T.mu定植与总IgA表型确认
验证肠道T.mu定植是否增加宿主总IgA水平。
将体外纯化T.mu经口灌胃接种VRL B6小鼠,检测血清和盲肠内容物总IgA、IgG、IgM,并通过免疫荧光和流式细胞术检测PPs、LP和骨髓中IgA+ B细胞及浆细胞。
A mouse protozoan boosts antigen-specific mucosal IgA responses in a specific lipid metabolism- and signaling-dependent manner.
含体外原虫培养、体内定植小鼠模型、Blt1基因敲除小鼠、转录组与代谢组分析及功能验证
VRL C57BL/6小鼠 本实验室T.mu定植C57BL/6小鼠 Blt1−/−小鼠及其Blt1+/−同窝对照 T.mu原虫体外培养
T.mu oral gavage dose: 1×10^6 T.mu protozoa/mouse OVA immunization: 2 mg/mL OVA mixed with CFA or Alum, 100 μL/mouse intraperitoneally ARA-supplemented diet: 0.4% (v/v) ARA with 0.2% vitamin C, fed for 7 days before immunization Zileuton treatment: 10 mg/kg/day intraperitoneally in 10% DMSO + 90% corn oil, starting 1 day before OVA immunization Blt1−/− vs Blt1+/− littermate controls, T.mu colonization on day 0, OVA+CFA challenge on day 7
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证肠道T.mu定植是否增加宿主总IgA水平。
将体外纯化T.mu经口灌胃接种VRL B6小鼠,检测血清和盲肠内容物总IgA、IgG、IgM,并通过免疫荧光和流式细胞术检测PPs、LP和骨髓中IgA+ B细胞及浆细胞。
确定T.mu定植是否增强针对TD和TI抗原的抗原特异性IgA反应。
T.mu定植小鼠经不同途径免疫OVA加CFA、Alum或CTB,或免疫NP-KLH、TNP-LPS,检测血清和盲肠内容物抗原特异性IgA、IgG、IgM及ELISPOT IgA+浆细胞。
判断T.mu诱导的抗原特异性IgA增强是否依赖肠道细菌群。
使用万古霉素清除革兰阳性菌,或萘啶酸/多粘菌素清除革兰阴性菌,或甲硝唑清除T.mu,随后进行OVA+CFA免疫并检测IgA。
探索T.mu定植诱导的肠道基因表达和代谢物变化。
对T.mu定植和对照小鼠小肠组织进行bulk RNA-seq及KEGG分析,对盲肠内容物进行非靶向代谢组学,并对T.mu及盲肠内容物进行靶向游离脂肪酸分析。
验证ARA是否足以增强抗原特异性IgA,并确定下游代谢通路。
给小鼠喂食0.4% ARA或DHA补充饲料,或腹腔注射ARA;使用齐留通、阿司匹林、MS-PPOH、ML-355、孟鲁司特等抑制剂干预,检测OVA特异性IgA。
确定LTB4-Blt1信号是否介导T.mu和ARA的IgA增强效应。
将T.mu接种Blt1−/−及Blt1+/−同窝对照小鼠,OVA+CFA免疫后检测血清和盲肠内容物抗OVA IgA;并检测ARA补充对Blt1−/−小鼠的影响。
验证T.mu或ARA增强的IgA是否提升针对鼠伤寒沙门氏菌口服疫苗的保护效果。
T.mu定植或ARA饲料喂养小鼠接受两剂热灭活S. Typhimurium口服疫苗,随后以活菌攻击,检测特异性IgA、细菌载量和生存率;并用齐留通、Blt1−/−、硼替佐米及被动免疫/过继转移验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| T.mu分离与培养 | Percoll密度梯度介质 | -- | -- |
| 脑心浸液肉汤 | Oxoid | CM1135 | |
| 链霉素 | Sangon Biotech | A100382 | |
| 青霉素 | Sangon Biotech | A613460 | |
| 万古霉素 | Sangon Biotech | A600983 | |
| 环丙沙星 | Sangon Biotech | A600310 | |
| 庆大霉素 | Sangon Biotech | A506614 | |
| 两性霉素B | Sangon Biotech | 171375 | |
| 动物饲养与处理 | 正常 Chow 饲料 | Jiangsu Xietong Pharmaceutical Bio-engineering Co., Ltd | 1010002 |
| 花生四烯酸 | MCE | HY-109590 | |
| 花生四烯酸 | Macklin | A875622 | |
| 二十二碳六烯酸 | Macklin | D875665 | |
| 维生素C | Macklin | A800296 | |
| 动物处理 | 琥珀酸钠 | Macklin | S818135 |
| 乙酸钠 | Sangon Biotech | A601611 | |
| 胆碱 | Merck KGaA | C7527 | |
| 齐留通 | MCE | HY-14164 | |
| 阿司匹林 | MCE | HY-14654 | |
| MS-PPOH | Cayman Chemical | 206052-02-0 | |
| ML-355 | MCE | HY-12341 | |
| ML-355 | TOPSCIENCE | T4347 | |
| 孟鲁司特钠 | TOPSCIENCE | HY-13315A | |
| 甲硝唑 | Sangon Biotech | A600633 | |
| 萘啶酸 | Sangon Biotech | A610363 | |
| 多粘菌素硫酸盐 | MCE | HY-A0089 | |
| 多粘菌素硫酸盐 | TOPSCIENCE | T1245 | |
| 硼替佐米 | MCE | HY-10227 | |
| 聚乙二醇300 | Solarbio | P9570 | |
| 免疫 | 卵清蛋白 | Sangon Biotech | A003049 |
| 完全弗氏佐剂 | Merck KGaA | F5881-6X10ML | |
| Imject明矾佐剂 | Merck KGaA | A6435 | |
| 霍乱毒素B亚单位 | Merck KGaA | SAE0069 | |
| 霍乱毒素B亚单位 | Absin | abs80001 | |
| NP-匙孔血蓝蛋白 | LGC Biosearch Technologies | N-5060 | |
| TNP-脂多糖 | LGC Biosearch Technologies | T-5065 | |
| ELISA | 山羊抗小鼠Ig | SouthernBiotech | 1010-01 |
| 高结合力板 | Corning | CLS3922 | |
| 高结合力板 | VICMED | V1096HL | |
| 抗小鼠IgG-HRP抗体 | SouthernBiotech | 1030-05 | |
| 抗小鼠IgM-HRP抗体 | SouthernBiotech | 1020-05 | |
| 抗小鼠IgA-HRP抗体 | Abcam | ab97235 | |
| TMB显色液 | Sangon Biotech | E661007 | |
| NP-牛血清白蛋白 | LGC Biosearch Technologies | N-5050 | |
| TNP-牛血清白蛋白 | LGC Biosearch Technologies | T-5050 | |
| 小鼠IgA标准品 | Invitrogen | 88-50450-22 | |
| 包被缓冲液 | Solarbio | C1050 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1010 | |
| 小鼠LTB4 ELISA试剂盒 | Shanghai Tongwei Industrial Co., Ltd | TW8165 | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8020 |
| 抗IgA抗体 | Cloud-Clone Corp. | PAA546MU01 | |
| 抗Ki67抗体 | Servicebio | GB121141 | |
| Alexa Fluor 488标记二抗 | Beyotime | A0423 | |
| Cy3标记二抗 | Beyotime | A0521 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| 数字切片扫描仪Pannoramic SCAN | 3DHISTECH Ltd | -- | |
| 细菌16S rRNA测序 | DNeasy PowerSoil Pro试剂盒 | QIAGEN | 47014 |
| AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒 | Axygen | AP-GX-250 | |
| NEXTFLEX快速DNA建库试剂盒 | Bioo Scientific | 5144-08 | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Life Technologies | 15596018 |
| gDNA消化剂 | YEASEN | H2901291 | |
| 流式细胞术 | Zombie Aqua活性染料 | BioLegend | 423101 |
| 抗CD16/32抗体 | eBioscience | 14-0161-82 | |
| 抗CD45-PE-Cy7 | Biolegend | 103113 | |
| 抗CD45-APC | BD Pharmingen | 561018 | |
| 抗B220-APC | Biolegend | 103212 | |
| 抗IgA-FITC | Invitrogen | 11-4204-81 | |
| 抗IgG1-PerCP-Cy5.5 | Biolegend | 406612 | |
| 抗CD138-PE | Biolegend | 142503 | |
| DNA酶I | Merck KGaA | 11284932001 | |
| IV型胶原酶 | Absin | abs47048003 | |
| ELISPOT | RPMI-1640培养基 | Hyclone | SH30809 |
| 胎牛血清 | Gibco | 16000-044 | |
| MultiScreen板 | Merk KGaA | MSIPS4510 | |
| ECL化学发光底物试剂盒 | Biosharp | BL523B | |
| DAB过氧化物酶底物试剂盒 | Servicebio | CR2402044 | |
| qPCR | TIANamp粪便DNA试剂盒 | Tiangen Biotech | DP328 |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| AceQ qPCR SYBR Green Master Mix试剂盒 | Vazyme | Q111 | |
| B细胞分选 | MojoSort小鼠泛B细胞分离试剂盒 | BioLegend | 480052 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T.mu定植与转移 | T.mu剂量1×10^6 protozoa/mouse,oral gavage;对照PBS;定植后7天检测 阅读提示:Methods 'T.mu isolation and in vivo transfer';Fig. 1 legend |
| OVA免疫与佐剂选择 | OVA浓度2 mg/mL,100 μL/mouse;CFA或Alum佐剂;i.p./s.c./i.m.途径;口服100 μg OVA+10 μg CTB 阅读提示:Methods 'Immunization';Fig. 2 legend |
| ARA补充饮食 | 0.4% (v/v) ARA补充饲料,含0.2% vitamin C;喂养7天后免疫;对照饲料同样加0.2% vitamin C 阅读提示:Methods 'Animal studies';Fig. 5 legend |
| 5-脂氧合酶抑制剂处理 | 齐留通10 mg/kg/day i.p.,溶于10% DMSO+90% corn oil,OVA免疫前1天开始 阅读提示:Methods 'Animal studies';Fig. 5 legend |
| Blt1基因敲除验证 | Blt1−/−与Blt1+/−同窝对照;T.mu定植后7天OVA+CFA免疫;第21天检测 阅读提示:Methods 'Animal studies';Fig. 6 legend |
| 沙门氏菌口服疫苗与攻击 | 热灭活S. Typhimurium 1×10^8/剂,两剂口服;活菌攻击1×10^7(载量)或1×10^8(致死);齐留通从首剂疫苗前1天每日i.p. 阅读提示:Methods 'Salmonella infection';Fig. 7 legend |