利用cryoET解析盘膜生成中的肌动蛋白结构
确定盘膜生成是主动的肌动蛋白驱动过程还是被动过程
分离小鼠视杆细胞外段,进行冷冻电子断层扫描和子断层平均,三维重建基底盘膜的超微结构
Ciliary tip actin dynamics regulate photoreceptor outer segment integrity.
包含Rpgr和Cofilin敲除小鼠模型、cryoET超微结构、视网膜电生理、蛋白质组学和药物挽救实验
RpgrEx3d8小鼠 RpgrORFd5小鼠 光感受器特异性Cofilin敲除小鼠 分离的小鼠视杆细胞外段
RpgrEx3d8小鼠在6周龄时出现盘膜间距增大和囊泡积累,18月龄时视网膜电图a波振幅显著降低 cryoET显示RpgrEx3d8小鼠基底盘膜中肌动蛋白微丝长度显著增加(p≤0.0001) cofilin在Ser3位点磷酸化水平升高(p=0.0013),RPGR与cofilin共免疫沉淀 玻璃体内注射25 mM cytochalasin D或100 μM LIMK抑制剂6小时可减少RpgrEx3d8小鼠囊泡脱落(p≤0.0001) 光感受器特异性Cofilin敲除小鼠重现RpgrEx3d8的‘间距盘膜’表型和囊泡积累
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定盘膜生成是主动的肌动蛋白驱动过程还是被动过程
分离小鼠视杆细胞外段,进行冷冻电子断层扫描和子断层平均,三维重建基底盘膜的超微结构
验证Rpgr突变是否导致光感受器外段维持缺陷
利用CRISPR/Cas9构建RpgrEx3d8和RpgrORFd5小鼠,进行眼底成像、蓝光自发荧光、视网膜电图、光学相干断层扫描、组织学和透射电镜分析
探究RPGR缺失影响的分子通路
对3月龄野生型和RpgrEx3d8小鼠视网膜进行质谱蛋白质组学分析,并用免疫印迹验证差异蛋白
确定RPGR是否调控cofilin活性
免疫印迹检测cofilin Ser3磷酸化,免疫荧光检测cofilin定位,共免疫沉淀检测RPGR与cofilin结合,并构建光感受器特异性Cofilin敲除小鼠进行表型分析
验证靶向肌动蛋白解聚通路能否挽救Rpgr突变表型
对RpgrEx3d8小鼠玻璃体内注射cytochalasin D或LIMK抑制剂,6小时后透射电镜观察囊泡脱落
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 细胞松弛素D | Sigma | -- |
| LIMK抑制剂 | TOCRIS | CRT 0105950 | |
| 免疫印迹 | 硝酸纤维素膜 | Whatman | -- |
| Super Signal West Pico检测试剂 | Pierce | -- | |
| 免疫荧光 | Atto647N标记的鬼笔环肽 | Sigma | 65906 |
| cofilin抗体 | CST | 5175 | |
| 罗丹明小麦胚芽凝集素 | Vector | RL-1022 | |
| Prolong Glass封片剂 | Invitrogen | P36980 | |
| 蛋白质组学 | 二硫苏糖醇 | Sigma-Aldrich | D0632 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| cryoET样品制备与成像 | 小鼠年龄、基因型、视杆细胞外段分离方法、冷冻条件、电子显微镜型号和成像参数 阅读提示:Methods中Cryo-electron tomography and image processing小节 |
| Rpgr突变小鼠构建与表征 | CRISPR靶点、突变类型、小鼠背景、性别、年龄和检测时间点 阅读提示:Methods中Mouse generation小节及Supplementary Fig. 2 |
| 药物挽救实验 | 药物浓度、注射体积、注射途径、处理时间、对照设置和动物数量 阅读提示:Methods中Cytochalasin rescue experiment和LIMKi rescue experiment小节 |
| 透射电镜分析 | 固定条件、切片厚度、染色方法和成像设备 阅读提示:Methods中Transmission electron microscopy小节 |
| 蛋白质组学与免疫印迹 | 样本量、生物学重复数、抗体信息和统计方法 阅读提示:Methods中Rod outer segment proteomics、Whole retina proteomics和Protein extraction, antibodies and immunoblotting小节 |