年龄相关肝脏脂肪变性的表型观察
验证中年和老年小鼠肝脏脂肪变性及细胞衰老情况。
对2.5、12和20月龄雄性小鼠肝脏进行Oil Red O染色、TG和CHO含量测定,以及P16和γH2AX免疫荧光和Nile Red染色。
Senescence-associated 13-HODE production promotes age-related liver steatosis by directly inhibiting catalase activity.
使用多种细胞衰老模型、原代肝细胞、年轻/中年/老年小鼠、AAV过表达和多种分子检测,包含功能与机制验证。
HepG2细胞衰老模型 RAW264.7细胞衰老模型 原代小鼠肝细胞 C57BL/6雄性小鼠(2.5、8、12、20月龄)
9-HODE和13-HODE的LC-MS/MS检测及定量 衰老标志物P16、P21、P53和γH2AX的Western blot或免疫荧光检测 CAT活性检测及13-HODE与CAT直接结合的SPR分析(KD=2.418 μM) CAT过表达或敲低对13-HODE诱导的脂质积累和SREBP1活化的影响 AAV8-TBG-CAT肝细胞特异性过表达对13-HODE诱导和年龄相关肝脏脂肪变性的体内验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证中年和老年小鼠肝脏脂肪变性及细胞衰老情况。
对2.5、12和20月龄雄性小鼠肝脏进行Oil Red O染色、TG和CHO含量测定,以及P16和γH2AX免疫荧光和Nile Red染色。
验证衰老肝细胞是否通过旁分泌方式促进非衰老肝细胞脂质积累。
使用H2O2、DOX或Nutlin-3a诱导HepG2细胞衰老,收集条件培养基处理非衰老HepG2细胞,进行Oil Red O染色。
筛选与年龄相关肝脏脂肪变性相关的PUFA代谢物。
对2.5和12月龄小鼠肝脏进行靶向脂质组学LC-MS/MS分析,并进行PLS-DA、VIP评分和火山图分析;检测衰老细胞及条件培养基中9-HODE和13-HODE水平。
验证ALOX15是否介导衰老细胞中9-HODE和13-HODE的产生并影响脂肪变性。
在衰老HepG2和RAW264.7细胞中检测ALOX15蛋白水平,使用siRNA敲低ALOX15,并检测条件培养基对脂质积累的影响。
验证9-HODE和13-HODE混合物是否在体内诱导肝脏脂肪变性。
8周龄雄性小鼠腹腔注射9/13-HODEs混合物每日一次连续9天,检测肝脏重量、TG含量和组织学染色,并进行RNA-seq和qPCR。
验证13-HODE是否通过稳定成熟SREBP1激活脂质合成。
在原代小鼠肝细胞中单独或联合处理9-HODE和13-HODE,检测cleaved SREBP1和FASN蛋白水平,并使用25-HC和MG132处理验证SREBP1切割和降解。
鉴定13-HODE的直接结合蛋白并验证其与CAT的结合。
使用生物素标记的13(S)-HODE进行pull-down和蛋白质谱鉴定,结合分子对接和SPR分析验证13-HODE与CAT的直接结合。
验证13-HODE是否抑制CAT活性及其四聚化。
在原代肝细胞和重组CAT中检测13-HODE处理后CAT活性,使用DSS交联检测CAT四聚体水平,并检测ROS水平。
验证CAT是否介导13-HODE诱导的肝细胞脂肪变性。
在原代肝细胞中转染Cat表达质粒或si-Cat,检测13-HODE处理后的脂质积累、cleaved SREBP1和FASN水平;并使用NAC降低ROS。
验证CAT过表达是否改善13-HODE诱导的和年龄相关的肝脏脂肪变性。
使用AAV8-TBG-CAT注射小鼠,分别给予13-HODE或观察年龄相关脂肪变性,检测肝脏脂质积累和SREBP1/FASN蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠处理 | 9-HODE | Cayman Chemical | 38400 |
| 13-HODE | Cayman Chemical | 38600 | |
| 聚乙二醇400 | -- | -- | |
| AAV8-Cat(小鼠)-flag(TBG启动子) | GeneChem Co., Ltd. | -- | |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞衰老诱导 | 过氧化氢 | -- | -- |
| 盐酸多柔比星 | MedChemExpress | HY-15142 | |
| Nutlin-3a | Beyotime | SC4350 | |
| 原代肝细胞分离 | I型胶原酶 | -- | -- |
| 细胞处理 | N-乙酰-L-半胱氨酸 | Beyotime | ST2524 |
| 25-羟基胆固醇 | MedChemExpress | HY-113134 | |
| MG132 | MedChemExpress | HY-13259 | |
| 质粒转染 | Cat表达质粒 | Origene | MC205746 |
| siRNA转染 | 靶向Cat、Nr2c2、Pparg、Rictor的siRNA或阴性对照 | Sangon Biotech | -- |
| LC-MS/MS | Waters Acquity超高效液相色谱 | Waters | -- |
| UPLC BEH C18柱 | Waters | -- | |
| 肝脏脂质测定 | 甘油三酯测定试剂盒 | BioSino Bio-Technology & Science | -- |
| 胆固醇测定试剂盒 | BioSino Bio-Technology & Science | -- | |
| 免疫荧光 | 抗P16抗体 | Proteintech | 10883-1-AP |
| 抗ALOX15抗体 | Santa Cruz | sc-133085 | |
| 抗γH2AX(磷酸化S139)抗体 | Abcam | ab81299 | |
| 免疫组化 | 抗F4/80抗体 | Cell Signaling Technology | #70076 |
| Pull-down | 13(S)-HODE生物素 | Cayman Chemical | 38612 |
| 13(S)-HODE | Cayman Chemical | 38610 | |
| 链霉亲和素磁珠 | New England Biolabs | S1420S | |
| SPR | Biacore T200 | Biacore | -- |
| CM5芯片 | Biacore | -- | |
| 重组小鼠过氧化氢酶蛋白 | Biorbyt | orb624003 | |
| CAT活性检测 | CAT酶活性试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A007-1-1 |
| 重组人CAT蛋白 | Novus Biologicals | NBP1-98907 | |
| ROS检测 | DCFH-DA | Beyotime | S0033S |
| 交联 | DSS交联剂 | MedChemExpress | HY-W019543 |
| RNA提取 | TransZol Up Plus RNA试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| cDNA合成 | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | K1622 |
| qPCR | SYBR Premix Ex Taq预混液(2×) | TransGen Biotech | -- |
| QuantStudio 3实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | 抗P21抗体 | Proteintech | 10355-1-AP |
| 抗P53(1C12)抗体 | Cell Signaling Technology | #2524 | |
| 抗FASN抗体 | Proteintech | 10624-1-AP | |
| 抗SREBP1抗体 | Proteintech | 14088-1-AP | |
| 抗CAT抗体 | Proteintech | 21260-1-AP | |
| 抗FLAG抗体 | Cell Signaling Technology | #14793 | |
| 抗ALOX15抗体 | Abcam | ab244205 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 年龄相关肝脏脂肪变性模型 | 小鼠品系C57BL/6雄性,月龄2.5、12、20个月,每组n=5-6,喂养普通饲料 阅读提示:Methods中Animals and treatments小节及Fig. 1图注 |
| 9/13-HODEs诱导肝脏脂肪变性 | 8周龄雄性小鼠,9-HODE和13-HODE等量混合总剂量0.5 μg/g体重,溶于PEG400:水(1:5),每日腹腔注射一次连续9天 阅读提示:Methods中Animals and treatments小节及Fig. 3图注 |
| 细胞衰老模型 | HepG2细胞:500 μM H2O2处理48 h;或2 μM DOX处理2 h后无药培养6天;或10 μM Nutlin-3a处理24 h。RAW264.7:2 μM DOX处理2 h后无药培养4天 阅读提示:Methods中Cell culture and cell senescent model小节 |
| 13-HODE处理原代肝细胞 | 1 μM 13-HODE处理48 h(部分实验处理2、6、12 h),无血清RPMI 1640培养基 阅读提示:Methods中Isolation of primary mouse hepatocytes and treatments小节及Fig. 4-6图注 |
| CAT过表达体内实验 | AAV8-Cat-flag剂量1.5×10^11 vg/小鼠,TBG启动子;8周龄小鼠注射10天后给予13-HODE 0.5 μg/g每日腹腔注射9天;8月龄小鼠注射AAV后2个月取材 阅读提示:Methods中Animals and treatments小节及Fig. 7图注 |
| SPR结合实验 | 重组小鼠CAT蛋白固定于CM5芯片,13(S)-HODE浓度0.061–500 μM,稳态亲和模型计算KD 阅读提示:Methods中Surface plasmon resonance小节及Fig. 5d |