PRDM16相互作用蛋白鉴定
寻找米色脂肪中调控PRDM16活性的因子。
从scWAT分化的米色脂肪细胞中免疫纯化PRDM16复合物并进行质谱鉴定,通过co-IP验证PRDM16与YAP/TAZ的相互作用及结合结构域。
Transcriptional repression of beige fat innervation via a YAP/TAZ-S100B axis.
包含细胞模型、多种基因修饰小鼠模型、AAV局部干预及患者数据再分析,并进行了功能与机制验证
SVF来源的米色脂肪细胞 HEK-293T细胞 脂肪细胞特异性Yap/Taz敲除小鼠(YT-AKO、YT-iAKO) HFD诱导肥胖及老龄小鼠模型
脂肪细胞特异性Yap/Taz敲除效率(scWAT和BAT中YAP/TAZ蛋白下降) YAP/TAZ与PRDM16 ZF2结构域相互作用及与C/EBPβ的竞争结合 S100b敲除对Yap/Taz缺失诱导的交感神经支配和UCP1表达的阻断 冷暴露或NE/FSK处理下YAP/TAZ磷酸化及核质转位 AAV-ADP-S100b在eWAT过表达对肥胖和葡萄糖稳态的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找米色脂肪中调控PRDM16活性的因子。
从scWAT分化的米色脂肪细胞中免疫纯化PRDM16复合物并进行质谱鉴定,通过co-IP验证PRDM16与YAP/TAZ的相互作用及结合结构域。
验证YAP/TAZ在 adaptive thermogenesis 中的功能。
构建脂肪细胞特异性Yap/Taz敲除小鼠,通过RNA-seq、RT-qPCR、免疫印迹、H&E染色及代谢笼分析检测scWAT和BAT中产热基因表达、形态及能量代谢。
确定Yap/Taz缺失诱导米色化的非脂肪细胞自主机制。
利用Adipo-Clear和3D成像观察交感神经支配,通过AAV在scWAT过表达S100B或联合敲除Yap/Taz与S100b,检测神经支配和UCP1表达。
阐明YAP/TAZ抑制S100b转录的分子机制。
通过ChIP-seq数据分析、CUT&Tag-qPCR、co-IP及报告基因实验,验证PRDM16和C/EBPβ结合S100b启动子及YAP/TAZ竞争性破坏复合物形成。
探究冷暴露诱导S100B表达的 upstream 信号。
用NE、FSK、H89及CL-316,243处理米色脂肪细胞,检测YAP/TAZ磷酸化、核质分布及PRDM16-C/EBPβ复合物形成;在体验证冷暴露和TAZ(4SA)表达的影响。
评估靶向YAP/TAZ-S100B轴的治疗潜力。
在老龄小鼠和HFD诱导肥胖小鼠中,通过脂肪细胞特异性Yap/Taz敲除或eWAT注射AAV-ADP-S100b,检测体重、脂肪量、葡萄糖耐量、胰岛素耐量、能量消耗及交感神经支配。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | 正常维持饲料 | Xietong Shengwu | 1010063 |
| HFD诱导肥胖模型 | 高脂饲料 | Research Diets | D12492 |
| 诱导性基因敲除 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | -- |
| 原代前脂肪细胞分离 | I型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- |
| SVF分离 | I型胶原酶 | Worthington | -- |
| RNA提取 | TRIzol | Sigma-Aldrich | -- |
| 逆转录 | 5×All-In-One MasterMix试剂盒 | abm | -- |
| RT-qPCR | ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| CUT&Tag | Hyperactive Universal CUT&Tag检测试剂盒 | Vazyme | TD903 |
| 抗PRDM16抗体 | R&D | AF6295 | |
| 抗C/EBPβ抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7962x | |
| 免疫印迹 | 抗UCP1抗体 | Sigma-Aldrich | U6382 |
| 抗PRDM16抗体 | R&D | AF6295 | |
| 抗C/EBPβ抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7962x | |
| 抗Perilipin抗体 | Vala Science | 4854 | |
| 抗磷酸化Perilipin(Ser522)抗体 | Vala Science | 4856 | |
| 抗Lamin B1抗体 | Protein Tech | 66095-1-Ig | |
| 抗α-tubulin抗体 | Sigma-Aldrich | T6199 | |
| 抗TH抗体 | Millipore | AB1542 | |
| 抗HSP90α/β抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13119 | |
| 抗Flag抗体 | Abmart | 293881 | |
| 山羊抗小鼠IgG:HRP | Thermo Scientific | 32430 | |
| 山羊抗兔IgG:HRP | Thermo Scientific | 31460 | |
| 驴抗羊IgG:HRP | R&D | HAF016 | |
| 抗YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 4912 | |
| 抗YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| 抗TAZ抗体 | Cell Signaling Technology | 4883 | |
| 抗TAZ抗体 | Cell Signaling Technology | 83669 | |
| 抗磷酸化YAP(Ser112)抗体 | Cell Signaling Technology | 4911 | |
| 抗磷酸化TAZ(Ser89)抗体 | Cell Signaling Technology | 59971 | |
| 抗HSL抗体 | Cell Signaling Technology | 4107 | |
| 抗磷酸化HSL(Ser660)抗体 | Cell Signaling Technology | 4126 | |
| 抗S100B抗体 | Cell Signaling Technology | 9550 | |
| 抗C/EBPα抗体 | Cell Signaling Technology | 2295 | |
| 抗PPARγ抗体 | Cell Signaling Technology | 2435 | |
| 抗PKA底物抗体 | Cell Signaling Technology | 9624 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 免疫共沉淀 | 抗HA磁珠 | Thermo Fisher Science | 88836 |
| Protein G磁珠 | Cell Signaling Technology | 37478 | |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG琼脂糖珠 | Smart Lifesciences | SA042001 |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD™可固定紫色死细胞染色剂 | Thermo Scientific | L34955 |
| 抗CD16/32抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD45-APC Cy7抗体 | BioLegend | 103116 | |
| 抗F4/80-FITC抗体 | Cell Signaling | 52267 | |
| 抗CD11c-AF647抗体 | BioLegend | 117314 | |
| 抗CD206-PE Cy7抗体 | BioLegend | 141720 | |
| 细胞免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记抗羊抗体 | Invitrogen | A11015 |
| Alexa Fluor 594标记抗兔抗体 | Abcam | ab150080 | |
| 全组织免疫染色 | 抗TH抗体 | Millipore | AB1542 |
| 抗UCP1抗体 | Abcam | ab10983 | |
| Alexa Fluor 488标记抗羊抗体 | Invitrogen | A11015 | |
| Alexa Fluor 488标记抗兔抗体 | Cell Signaling Technology | 4412 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 脂肪细胞特异性Yap/Taz敲除 | 他莫昔芬剂量100 mg/kg,腹腔注射,每两天一次共3次(条件性敲除)或每天一次共5次(HFD模型);8周龄雄性小鼠;敲除后4周取材 阅读提示:Methods中Mice小节 |
| 冷暴露与体温检测 | 冷暴露温度4°C,时间2天或7天;核心体温用直肠探头监测;体温低于30°C时 euthanize 阅读提示:Methods中Body temperature measurement小节及图2、图5图注 |
| CL-316,243刺激能量消耗 | CL-316,243剂量1 mg/kg体重,腹腔注射;30°C适应1天 阅读提示:Methods中CL-316,243-induced energy expenditure小节 |
| AAV介导的基因敲除或过表达 | AAV血清型RC2/8用于体内;AAV-ADP-S100b注射scWAT或eWAT 3-4周;AAV-tandem gRNA在Rosa26-LSL-Cas9;AdipoqCre小鼠局部注射 阅读提示:Methods中AAV and lentivirus production小节及图3、图5、图8图注 |
| 葡萄糖耐量试验和胰岛素耐量试验 | GTT:禁食8小时,葡萄糖2 g/kg体重腹腔注射;ITT:禁食6小时,胰岛素0.7 U/kg(ND年轻)、1 U/kg(ND老年)、1.5 U/kg(HFD)腹腔注射 阅读提示:Methods中Glucose homeostasis test in mice小节 |