临床样本与动物模型验证老年肝脏更易发生IRI和铁死亡
验证老年肝脏对IRI更敏感且铁死亡水平更高。
收集OLT供肝再灌注前后活检标本,检测血清AST/ALT、HE、TUNEL、DHE、C11 BODIPY、铁死亡相关蛋白;建立年轻与老年小鼠HIRI模型,检测肝损伤和铁死亡指标;分离原代肝细胞和诱导衰老THLE2细胞建立H/R模型验证。
FTO deficiency in older livers exacerbates ferroptosis during ischaemia/reperfusion injury by upregulating ACSL4 and TFRC.
含临床标本、小鼠HIRI模型、原代肝细胞和衰老细胞系,并有MeRIP-seq、CLIP-seq、AAV敲低等机制验证
老年与年轻供肝患者肝活检样本及OLT队列 年轻与老年C57BL/6小鼠HIRI模型 原代小鼠肝细胞H/R模型 衰老THLE2细胞H/R模型
HIRI模型:左中叶肝缺血90 min,再灌注12 h后取材;假手术组仅开腹 药物处理:Fer-1 20 mg/kg或FB23-2 20 mg/kg缺血前2 h腹腔注射;NMN 500 mg/kg缺血前4 h给药 AAV8敲低:shRNA-AAV8-ACSL4或TFRC经尾静脉注射,1×10^12 viral genomes·mL−1,3周后建立HIRI模型 细胞H/R模型:无血清条件下1% O2缺氧4 h,复氧2 h;衰老THLE2由100 μM H2O2处理3个循环诱导 临床分组:供体年龄<50岁为年轻组,>=50岁为老年组;OLT队列n=20,每组n=10
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证老年肝脏对IRI更敏感且铁死亡水平更高。
收集OLT供肝再灌注前后活检标本,检测血清AST/ALT、HE、TUNEL、DHE、C11 BODIPY、铁死亡相关蛋白;建立年轻与老年小鼠HIRI模型,检测肝损伤和铁死亡指标;分离原代肝细胞和诱导衰老THLE2细胞建立H/R模型验证。
明确铁死亡对老年HIRI的贡献。
老年小鼠给予Fer-1后建立HIRI模型,检测血清AST/ALT、HE、TUNEL、DHE、C11 BODIPY;原代肝细胞和衰老THLE2细胞H/R中给予Fer-1,检测细胞死亡、ROS和脂质过氧化。
寻找调控老年HIRI的关键分子。
对年轻和老年小鼠HIRI肝组织进行LC-MS差异蛋白分析,结合筛选标准锁定FTO;用Western blot、IHC验证FTO在人和小鼠肝组织及细胞中的表达;dot blot检测m6A水平。
验证FTO是否通过抑制铁死亡减轻老年HIRI。
在老年小鼠中过表达或抑制FTO(FB23-2),联合Fer-1处理,检测肝损伤和铁死亡指标;在原代肝细胞和衰老THLE2细胞中过表达、沉默FTO或使用FB23-2,结合Fer-1或erastin处理,检测细胞死亡、ROS和脂质过氧化。
阐明FTO调控铁死亡的关键下游分子和表观转录机制。
在衰老THLE2细胞中转染对照或FTO过表达质粒并行H/R,进行MeRIP-seq和FTO-CLIP-seq;MeRIP-qPCR验证Acsl4和Tfrc的m6A水平;RT-qPCR和Western blot检测ACSL4/TFRC表达;放线菌素D实验检测mRNA半衰期;RIP验证YTHDC2/YTHDF2结合。
验证FTO减轻老年HIRI是否依赖ACSL4和TFRC。
老年小鼠尾静脉注射shRNA-AAV8-ACSL4或shRNA-AAV8-TFRC,3周后建立HIRI模型并给予FB23-2,检测肝损伤、ROS、脂质过氧化、线粒体形态和铁死亡蛋白;体外过表达或敲低ACSL4/TFRC结合FTO调控,检测细胞死亡和脂质过氧化。
评估NMN通过增强FTO活性抑制铁死亡并缓解老年HIRI的潜力。
老年小鼠给予NMN后建立HIRI模型,检测血清AST/ALT、HE、TUNEL、m6A dot blot、DHE、C11 BODIPY、铁死亡蛋白和TEM。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Ferrostatin-1 | Selleck | S7243 |
| FB23-2 | MCE | HY-127103 | |
| 烟酰胺单核苷酸 | Selleck | S5259 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma‒Aldrich | D5879-500ML | |
| ROS检测 | 二氢乙锭 | MCE | HY-D0079 |
| 脂质过氧化检测 | C11 BODIPY试剂 | GLPBIO | GC40165 |
| 细胞培养 | BEGM培养基试剂盒 | Lonza/Clonetics Corporation | CC3170 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270-106 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 原代肝细胞分离 | H型胶原酶 | Sigma‒Aldrich | 11087789001 |
| Percoll分离液 | GE Healthcare | 17089109 | |
| 细胞培养 | 地塞米松 | Sigma‒Aldrich | D1756-25MG |
| 衰老诱导 | 衰老细胞组织化学染色试剂盒 | Sigma-Aldrich | CS0030 |
| TUNEL检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1088 |
| 细胞死亡检测 | Calcein-AM/PI双染试剂盒 | Beyotime | C2015 |
| 免疫组化 | QuickBlock封闭缓冲液 | Beyotime | P0260 |
| Dako REAL EnVision检测系统 | Dako | K5007 | |
| 免疫荧光 | DAPI | KeyGen | KGA1523 |
| Triton | Sigma‒Aldrich | T8787-50ML | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma‒Aldrich | V900933-100G | |
| Western blot | BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol | Invitrogen | 15596018 |
| Transcriptor第一链cDNA合成试剂盒 | Roche Applied Science | -- | |
| 质粒转染 | ViaFect转染试剂 | Promega | E4982 |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000试剂 | Invitrogen | L3000015 |
| MeRIP-qPCR | riboMeRIP m6A转录组分析试剂盒 | RiboBio | C11051-1 |
| miRNeasy迷你试剂盒 | QIAGEN | 217004 | |
| 脂质组学 | 叔丁基甲基醚 | Sigma-Aldrich | 650560-1 L |
| m6A dot blot | 抗N6-甲基腺苷(m6A)抗体 | Cell Signaling Technology | -- |
| 亚甲蓝 | Sigma‒Aldrich | M4159 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠HIRI模型 | 缺血时间(90 min)、再灌注时间(12 h)、缺血肝叶(左中叶)、麻醉剂(1%戊巴比妥钠,100 μl/10 g)、假手术对照 阅读提示:Methods中的Establishment of the mouse HIRI model小节 |
| 药物处理(Fer-1、FB23-2、NMN) | 剂量(Fer-1 20 mg/kg;FB23-2 20 mg/kg;NMN 500 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药时间(缺血前2 h或4 h)、溶剂(2% DMSO/5% Tween-80或生理盐水) 阅读提示:Methods中的Establishment of the mouse HIRI model小节 |
| AAV8介导基因敲低 | 病毒剂量(1×10^12 viral genomes·mL−1)、注射途径(尾静脉)、注射后时间(3周后建立HIRI)、shRNA序列、分组(7组) 阅读提示:Methods中的Animal adeno-associated virus-8 (AAV8) injection and processing小节 |
| 细胞H/R模型 | 缺氧条件(1% O2,5% CO2,94% N2,4 h)、复氧时间(2 h)、血清饥饿、细胞类型(原代肝细胞、衰老THLE2) 阅读提示:Methods中的In vitro hypoxia reoxygenation (H/R) model小节 |
| THLE2细胞衰老诱导 | H2O2浓度(100 μM)、处理时间(30 min)、恢复时间(23.5 h)、循环次数(3次) 阅读提示:Methods中的Induction of THLE2 cell senescence with hydrogen peroxide (H2O2)小节 |
| mRNA稳定性检测 | 放线菌素D浓度(5 μg/ml)、收样时间点(0、3、4、6、8、12 h) 阅读提示:Methods中的mRNA stability assays小节 |
| 临床样本分组 | 供体年龄 cutoff(年轻<50岁,老年>=50岁)、样本量(n=20)、再灌注前标本收集时间(冷灌注后3 h内)、再灌注后标本收集时间(肝动脉吻合后2 h内) 阅读提示:Methods中的Clinical data and human liver sample collection小节及Results第一段 |