鉴定TMZ衍生AICA的胞内代谢产物
验证TMZ衍生的AICA在GBM细胞中是否转化为AICAR
用15N标记TMZ及不同剂量TMZ或AICA处理GBM细胞,HPLC-MS检测胞内AICA与AICAR水平
Hypoxanthine phosphoribosyl transferase 1 metabolizes temozolomide to activate AMPK for driving chemoresistance of glioblastomas.
含细胞模型、纯化蛋白体外实验、颅内移植瘤小鼠模型、患者GBM样本IHC与生存分析,并完成功能与机制验证。
U87、U251、MES28、GSC3028等GBM细胞系 纯化重组HPRT1/RRM1/RRM2蛋白 颅内注射GBM细胞的裸鼠移植瘤模型 原发与复发GBM患者样本
TMZ及AICA处理剂量(如TMZ 0.2/0.4 mM、AICA 0.25/0.5 mM)与处理2 h的HPLC-MS代谢物检测 HPRT1敲低及回补WT/D138N/K166A突变体的AICA/AICAR检测与AMPK活化 RRM1 T52A突变与AMPKα1/2双敲除对RRM1 pT52及RNR活性的影响 颅内移植瘤小鼠TMZ 20 mg/kg、6-MP 20 mg/kg腹腔注射连续5天,每组n=10 收集的原发100例、复发50例GBM样本IHC评分与Kaplan-Meier生存分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TMZ衍生的AICA在GBM细胞中是否转化为AICAR
用15N标记TMZ及不同剂量TMZ或AICA处理GBM细胞,HPLC-MS检测胞内AICA与AICAR水平
筛选负责AICA向AICAR转化的磷酸核糖转移酶
敲低HPRT1、APRT、UMPS、UPRT、QPRT,检测15N-AICA/15N-AICAR;回补WT及催化失活HPRT1突变体;纯化HPRT1体外反应测定动力学
明确TMZ诱导AMPK激活主要经AICA-AICAR而非甲基重氮离子或ROS
TMZ、AICA、Mesna、WR-1065、NAC处理后免疫印迹检测AMPK pT172与ACC1 pS79;HPRT1敲低及回补突变体检测AMPK活化
验证AMPK与RRM1结合并磷酸化T52位点
免疫共沉淀与质谱鉴定AMPKα1结合蛋白及RRM1磷酸化位点;体外激酶实验、特异性pT52抗体、化学计量分析;细胞中检测TMZ诱导的RRM1 pT52
确定RRM1 T52磷酸化对RNR活性及TMZ诱导损伤修复的影响
体外RNR活性检测与ATP Kd测定;细胞中RNR活性、γ-H2AX、凋亡与增殖检测;MGMT状态相关实验
在颅内移植瘤模型中验证该通路对TMZ耐药的贡献
颅内注射荧光素酶标记的MES28或U87细胞,TMZ治疗并用IVIS监测肿瘤生长、记录生存,IHC检测ACC1 pS79、γ-H2AX、RRM1 pT52及TUNEL
验证HPRT1抑制剂6-MP能否阻断该轴并增强TMZ疗效
细胞中15N-AICA/AICAR检测、联合指数计算、AMPK/RRM1 pT52检测;荷瘤小鼠TMZ联合6-MP治疗,检测肿瘤生长、生存、IHC及TUNEL,并评估正常组织毒性
评估HPRT1/AMPK/RRM1通路与GBM患者预后的关系
对100例原发及50例复发GBM样本进行HPRT1、AMPK pT172、RRM1 pT52 IHC评分,结合TCGA等数据库进行Kaplan-Meier与相关性分析
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | HRP标记抗小鼠二抗 | Santa Cruz Biotechnology | sc-525409 |
| HRP标记抗兔二抗 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2357 | |
| ACC1 pS79抗体 | Cell Signaling Technology | 11818 | |
| ACC1抗体 | Cell Signaling Technology | 3676 | |
| AMPKα pT172抗体 | Cell Signaling Technology | 50081 | |
| AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 5831 | |
| AMPKα1抗体 | Cell Signaling Technology | 4148 | |
| AMPK β1抗体 | Cell Signaling Technology | 12063 | |
| γH2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 9718 | |
| α-Tubulin抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| MGMT抗体 | Abcam | ab108630 | |
| UPRT抗体 | Abcam | ab251653 | |
| APRT抗体 | Proteintech | 21405-1-AP | |
| OPRT抗体 | Proteintech | 14830-1-AP | |
| QPRT抗体 | Proteintech | 25174-1-AP | |
| HPRT1抗体 | Proteintech | 15059-1-AP | |
| RRM1抗体 | Proteintech | 10526-1-AP | |
| RRM1 pT52抗体 | Affinity Biosciences LTD | -- | |
| 药物处理 | AICA | Sigma-Aldrich | 552410 |
| 体外酶反应 | 次黄嘌呤 | Sigma-Aldrich | H9377 |
| 鸟嘌呤 | Sigma-Aldrich | G11950 | |
| 磷酸核糖焦磷酸 | APExBIO | C5321 | |
| 药物处理 | 美司钠 | APExBIO | A8469 |
| WR-1065 | APExBIO | A4487 | |
| 替莫唑胺 | Selleckchem | S1237 | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Selleckchem | S1623 | |
| A769662 | Selleckchem | S2697 | |
| 6-巯基嘌呤 | Selleckchem | S1305 | |
| O6-苄基鸟嘌呤 | Selleckchem | S3658 | |
| 蛋白纯化 | HisPur Ni-NTA树脂 | Thermo Scientific | 88222 |
| 体外激酶实验 | [γ-32P]ATP | Hartmann Analytic | SRP-401 |
| 活性AMPK蛋白 | SignalChem Biotech | P47-10H | |
| 凋亡分析 | Annexin V-FITC | Vazyme | A211 |
| PI染色液 | Vazyme | -- | |
| TUNEL分析 | TUNEL BrightGreen凋亡检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 增殖检测 | CellTiter-Glo | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TMZ/AICA代谢物检测 | TMZ或AICA剂量、处理时间、细胞系及每组重复数(六重复) 阅读提示:Fig. 1b–d图注与Methods中HPLC-MS分析小节 |
| HPRT1催化与动力学 | HPRT1敲低与WT/D138N/K166A回补、PRPP与AICA浓度及反应时间 阅读提示:Fig. 3及Methods中HPRT1活性检测与Km测定小节 |
| AMPK磷酸化RRM1 T52 | TMZ 0.2 mM处理2 h、AMPKα1/2 DKO、体外激酶缓冲液与[γ-32P]ATP条件 阅读提示:Fig. 4图注与Methods中体外AMPK磷酸化实验小节 |
| 颅内移植瘤体内实验 | 细胞接种数量、小鼠周龄性别、TMZ与6-MP各20 mg/kg腹腔注射连续5天、每组n=10 阅读提示:Fig. 6、Fig. 7图注与Methods中Mice小节 |
| 患者预后分析 | 原发GBM 100例与复发GBM 50例、IHC评分标准、生存分析分组 阅读提示:Fig. 8图注与Methods中Clinical samples小节 |