建立基底样细胞引导的集体侵袭模型
在体外和体内重现基底样细胞引导的集体侵袭。
将MMTV-PyMT肿瘤类器官嵌入3D I型胶原或注射到小鼠乳腺脂肪垫,用共聚焦成像检测K14和K8定位。
A YAP-centered mechanotransduction loop drives collective breast cancer cell invasion.
包含MMTV-PyMT类器官、4T1球体、患者来源类器官、小鼠乳腺脂肪垫模型及患者组织样本,并有Yap敲低、YTIP、K975抑制和K14敲除等功能验证。
MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤类器官 4T1乳腺癌细胞球体 PDXO 1915患者来源乳腺癌类器官 MMTV-PyMT类器官小鼠乳腺脂肪垫移植瘤
Yap敲低效率:dox诱导shRNA后Yap蛋白降低70–80% Yap-TEAD抑制:dox诱导YTIP表达或K975处理(5 μM、10 μM) K14敲除验证:DNA测序确认Krt14缺失,Western blot确认K14蛋白缺失 胶原力学条件: attached与floating胶原凝胶,或collagenase(0.5 mg/mL,3 min)部分消化 体内侵袭量化:肿瘤边界突出指数(perimeter/convex hull)及肺转移灶数量与大小
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体外和体内重现基底样细胞引导的集体侵袭。
将MMTV-PyMT肿瘤类器官嵌入3D I型胶原或注射到小鼠乳腺脂肪垫,用共聚焦成像检测K14和K8定位。
确认基底样细胞在人类IDC集体侵袭中的存在。
对20例高级别IDC组织切片进行K14和K8/18免疫组化,评估集体侵袭模式中K14阳性细胞的分布。
明确I型胶原是否改变基底样细胞的基因表达及候选转录因子。
对BME或I型胶原中培养5天的MMTV-PyMT类器官进行单细胞mRNA测序,比较基底样细胞群,进行差异表达、motif和GSEA分析。
检测Yap是否在侵袭性基底样细胞中激活,并测试其对集体侵袭的必要性。
用免疫荧光和共聚焦成像分析Yap核/质比;通过dox诱导Yap shRNA、YTIP或K975抑制Yap,评估侵袭链数量和长度。
确定Yap是否驱动基底样细胞对齐胶原纤维并施加牵引力。
用CNA35-GFP标记胶原,OrientationJ分析胶原对齐;嵌入荧光珠分析珠位移;在Yap敲低或YAP 5SA过表达条件下比较。
测试K14表达是否对I型胶原诱导的集体侵袭必需。
用CRISPR/Cas9敲除MMTV-PyMT类器官和4T1细胞中的K14,验证蛋白缺失,评估侵袭链形成和Yap核定位。
确定I型胶原的机械张力是否驱动Yap激活和集体侵袭。
通过漂浮胶原凝胶或低浓度collagenase部分消化扰乱胶原张力,检测类器官侵袭、Yap靶基因表达和Yap核/质比。
测试Yap是否在体内驱动集体肿瘤侵袭。
将携带dox诱导Yap shRNA或YTIP的MMTV-PyMT类器官注射到小鼠乳腺脂肪垫,诱导Yap敲低后分析肿瘤边界突出指数和肺转移。
验证Yap激活在人类乳腺癌集体侵袭中的相关性。
对IDC组织切片进行Yap和K14免疫组化/免疫荧光,分析核Yap与K14表达及ECM界面的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 小鼠抗人YAP抗体 | Santa-Cruz | sc-101199 |
| 兔抗人YAP抗体 | CST | 4912 | |
| 大鼠抗小鼠角蛋白8抗体 | DSHB | 531826 | |
| 兔抗人角蛋白14抗体 | Biolegend | 905301 | |
| 小鼠抗人角蛋白14抗体 | Abcam | ab7800 | |
| 兔抗人角蛋白5抗体 | Abcam | ab52635 | |
| 兔抗人角蛋白17抗体 | Abcam | ab183330 | |
| 兔抗人TAZ抗体 | Abcam | ab84927 | |
| Western blot | 小鼠抗鸡肌动蛋白抗体 | Millipore | 1501 |
| 细胞培养 | Cultrex PathClear RGF 2型基底膜提取物 | -- | -- |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Life Technologies | -- | |
| HEPES缓冲液 | Life Technologies | 15630-056 | |
| Glutamax添加剂 | Life Technologies | 35050-038 | |
| 青霉素-链霉素 | Westburg | DE17-602E | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | N0636 | |
| B27添加剂 | Life Technologies | 17504-044 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子2 | PeproTech | 100-26 | |
| Primocin抗生素 | InvivoGen | ant-pm-05 | |
| TrypLE Express消化酶 | -- | 12605-010 | |
| 胰蛋白酶抑制剂 | Merck Sigma | T9003 | |
| 3D胶原实验 | 大鼠尾I型胶原 | -- | -- |
| Dispase II酶 | Life Technologies | 17105041 | |
| 胶原酶 | Sigma-Aldrich | C0130 | |
| 诱导表达 | 多西环素 | Sigma-Aldrich | D9891 |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | Sigma Aldrich | -- |
| 杀稻瘟菌素 | Invitrogen | ant-bl-05 | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 荧光珠位移实验 | FluoSpheres羧基修饰微球,1.0微米,红色荧光(580/605) | Molecular Probes | -- |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor-488/568/647标记的山羊抗小鼠、抗兔或抗大鼠抗体 | Invitrogen | -- |
| DAPI | Thermo Fisher | -- | |
| Alexa Fluor-568标记的鬼笔环肽 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 3D I型胶原侵袭实验 | I型胶原终浓度2.0 mg/mL;培养时间3–5天;类器官来源(MMTV-PyMT或PDXO 1915) 阅读提示:Methods中“3D BME and Collagen I assays”及Figure 2、3图注 |
| Yap功能抑制 | dox浓度2 μg/mL;处理3天;shRNA1/2或YTIP诱导效率;K975浓度5 μM或10 μM 阅读提示:Methods中“Lentiviral production and tumor organoid transduction”及Figure 3图注 |
| K14敲除验证 | sgRNA序列gAAGGGCTCTTGTGGTATCGG;Western blot验证K14、K5、K17缺失;测序确认 阅读提示:Methods中“Generation of K14-deficient organoids”及Figure 4f |
| 胶原力学扰动 | floating与attached凝胶;collagenase 0.5 mg/mL处理3分钟;检测时间点(2小时30分钟) 阅读提示:Methods中“3D BME and Collagen I assays”及Figure 5图注 |
| 体内侵袭实验 | 注射细胞数250,000;注射部位第4乳腺脂肪垫;dox饲料200 mg/kg;肿瘤体积50 mm³开始处理;小鼠数量每组10–13只 阅读提示:Methods中“Orthotopic injection of MMTV-PyMT organoids in mice”及Figure 6图注 |