Mst1与FoxO1相互作用及磷酸化位点鉴定
验证Mst1是否直接结合并磷酸化FoxO1,确定磷酸化位点。
心肌细胞免疫共沉淀与体外pull-down验证相互作用;体外激酶实验结合32P-ATP和质谱鉴定小鼠FoxO1磷酸化位点;构建FoxO1-PR与S209A突变体腺病毒。
Mst1-mediated phosphorylation of FoxO1 and C/EBP-β stimulates cell-protective mechanisms in cardiomyocytes.
涵盖体外心肌细胞、多种基因修饰小鼠、I/R与缺血模型、ChIP-seq、质谱及激酶实验,含功能与机制验证
新生大鼠原代心肌细胞 心脏特异性FoxO1敲除小鼠 Tg-Mst1及Tg-Mst1-FoxO1-cKO双基因小鼠 C/EBP-β-T250E敲入小鼠
FoxO1被Mst1磷酸化的六个位点:Ser209/Ser215/Ser218/Thr228/Ser232/Ser243 C/EBP-β被Mst1磷酸化的位点:人Thr299/小鼠Thr250/大鼠Thr251 腺病毒转导剂量10 MOI,H2O2处理浓度10 μM 小鼠I/R手术:缺血45 min、再灌注24 h;梗死面积以AAR/LV和梗死面积/AAR评估 心肌缺血模型缺血4 h;ChIP-seq每组3只小鼠心脏合并
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Mst1是否直接结合并磷酸化FoxO1,确定磷酸化位点。
心肌细胞免疫共沉淀与体外pull-down验证相互作用;体外激酶实验结合32P-ATP和质谱鉴定小鼠FoxO1磷酸化位点;构建FoxO1-PR与S209A突变体腺病毒。
明确Mst1磷酸化对FoxO1亚细胞定位、泛素化降解及DNA结合能力的影响。
免疫荧光检测FoxO1核定位;GST-TUBE2检测泛素化FoxO1;3×IRS报告基因、生物素DNA pull-down与EMSA检测DNA结合。
验证FoxO1在Mst1存在下对心肌细胞凋亡的作用。
TUNEL检测心肌细胞凋亡;比较FoxO1过表达、shRNA敲低及FoxO1-PR突变对Mst1或H2O2诱导凋亡的影响。
阐明Mst1如何通过FoxO1激活C/EBP-β。
pull-down与免疫共沉淀检测FoxO1–C/EBP-β结合;体外激酶与质谱鉴定C/EBP-β Thr299;制备磷酸化特异性抗体;检测C/EBP-β二聚化。
确定C/EBP-β磷酸化对FoxO1靶基因表达的影响。
RT2 Profiler PCR array与qRT-PCR检测靶基因;报告基因分析Cat启动子上DBE、CCAAT盒与CEBE突变;免疫印迹检测catalase、PRDX2、FASLG、PMAIP1。
在体验证Mst1–FoxO1–C/EBP-β通路的保护作用。
Tg-Mst1、Tg-DN-Mst1、FoxO1-cKO、C/EBP-β+/−及双基因小鼠行缺血4 h或I/R手术,评估梗死面积、心功能与TUNEL;C/EBP-β-KI小鼠验证磷酸化模拟的保护作用。
在体检测C/EBP-β Thr250磷酸化对C/EBP-β与FoxO1启动子结合的影响。
WT与C/EBP-β-KI小鼠行sham或3 h心肌缺血,ChIP-seq检测Cat、Mnsod等启动子结合峰及motif富集。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 过氧化氢酶抗体 | Abcam | ab16731 |
| Mst1抗体 | BD Biosciences | 611052 | |
| MnSOD抗体 | BD Biosciences | 611581 | |
| FoxO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 | |
| 磷酸化Mst1(Thr183)抗体 | Cell Signaling Technology | 3681 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 9715 | |
| PRDX2抗体 | Cell Signaling Technology | 46855 | |
| 免疫荧光 | 心肌肌钙蛋白T抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-12960 |
| Alexa Fluor 488标记抗小鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11029 | |
| Alexa Fluor 594标记抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11037 | |
| 含DAPI的VECTASHIELD封片剂 | Vector Laboratories Inc. | -- | |
| 体外激酶实验 | 重组活性Mst1蛋白 | Millipore | -- |
| 泛素化检测 | GST串联泛素结合实体2 | Life Sensors | -- |
| RT2 Profiler PCR array | 大鼠FoxO1信号通路RT2 Profiler PCR芯片 | QIAGEN | CLAR23789 |
| qPCR | RT2 SYBR Green/ROX qPCR预混液 | Applied Biosystems | -- |
| 荧光素酶报告基因实验 | pGL3-basic载体 | Promega | -- |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| ChIP-seq | TruSeq ChIP文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| Illumina NextSeq500测序仪 | Illumina | -- | |
| 质谱分析 | Orbitrap Velos串联质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| Pierce C18离心柱 | Thermo Scientific | -- | |
| H2O2检测 | Amplex Red过氧化氢检测试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 大鼠C/EBPβ siRNA | Thermo Fisher Scientific | 4390771 | |
| 重组蛋白纯化 | 谷胱甘肽Sepharose 4B | GE Healthscience | -- |
| PreScission蛋白酶 | GE Healthcare | -- | |
| 核质分离 | NE-PER核质提取试剂 | PIERCE | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外激酶实验与磷酸化位点鉴定 | 重组活性Mst1用量(10 ng)、FoxO1底物用量(1 μg)、ATP浓度(100或5 μM)、反应温度与时间(30 °C 30 min) 阅读提示:Methods中In vitro kinase assays小节及Fig. 1d、Fig. 5d图注 |
| 心肌细胞腺病毒转导与处理 | 腺病毒转导剂量(10 MOI)、H2O2浓度(10 μM)、检测时间点 阅读提示:Fig. 1a、Fig. 3a、Fig. 6c图注及Methods中Construction of adenoviruses |
| 小鼠缺血/再灌注手术 | 缺血时间(45 min)、再灌注时间(24 h)、LAD结扎位置、AAR与梗死面积计算方法 阅读提示:Methods中I/R surgery in vivo与Assessment of area at risk and infarct size小节、Fig. 7a图注 |
| 小鼠持续缺血模型 | 缺血持续时间(4 h)、分组(Tg-Mst1、Tg-DN-Mst1、C/EBP-β+/−等)、样本量 阅读提示:Fig. 6e图注及Results相关段落 |
| ChIP-seq | 每组小鼠数(3只心脏合并)、缺血时间(3 h)、测序平台与分析流程 阅读提示:Methods中Chromatin immunoprecipitation sequencing小节、Fig. 7d图注 |