验证T-ALL存活依赖髓系细胞密切接触
确定T-ALL细胞是否需要与肿瘤相关髓系细胞直接接触才能存活。
将LN3 T-ALL细胞与富集的肿瘤相关髓系细胞在Transwell板中同室或分隔培养,6–7天后流式检测T-ALL存活。
Integrin signaling is critical for myeloid-mediated support of T-cell acute lymphoblastic leukemia.
包含体外共培养、多种小鼠模型、患者原代细胞及患者数据集分析,并有功能与机制验证
小鼠原代LN3 T-ALL细胞与肿瘤相关髓系细胞共培养 LMO2转基因T-ALL小鼠模型 Icam1-/-与Icam1+/-小鼠T-ALL移植模型 儿童T-ALL患者原代细胞与PBMC来源单核细胞/巨噬细胞共培养
T-ALL细胞与髓系细胞共培养6–7天,Transwell分隔培养与直接接触比较 抗ICAM-1和/或抗VCAM-1阻断抗体10 µg/ml处理共培养 FAK/PYK2抑制剂PF-562271或PF-431396浓度0.1–2.5 µM处理 小鼠体内PF-562271按25 mg/kg每日腹腔注射10–11天 患者T-ALL细胞与单核细胞或M-CSF巨噬细胞按1:1或2:1比例共培养
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定T-ALL细胞是否需要与肿瘤相关髓系细胞直接接触才能存活。
将LN3 T-ALL细胞与富集的肿瘤相关髓系细胞在Transwell板中同室或分隔培养,6–7天后流式检测T-ALL存活。
寻找介导T-ALL与髓系细胞相互作用的候选分子。
重新分析RNA-seq数据,并用流式细胞术和qPCR检测T-ALL细胞整合素及髓系细胞黏附分子表达。
验证整合素介导的黏附是否支持T-ALL存活及IGF1R激活。
在T-ALL与髓系细胞共培养中加入抗ICAM-1/VCAM-1或抗整合素抗体、LFA-1抑制剂,检测存活及pIGF1R/pAKT。
确定整合素配体在体内对T-ALL建立和进展的影响。
将LN3 T-ALL细胞移植入Icam1-/-或Icam1+/-小鼠,并给予抗VCAM-1或抗ICAM-1抗体,评估白血病负荷和生存。
确定FAK/PYK2是否下游于整合素信号并支持T-ALL存活。
检测T-ALL细胞pFAK/pPYK2水平,使用FAK/PYK2抑制剂处理共培养并检测存活和pIGF1R。
评估FAK/PYK2抑制剂在体内对白血病负荷和生存的作用。
在LN3 T-ALL移植小鼠中腹腔注射PF-562271,检测多器官白血病负荷和生存。
确定小鼠发现是否适用于原代患者T-ALL细胞。
将儿童T-ALL患者细胞与PBMC来源单核细胞或M-CSF巨噬细胞共培养,加入阻断抗体或PF-562271,检测存活和pIGF1R。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD4-PerCP/Cy5.5抗体 | BioLegend | -- |
| 抗小鼠CD5-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD45.1-FITC抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD45.2-APC/Cy7抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD11a-FITC抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD29-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD54-PerCP/Cy5.5抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD106-PerCP/Cy5.5抗体 | BioLegend | -- | |
| 细胞内流式 | 磷酸化IGF1R-Alexa Fluor 647抗体 | BD Biosciences | -- |
| 磷酸化AKT-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 磷酸化PYK2-PE抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 磷酸化FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3283 | |
| 磷酸化FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3284 | |
| 磷酸化FAK抗体 | Invitrogen | 44–626 G | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gemini Bio-Products | -- | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | -- | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | -- | |
| MEM非必需氨基酸溶液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素-链霉素-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 细胞分离 | MojoSort链霉亲和素纳米磁珠 | BioLegend | -- |
| 链霉亲和素磁珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| MACS LS柱 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 细胞培养 | Ficoll分离液 | -- | -- |
| Histopaque密度梯度分离液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | -- | |
| 药物处理 | BMS-587101 LFA-1抑制剂 | -- | -- |
| PF-431396 FAK/PYK2抑制剂 | Selleckchem | -- | |
| PF-562271 FAK/PYK2抑制剂 | Selleckchem | -- | |
| 重组小鼠IGF1 | Peprotech | -- | |
| 体内实验 | 体内用抗小鼠VCAM-1抗体 | BioXCell | -- |
| 体内用抗小鼠ICAM-1抗体 | BioXCell | -- | |
| PEG300 | Selleckchem | -- | |
| TWEEN 80 | Sigma-Aldrich | -- | |
| qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| qScript cDNA合成试剂盒 | Quantabio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T-ALL与髓系细胞共培养 | T-ALL细胞数量3×10^5、髓系细胞2–2.5×10^4、培养6–7天 阅读提示:Methods中“In vitro cultures of mouse and human T-ALL cells” |
| Transwell接触依赖性实验 | 0.4 µm孔径插入物、上下室细胞数量、培养6–7天 阅读提示:Methods中“Transwell assays”及Fig. 1a |
| 抗体阻断黏附分子 | 抗ICAM-1和抗VCAM-1各10 µg/ml(患者抗ICAM-1 20 µg/ml)、处理时间6–7天 阅读提示:Methods中“In vitro cultures”及Fig. 2a、Fig. 7a图注 |
| FAK/PYK2抑制剂体外处理 | PF-562271或PF-431396浓度0.1–2.5 µM、培养4–5天后加药、2–3天后检测 阅读提示:Methods中“In vitro cultures”及Fig. 5e图注 |
| 小鼠体内抗体阻断 | 抗体100 µg/只、每2天腹腔注射共5次、末次注射后24–48小时评估 阅读提示:Methods中“In vivo inhibition of integrin-mediated cell adhesion or FAK/PYK2 signaling” |
| 小鼠体内FAK/PYK2抑制 | PF-562271 25 mg/kg每日腹腔注射10–11天、末次注射后1–3小时评估 阅读提示:Methods中“In vivo inhibition of integrin-mediated cell adhesion or FAK/PYK2 signaling” |
| 患者T-ALL细胞共培养 | 患者T-ALL细胞1×10^5、单核细胞或巨噬细胞1:1或2:1、共培养6–7天 阅读提示:Methods中“In vitro cultures of mouse and human T-ALL cells” |