PfPPP8鉴定与定位
验证PfPPP8是否为基底复合体蛋白
通过PfCINCH免疫共沉淀鉴定PF3D7_1018200/PfPPP8,构建C端smV5标签虫株,免疫荧光观察与PfMORN1和PfBCP1的共定位。
A PPP-type pseudophosphatase is required for the maintenance of basal complex integrity in Plasmodium falciparum.
体外寄生虫培养、基因敲低、多种显微成像、共免疫沉淀、重组蛋白活性测定等多层级功能与机制验证
恶性疟原虫3D7株 PfPPP8-smV5Tet条件敲低虫株 PfCINCH-smMyc等报告虫株
PfPPP8-smV5Tet虫株在±500 nM ATc条件下的生长曲线(n=3) PfPPP8敲低效率的免疫印迹定量(n=4,敲低86±4%) E64(1 mM,48 hpi处理3 h) stalled裂殖体的免疫荧光和透射电镜表型 基底复合体环圆度(n=230)和直径(n>100)的定量分析 共免疫沉淀鉴定的PfPPP8和PfCINCH consensus互作蛋白
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PfPPP8是否为基底复合体蛋白
通过PfCINCH免疫共沉淀鉴定PF3D7_1018200/PfPPP8,构建C端smV5标签虫株,免疫荧光观察与PfMORN1和PfBCP1的共定位。
确定PfPPP8对无性复制的必要性
利用TetR-DOZI系统构建PfPPP8-smV5Tet虫株,在±500 nM ATc条件下进行三周期生长曲线,并通过免疫印迹定量敲低效率。
评估PfPPP8缺失对子代细胞形成的影响
用E64 stalled裂殖体,通过免疫荧光检测PfGAP45、PfAMA1、PfMSP1、PfMORN1,并通过透射电镜观察超微结构。
量化PfPPP8缺失对基底复合体形态和扩张的影响
以PfCINCH-smMyc为标记,测量基底复合体环圆度和直径;利用U-ExM和活细胞成像追踪基底复合体动态。
验证PfPPP8及其同源物是否具有磷酸酶活性
重组表达PfPPP8、CpPPP8、ScPPT1的磷酸酶结构域(6xHis或MBP标签),进行pNPP去磷酸化实验。
发现并验证新的基底复合体蛋白及其时间定位
对同步化中期分节寄生虫进行共免疫沉淀,选择PfMyoJ和PF3D7_0214700构建smV5标签虫株,免疫荧光验证定位。
确定PfPPP8在分节结束和裂殖子形成过程中的动态
通过免疫印迹、U-ExM时间进程和活细胞荧光成像追踪PfPPP8与PfCINCH、PfBLEB的相对荧光强度变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 鼠抗V5抗体 | Bio-Rad | MCA1360 |
| 鼠抗Myc抗体克隆9E10 | Bio-Rad | MCA2200GA | |
| 兔抗HaloTag抗体 | Promega | G9281 | |
| 山羊抗鼠IgG AlexaFluor 488 | ThermoFisher | A11029 | |
| 山羊抗兔AlexaFluor 555 | ThermoFisher | A21429 | |
| Hoechst 33342 | -- | -- | |
| VectaShield Vibrance封片剂 | -- | -- | |
| 活细胞成像 | JaneliaFluor 647 HaloTag配体 | Promega | -- |
| 共免疫沉淀 | Pierce抗c-Myc磁珠 | Pierce | 88842 |
| MBL抗V5标签磁珠 | MBL | M167-11 | |
| 分子克隆 | Golden Gate BsaI-HF v2组装试剂盒 | NEB | -- |
| NEBuilder HiFi DNA组装克隆试剂盒 | NEB | -- | |
| 寄生虫培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma | -- |
| Albumax II | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | WR99210 | Jacobus Pharmaceuticals | -- |
| 杀稻瘟菌素 | Research Products International | -- | |
| 脱水四环素 | -- | -- | |
| E64 | -- | -- | |
| 流式分析 | SYBR green | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PfPPP8条件敲低 | ATc浓度500 nM;同步化方法:60% Percoll密度离心和5%山梨醇;敲低时间:再入侵后2小时拆分 阅读提示:Methods 'PfPPP8 depletion' |
| 生长曲线 | 起始寄生虫血症0.2%,血细胞比容1%,三重复,第1、3、5、7天取样;SYBR green流式检测 阅读提示:Methods 'Replication assay' |
| E64 stalled表型 | E64浓度1 mM,48 hpi处理3小时;透射电镜固定液配方 阅读提示:Methods 'Transmission electron microscopy' |
| 免疫荧光 | 一抗稀释比例如anti-V5 1:500,anti-PfMORN1 1:1000;固定4% PFA 10分钟,透化0.1% Triton X-100 阅读提示:Methods 'Immunofluorescence' |
| 活细胞成像 | HaloTag配体800 nM,Trolox 0.5 mM,成像间隔20分钟;激光功率和曝光时间 阅读提示:Methods 'Live cell microscopy' |
| 共免疫沉淀 | 同步化至3%裂殖体血症,PKG抑制剂C1 2.5 μM stalled至约50 hpi;裂解液RIPA配方 阅读提示:Methods 'Immunoprecipitation' |