Ccdc57与运动纤毛相关性分析
确定Ccdc57是否与上皮运动纤毛相关。
分析小鼠气管上皮细胞ALI培养基因表达谱、免疫印迹检测组织表达,并进行进化分析和序列比对。
Directional ciliary beats across epithelia require Ccdc57-mediated coupling between axonemal orientation and basal body polarity.
包含体外培养mEPC/mTEC、离体室管膜/气管组织、Ccdc57−/−小鼠模型,以及3D-SIM、EM、活细胞成像和液体流动等功能验证。
小鼠室管膜多纤毛细胞(E1细胞) 体外培养小鼠室管膜多纤毛细胞(mEPC) 体外培养小鼠气管上皮多纤毛细胞(mTEC) Ccdc57−/−小鼠
Ccdc57−/−小鼠基因型鉴定及Ccdc57蛋白完全缺失验证 室管膜组织纤毛摆动方向、频率及液体流动的活细胞成像 基体极性(BF方向)与轴丝取向(AO)的EM/3D-SIM定量 Ccdc57−/−小鼠脑室扩大及脑积水严重程度评估 Ccdc57在基体远端旋转不对称定位的3D-SIM验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Ccdc57是否与上皮运动纤毛相关。
分析小鼠气管上皮细胞ALI培养基因表达谱、免疫印迹检测组织表达,并进行进化分析和序列比对。
确定Ccdc57在mEPC中的亚细胞定位及其与基体的关系。
在mEPC中免疫染色Ccdc57及Cep152、Centrin、Odf2等标志物,使用3D-SIM成像;并通过腺病毒表达GFP-Ccdc57验证定位。
验证Ccdc57斑点在具有旋转极性的基体中是否极性定位远离BF。
解剖P10、P20、P30小鼠室管膜组织,免疫染色Ccdc57和Odf2,3D-SIM成像并测量Ccdc57斑点相对于BF的位置;离体培养感染腺病毒表达GFP-Ccdc57。
确定Ccdc57缺失对小鼠发育和脑积水的影响。
构建Ccdc57敲除小鼠,观察颅骨形态、生存率、脑室大小、脊柱弯曲,并进行免疫印迹和免疫染色验证Ccdc57缺失。
验证Ccdc57缺失是否影响室管膜多纤毛的定向摆动和液体流动。
使用SiR-tubulin标记纤毛,高速旋转盘共聚焦显微镜记录P35和P50小鼠室管膜组织纤毛摆动;加入荧光乳胶珠追踪液体流动。
确定Ccdc57缺失是否解偶联基体极性与轴丝取向。
免疫染色Cep164标记基体、γ-tubulin或Centriolin标记BF,计算平均向量长度;透射EM观察BF方向;连续切片EM追踪同一纤毛的AO和BF极性。
验证AO和BF极性在发育早期是否 initially 不偶联。
记录P4和P20小鼠室管膜纤毛摆动;使用AutoCUTS-SEM对P4室管膜组织进行连续切片扫描EM,追踪纤毛从轴丝到BF。
验证Ccdc57缺失是否影响气管多纤毛的BF对齐。
免疫染色P40小鼠气管组织Cep164和Centriolin,共聚焦成像观察BB和BF排列模式;活体成像气管纤毛摆动和液体流动。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质粒构建 | LR酶混合物 | Thermo Fisher | 11791020 |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Ausbian | VS500T |
| 谷氨酰胺 | Sigma | G8540 | |
| 青霉素 | Solarbio | P8420 | |
| 链霉素 | Solarbio | S8290 | |
| 木瓜蛋白酶 | Worthington-Biochem | LS003126 | |
| DNA酶I | Sigma-Aldrich | D5025 | |
| 人血浆纤连蛋白 | Sigma-Aldrich | FC010 | |
| 玻璃底培养皿 | Cellvis | D29-14-1.5-N | |
| 免疫荧光染色 | Triton X-100 | -- | -- |
| DAPI | Invitrogen | -- | |
| ProLong封片剂 | Thermo Fisher | 2273640 | |
| 活细胞成像 | SiR-微管蛋白 | Spirochrome | SC002 |
| 液体流动实验 | 荧光乳胶珠 | Thermo Fisher | F8809 |
| 免疫印迹 | Western Lightning Plus ECL | PerkinElmer | NEL104001EA |
| 硝酸纤维素膜 | General Electric Company | -- | |
| 扫描电镜 | 阿佛丁 | Sigma-Aldrich | T48402 |
| 透射电镜 | Epon 812树脂 | -- | -- |
| 醋酸铀 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| 体积电镜 | 硫卡巴肼 | Sigma-Aldrich | -- |
| 骨骼染色 | 阿尔新蓝 | Sigma-Aldrich | A5268 |
| 茜素红ARS | Sigma-Aldrich | A5533 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 室管膜组织纤毛摆动活细胞成像 | 小鼠年龄(P35或P50)、基因型、SiR-tubulin浓度(100 nM)及标记时间(1小时)、成像间隔(10 ms) 阅读提示:Methods“High-speed live-cell imaging”及Figure 5图注 |
| 室管膜组织液体流动实验 | 荧光乳胶珠直径(250 nm)及稀释比例(1:500)、切片厚度(250 μm)、成像间隔(乳胶珠50–100 ms) 阅读提示:Methods“High-speed live-cell imaging”及Figure 5图注 |
| 基体极性EM定量 | 小鼠年龄范围(P21–P60)、每个基因型小鼠数(6只)、每只小鼠EM全景图数量(100张)、每张图至少6个可辨BF的基体 阅读提示:Methods“Electron microscopy”及“Measurement of BB polarity, AO, and ciliary beat polarity” |
| 连续切片EM追踪BF-AO关系 | 切片厚度(70 nm)、追踪纤毛数量(野生型7个,Ccdc57−/− 6个)、追踪厚度(>12 μm) 阅读提示:Methods“Electron microscopy”及Figure 6h、i图注 |
| Ccdc57−/−小鼠脑积水表型评估 | 小鼠年龄(≥P21)、脑冠状切片厚度(250 μm)、脑室扩大评估标准 阅读提示:Methods“Preparation of brain tissue section and skeletal staining”及Figure 4e图注 |