | |
| GATA4抗体(克隆G-4) | Santa Cruz | sc-25310 | |
| IL-6抗体(克隆1) | Santa Cruz | sc-130326 | |
| MMP3抗体(克隆EP1186Y) | Abcam | ab52915 | |
| MMP13抗体(克隆EP1263Y) | Abcam | ab51072 | |
| p16INK4a抗体(克隆EPR20418) | Abcam | ab211542 | |
| HMGB1抗体 | Abcam | ab18256 | |
| HGF抗体 | Novus | AF2207 | |
| CTX-II抗体 | Novus | NBP2-59386 | |
| NITEGE抗体(克隆BC-13) | MD Bioproducts | 1042003 | |
| ADAMTS5抗体 | Abcam | ab41037 | |
| 免疫印迹 | HA抗体 | Abcam | ab9110 |
| FLAG抗体(克隆M2) | Sigma Aldrich | F3165 | |
| vinculin抗体(克隆E1E9V) | Cell Signaling Technology | 13901 | |
| actin抗体(克隆C-11) | Santa Cruz | sc-1615 | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G-琼脂糖珠 | GE Healthcare | 17-5280-01 and 17-0618-01 |
| sWGA琼脂糖珠 | -- | -- | |
| UDP-GlcNAc测定 | MinuteTM内质网富集试剂盒 | Invent Biotechnologies | ER-036 |
| MinuteTM高尔基体富集试剂盒 | Invent Biotechnologies | GO-037 | |
| 细胞组分分离试剂盒-标准 | Abcam | ab109719 | |
| UDP-GlcNAc标准品 | Sigma Aldrich | U4375 | |
| sGAG测定 | 硫酸软骨素 | Tokyo Chemical Industry | C0335 |
| MTT | Goldbio | T-030-1 | |
| qRT-PCR | TRI试剂 | Molecular Research Center, Inc. | TR 118 |
| EasyScript逆转录酶 | TransGen Biotech | AE101-03 | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | ThermoFisher Scientific | 4367659 | |
| RNA测序 | TruSeq链特异性mRNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| Western blot检测 | SuperSignal West Dura延长Duration底物 | ThermoFisher Scientific | 34075 |
| SuperSignal West Femto最高灵敏度底物 | ThermoFisher Scientific | 34094 | |
| iBright FL1000成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 转染 | METAFECTENE PRO转染试剂 | Biontex | T040 |
| 聚乙烯亚胺 | -- | -- | |
| 报告基因实验 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1910 |
| BrdU实验 | BrdU | Sigma Aldrich | B9285 |
| BrdU抗体(克隆IIB5) | Santa Cruz | sc-32323 | |
| 蛋白质定量 | PierceTM BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFisher Scientific | 23225 |
| μCT分析 | 活体微型CT扫描仪 | Bruker | Skyscan 1276 |
| 行为学测试 | 大小鼠 incapacitance 仪 | IITC Life Science | 600MR |
| 动态足底触觉测量仪 | Ugo Basile | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞衰老诱导 | 多柔比星浓度(0.2、0.5、1.0 μM)和处理时间(14天);博来霉素浓度50 μg/mL处理24 h后培养5天;H2O2 100 μM处理5天;细胞类型(人原代软骨细胞、小鼠原代软骨细胞、C28/I2细胞系) 阅读提示:Methods部分“Cell culture and treatments”及图1、图2图注 |
| O-GlcNAcylation调控处理 | ST045849浓度20 μM处理72 h或5天;thiamet-G浓度10-20 μM处理48-60 h;葡萄糖胺硫酸盐浓度(2 mM用于细胞,5 mg/mL用于饮水) 阅读提示:Methods部分“Cell culture and treatments”及图2、图3、图6图注 |
| 小鼠OA模型与基因敲除 | DMM手术小鼠年龄(12或13周龄)、性别(雄性);他莫昔芬剂量80 μg/g体重连续5天;Gata4fl/fl; Col2a1-CreERT2和Prg4-CreERT2品系;术后6或8周评估 阅读提示:Methods部分“Mice”和“Experimental OA in mice” |
| 关节腔内药物注射 | thiamet-G剂量20 nmol/10 μL PBS每周一次共6周;ST045849剂量2 nmol在水凝胶中每周一次共8周;水凝胶组成(4% w/v 6-O-棕榈酰-L-抗坏血酸) 阅读提示:Methods部分“Experimental OA in mice” |
| UDP-GlcNAc测定 | 细胞处理条件(DON 100 μM或150 μM 24 h;多柔比星100 nM 4天;博来霉素50 μg/mL 24 h后5天);亚细胞分离试剂盒;检测方法(酶法) 阅读提示:Methods部分“Measurement of UDP-GlcNAc level” |