验证单轮VSV-G假型HIV-1(i)GFPΔEnv病毒的组装与释放报告系统
确认该荧光标记单轮病毒可有效用于研究HIV-1组装和释放。
比较VSV-G假型HIV-1(i)GFPΔEnv与WT HIV-1的Gag释放、Gag成熟、病毒滴度及感染Jurkat T细胞的能力。
HIV-1 diverts cortical actin for particle assembly and release.
体外模型膜、感染T细胞系及原代PBL多层级证据,含功能验证(药物/敲低)和机制验证(STORM共定位、FCS扩散、免疫共沉淀)
VSV-G假型HIV-1(i)GFPΔEnv感染的Jurkat CD4+ T细胞系 HIV-1 WT或单轮病毒感染的原代人外周血淋巴细胞(PBL) 支持脂质双分子层(SLB)体外模型膜 293THEK细胞系(用于免疫共沉淀)
感染复数:500 ng/ml HIV-1 p24,37°C感染2小时 药物处理浓度与时间:感染后24小时加药,处理24小时,48小时收上清 CK666有效浓度:75 µM(非毒性最小有效浓度),对照CK689 Latrunculin B浓度:0.25和1 µM;Jasplakinolide浓度:0.25和1 µM siRNA电转:360 pmol Arpin siRNA或对照siRNA,电转1×10^6 Jurkat细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认该荧光标记单轮病毒可有效用于研究HIV-1组装和释放。
比较VSV-G假型HIV-1(i)GFPΔEnv与WT HIV-1的Gag释放、Gag成熟、病毒滴度及感染Jurkat T细胞的能力。
评估F-肌动蛋白聚合状态对HIV-1颗粒释放的作用。
在感染的Jurkat T细胞和原代PBL中,用Latrunculin B、Jasplakinolide、Rac1抑制剂EHT1864和CDC42 inhibitor III处理,检测p24释放和细胞活力。
验证抑制分支肌动蛋白是否促进HIV-1释放且不影响病毒成熟。
在感染的Jurkat T细胞和原代PBL中,用CK666(及无活性对照CK689)处理,检测p24释放动力学、Gag成熟比例。
探究CK666对质膜上Gag组装簇密度及Gag位点周围F-肌动蛋白密度的影响。
TIRF和STORM成像感染Jurkat T细胞表面Gag(i)GFP和F-肌动蛋白(phalloidin标记),定量Gag簇密度、大小及与F-肌动蛋白的共定位/反共定位。
在受控体外系统中验证肌动蛋白网络密度对Gag膜扩散和Gag诱导的PI(4,5)P2簇形成的影响。
在支持脂质双分子层上通过生物素-链霉亲和素-鬼笔环肽连接不同浓度肌动蛋白,形成不同密度网络;用svFCS测量Atto647N-PI(4,5)P2和Gag扩散,成像Gag诱导的PI(4,5)P2簇。
验证Arpin对HIV-1释放的必要性及其在感染后向细胞膜的招募。
siRNA敲低Arpin检测病毒释放;细胞膜漂浮实验和STORM检测Arpin膜结合;免疫共沉淀检测Gag与Arpin结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Latrunculin B | Calbiochem | -- |
| Jasplakinolide | Calbiochem | -- | |
| CK666 | Sigma Aldrich | -- | |
| CK689 | Sigma Aldrich | -- | |
| EHT1864 | Sigma Aldrich | -- | |
| CDC42抑制剂III | Calbiochem | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640 plus Glutamax培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | Dominique Dutscher | -- | |
| DMEM培养基 | GIBCO | -- | |
| 植物血凝素 | -- | -- | |
| 白细胞介素2 | -- | -- | |
| Western blot | 小鼠抗CAp24抗体 | NIH aids reagent program | 6521 |
| 抗Tsg101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| 兔多克隆抗Arpin抗体 | Sigma | ABT251 | |
| 兔多克隆抗Arpin抗体 | Invitrogen | PA5-98574 | |
| HRP偶联抗GAPDH抗体 | Sigma | G9295 | |
| STORM/TIRF成像 | GFP-Booster Alexa Fluor 568纳米抗体 | Chromotek | -- |
| F-actin标记 | 鬼笔环肽Alexa Fluor 647 | Invitrogen | -- |
| STORM成像 | TetraSpeck 0.1 µm微球 | Life Technologies Corporation | T7279 |
| siRNA电转 | 细胞系电转试剂盒 | Amaxa | V4xC1024 |
| 细胞活力检测 | CellTiter 96 AQ细胞活力检测试剂盒 | Promega | G3581 |
| 体外模型膜 | 脑磷脂酰丝氨酸 | Avanti Polar Lipids, Inc | -- |
| 脑磷脂酰肌醇4,5-二磷酸 | Avanti Polar Lipids, Inc | -- | |
| DSPE-PEG(2000)-生物素 | Avanti Polar Lipids, Inc | -- | |
| 肌动蛋白聚合 | 兔骨骼肌肌动蛋白 | Cytoskeleton, Inc | -- |
| 肌动蛋白连接 | 鬼笔环肽-XX-生物素 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 链霉亲和素 | MSD Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒感染与药物处理 | 感染复数(500 ng/ml p24)、感染时间(2小时)、加药时间(感染后24小时)、收上清时间(48小时) 阅读提示:Methods“Infection and drug treatment”小节 |
| CK666处理 | CK666浓度(75 µM为有效非毒性浓度)、对照CK689、处理时长(24小时) 阅读提示:Results“Actin debranching drug CK666...”及Fig. 2A-B |
| siRNA敲低Arpin | siRNA量(360 pmol)、电转细胞数(1×10^6 Jurkat)、敲低效率(44±4%) 阅读提示:Methods“siRNA electroporation”及Fig. 6 |
| STORM/TIRF成像 | 固定时间(感染后48小时)、Gag标记(GFP nanobody 1:500)、F-actin标记(phalloidin 1:20过夜)、成像缓冲液 阅读提示:Methods“Sample preparation for TIRF and STORM microscopy” |
| 体外SLB模型膜 | 脂质组成、肌动蛋白浓度(0–4.4 µM)、Gag浓度(10 nM或250 nM)、孵育时间(20分钟) 阅读提示:Methods“In vitro model membranes”和“Actin polymerization and fixation on SLB” |