FOLR-1与GON-2的表达定位
确定FOLR-1和GON-2是否表达于HSN和NSM血清素能神经元。
构建folr-1p::FOLR-1::GFP、tph-1pDE::FOLR-1::wrmScarlet、gon-2p::GON-2::GFP等转基因,与tph-1p驱动的DsRed或myr-mNeonGreen共表达,进行共聚焦显微成像。
A specific folate activates serotonergic neurons to control C. elegans behavior.
包含转基因荧光定位、CRISPR突变体、体外共免疫沉淀、钙成像及行为学等多种独立证据层级
秀丽隐杆线虫野生型N2 Bristol folr-1(ek44)突变体 gon-2(ok465)/hT2杂合体 HEK293T细胞
10F-THF使用浓度10 µM、每板25 µl铺板,估计表面浓度约70.6 nM(0时) 10F-THF和DHP在HSN钙瞬变检测中使用200 nM或40 nM 产卵实验使用饥饿30 min的成年雌雄同体,每组10只,n=10 gon-2使用ok465/hT2杂合体而非纯合体进行产卵和钙瞬变检测 行为学检测中fluoxetine预处理浓度为75 µg/ml
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定FOLR-1和GON-2是否表达于HSN和NSM血清素能神经元。
构建folr-1p::FOLR-1::GFP、tph-1pDE::FOLR-1::wrmScarlet、gon-2p::GON-2::GFP等转基因,与tph-1p驱动的DsRed或myr-mNeonGreen共表达,进行共聚焦显微成像。
获得folr-1功能缺失等位基因并验证其分子效应。
利用CRISPR/Cas9在folr-1第二外显子切割,获得ek44缺失等位基因,测序确认并通过qRT-PCR检测mRNA水平。
验证特定叶酸和蝶酸是否以FOLR-1和GON-2依赖方式促进产卵。
饥饿30 min的成年雌雄同体置于铺有10F-THF、DHP、其他叶酸或对照缓冲液的平板,计数5、10、60 min产卵数。
检验FOLR-1与GON-2是否存在物理相互作用。
在HEK293T细胞中共表达FOLR-1::3xHA与GON-2::3xFLAG,进行双向免疫共沉淀和Western blot,以ICAM1-3xHA和3xFLAG-FBXW7为阴性对照。
检测10F-THF和DHP是否以FOLR-1和GON-2依赖方式改变HSN钙瞬变和NSM钙水平。
使用HSN GCaMP5和NSM GCaMP7b或GCaMP7s::P2A::mScarlet转基因,在10F-THF/DHP或对照缓冲液中成像并量化钙信号。
确定FOLR-1和GON-2在哪些组织中的表达足以恢复产卵响应。
在folr-1(ek44)或gon-2(ok465)/hT2背景下,用HSN、NSM、咽峡部和咽肠瓣膜细胞特异性启动子表达FOLR-1或GON-2,检测10F-THF诱导的产卵。
评估FOLR-1和GON-2对NSM介导的饥饿动物遇菌停止行为的影响。
饥饿成年动物置于含中央OP50菌圈的平板,摄像追踪接近和接触细菌后的速度、2 min移动距离及离开2.5 mm虚拟圆的时间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 共免疫沉淀 | 抗FLAG M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | A2220 |
| 抗HA亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | E6779 | |
| Western blot | 小鼠抗FLAG抗体(M2) | Sigma-Aldrich | F3165 |
| 兔抗HA抗体 | Thermo Fisher Scientific | 71-5500 | |
| 山羊抗小鼠HRP | Thermo Fisher Scientific | 31432 | |
| 山羊抗兔HRP | Thermo Fisher Scientific | 31462 | |
| Immobilon-P PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ECL Select蛋白质印迹检测试剂 | Cytiva | -- | |
| NuPAGE凝胶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞培养与转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CRISPR/Cas9 | Ni-NTA树脂 | Qiagen | -- |
| 药物处理 | 5-甲酰-5,6,7,8-四氢叶酸 | Sigma | -- |
| (6S)-5-甲基-5,6,7,8-四氢叶酸 | Schircks Laboratories | -- | |
| 5,6,7,8-四氢叶酸 | Merck | -- | |
| 7,8-二氢蝶酸 | Schircks Laboratories | -- | |
| 产卵实验 | 琼脂糖 | Sigma Aldrich | A9539 |
| 行为学实验 | 氟西汀 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 兔多克隆抗血清素抗体 | Neuromics Inc. | RA20080 |
| IV型胶原酶 | Sigma | -- | |
| 抗兔IgG纳米抗体AlexaFluor 546 | ChromoTek Inc. | -- | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| SuperScript IV第一链合成系统 | Life Technologies | -- | |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 分子克隆 | In-Fusion克隆试剂盒 | Takara Bio USA, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 产卵实验中的10F-THF处理 | 10F-THF终浓度10 µM、每板25 µl、饥饿30 min、成年雌雄同体单排卵、每组10只、观察5/10/60 min;10F-THF需由5,10-methenyl-THF在pH 8.5 Tris中新鲜转化并4 min内铺板 阅读提示:Methods“Egg-laying assay”与Fig. 2a及图注 |
| HSN钙瞬变检测 | 10F-THF或DHP浓度200 nM或40 nM、饥饿30 min、成像1000 s(4000帧)分析、排除前2000帧、钙瞬变异常动物的排除标准、每组n=11–19只动物 阅读提示:Methods“Analysis of HSN Ca2+ transients”与Fig. 4a–c |
| NSM钙水平检测 | GCaMP7s::P2A::mScarlet转基因、200 nM 10F-THF或DHP处理4 min、饥饿1–4 h、n=18只动物 阅读提示:Methods“GCaMP7s/mScarlet ratio”与Fig. 6d、6e |
| folr-1或gon-2突变体遗传背景 | gon-2使用ok465/hT2杂合体进行产卵及HSN钙瞬变检测而非纯合体,纯合体不育;folr-1(ek44)为13 bp缺失移码等位基因 阅读提示:Results相关段落与Methods“Generating the folr-1(ek44) mutation” |
| 运动停止与恢复行为检测 | fluoxetine预处理浓度75 µg/ml、虚拟圆直径2.5 mm、2 min移动距离、摄像1 fps、各组n=32–105只动物 阅读提示:Methods“Velocity and recovery time measurements”与Fig. 6a–c |
| 组织特异性拯救实验 | FOLR-1拯救质粒每种5 ng/µl、GON-2拯救质粒每种25 ng/µl、每种组合2个独立株系;组织启动子来源 阅读提示:Methods“Generation of transgenic strains”与Fig. 5b、Supplementary Fig. 8 |