DYNLRB2表达与动力蛋白复合体形成验证
验证DYNLRB2是否为睾丸上调的动力蛋白轻链并组装入动力蛋白复合体。
通过RT-PCR、Western blot、单细胞RNA-seq数据分析、免疫共沉淀、酵母双杂交和蔗糖密度梯度离心检测DYNLRB2表达、相互作用及复合体形成。
Distinct dynein complexes defined by DYNLRB1 and DYNLRB2 regulate mitotic and male meiotic spindle bipolarity.
包含Dynlrb2 KO小鼠体内模型、Dynlrb1 KD细胞系、原代成纤维细胞及单分子体外实验,并有功能与机制验证。
Dynlrb2敲除(Dynlrb2−/−)小鼠睾丸及精母细胞 B16-F1小鼠黑色素瘤细胞系(Dynlrb1敲低) HEK293人胚肾细胞系(hDYNLRB1敲低) Dynlrb2−/−小鼠胚胎成纤维细胞和耳成纤维细胞
Dynlrb2−/−小鼠基因型及DYNLRB2蛋白表达缺失验证(Western blot和免疫染色) Dynlrb2−/−雄性小鼠不育及睾丸缩小表型,附睾管中精子存在率(WT 99.8%,KO 0%) Dynlrb2−/−精母细胞中期I多极纺锤体比例及PCM碎片化频率 Dynlrb2−/−精母细胞中NuMA在纺锤体极的信号强度(较WT降低约60%)及中心粒过早分离比例(约23%) B16-F1细胞中Dynlrb1 siRNA敲低效率及多极纺锤体比例;HEK293细胞中hDYNLRB1敲低表型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DYNLRB2是否为睾丸上调的动力蛋白轻链并组装入动力蛋白复合体。
通过RT-PCR、Western blot、单细胞RNA-seq数据分析、免疫共沉淀、酵母双杂交和蔗糖密度梯度离心检测DYNLRB2表达、相互作用及复合体形成。
确定DYNLRB2在雄性生殖和减数分裂中的功能。
构建Dynlrb2 KO小鼠,检测生育力、睾丸重量、组织学、TUNEL凋亡及精母细胞染色体铺展分期。
分析Dynlrb2−/−精母细胞中期I纺锤体形态及动粒-微管连接缺陷。
免疫染色α-tubulin、SYCP3、BubR1及星体微管,定量纺锤体极数目、宽度、长度、角度、染色体错排和动粒-微管连接错误。
检验DYNLRB2是否通过维持中心粒连接防止PCM碎片化。
免疫染色γ-tubulin、PCNT、CETN2、STIL和SAS-6,定量PCM碎片化、中心粒数目及母-子中心粒过早分离。
确定DYNLRB2是否通过将NuMA招募至纺锤体极维持纺锤体双极性。
免疫染色NuMA、Eg5、DYNC1H1、DYNLL1、p150、NDC80、CENP-E和PLK1,并进行免疫共沉淀和Western blot。
验证DYNLRB1是否在有丝分裂细胞中通过NuMA和中心粒调控纺锤体双极性。
在B16-F1和HEK293细胞中进行Dynlrb1 siRNA敲低,免疫染色检测纺锤体极、PCM、CETN2、NuMA及染色体排列。
检验DYNLRB2能否替代DYNLRB1的有丝分裂功能及两种复合体的运动活性。
在Dynlrb1 KD细胞中共转染RNAi抗性GFP-DYNLRB1或GFP-DYNLRB2进行回补;纯化FLAG-hDYNLRB1/2动力蛋白复合体进行单分子运动分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| TUNEL检测 | ApopTag Plus原位凋亡荧光检测试剂盒 | Millipore | S 7111 |
| 免疫荧光染色 | 驴抗兔Alexa 488二抗 | Invitrogen | A21206 |
| 驴抗兔Alexa 594二抗 | Invitrogen | A21207 | |
| 驴抗鼠Alexa 594二抗 | Invitrogen | A21203 | |
| 驴抗鼠Alexa 488二抗 | Invitrogen | A21202 | |
| 山羊抗鸡Alexa 647二抗 | Invitrogen | A21449 | |
| 驴抗大鼠Alexa 594二抗 | Invitrogen | A21209 | |
| 驴抗大鼠Alexa 488二抗 | Invitrogen | A21208 | |
| 驴抗山羊Alexa 488二抗 | Invitrogen | A32814 | |
| 驴抗绵羊Alexa 594二抗 | Invitrogen | A11016 | |
| 含DAPI的Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | -- | |
| 免疫共沉淀 | Dynabeads蛋白A磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| cOmplete蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| Plasmocin抗菌剂 | InvivoGen | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Opti-MEM培养基 | GIBCO Life Technologies | -- | |
| MISSION siRNA通用阴性对照#1 | Thermo Fisher | -- | |
| 单分子成像 | 抗FLAG M2亲和凝胶 | Millipore | -- |
| 3×FLAG肽 | ApexBio | -- | |
| Ti2-E Eclipse显微镜 | Nikon | -- | |
| iXon Ultra 897电子倍增CCD相机 | Andor Technology | -- | |
| Western blot | 兔抗DYNLRB2抗体 | this study | -- |
| 兔抗DYNC1H1抗体 | Proteintech | 12345-1-AP | |
| 免疫荧光染色 | 兔抗DYNC1I2抗体 | BETHYL | A304-529A-T |
| 兔抗STIL抗体 | BETHYL | A302-442A | |
| 兔抗DYNLL1抗体 | Abcam | ab51603 | |
| 兔抗KIF11(Eg5)抗体 | Sigma | HPA010568 | |
| 兔抗α-微管蛋白抗体 | Abcam | ab18251 | |
| 兔抗SYCP1抗体 | Abcam | ab15090 | |
| 兔抗NuMA抗体 | Abcam | ab36999 | |
| Western blot | 兔抗NuMA抗体 | Abcam | ab109262 |
| 免疫荧光染色 | 兔抗γ-微管蛋白抗体 | Abcam | ab11317 |
| 兔抗pericentrin(PCNT)抗体 | Abcam | ab4448 | |
| 兔抗NDC80抗体 | this study | -- | |
| 鼠抗MLH1抗体 | BD Biosciences | 51-1327GR | |
| Western blot | 鼠抗β-ACTIN抗体 | Sigma | A2228-200UL |
| 免疫荧光染色 | 鼠抗α-微管蛋白抗体 | Abcam | ab7291 |
| 鼠抗γ-微管蛋白抗体 | Abcam | ab27074 | |
| 鼠抗PLK1抗体 | Abcam | ab17056 | |
| 鼠抗CENP-E抗体 | this study | -- | |
| 鼠抗DYNC1I1/2抗体 | Millipore | MAB1618 | |
| 鼠抗SAS-6抗体 | Santa Cruz | Sc-81431 | |
| 鼠抗DYNC1LI2抗体 | this study | -- | |
| 山羊抗DCTN1(P150)抗体 | Abcam | ab11806 | |
| 绵羊抗BubR1抗体 | Abcam | ab28193 | |
| 大鼠抗CENTRIN2(CETN2)抗体 | BioLegend | 698602 | |
| 鸡抗SYCP3抗体 | Hiroki Shibuya lab | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Dynlrb2敲除小鼠表型分析 | 小鼠遗传背景(C57BL/6N)、基因型鉴定、年龄(PD7和PD60)、组织固定条件(Bouin固定24 h)及TUNEL阳性判定阈值(每个生精小管>3个TUNEL阳性细胞) 阅读提示:Methods中Mice和Histological analysis小节;Fig. 2e、2f图注 |
| 精母细胞纺锤体免疫染色与定量 | 压片法制备样本、中期I细胞鉴定标准(SYCP3在动粒且无SYCP1)、每组细胞数和独立小鼠数、纺锤体极数目及宽度/长度/角度测量方法 阅读提示:Methods中Immunostaining of spermatocytes小节;Fig. 3a–c图注 |
| 中心粒分离与PCM碎片化分析 | CETN2焦点计数标准、PCM碎片化判定、STIL和SAS-6信号缺失判定、每组细胞数及独立实验次数 阅读提示:Fig. 5a、5d–5i图注;Results中Premature centriole disengagement段落 |
| Dynlrb1敲低细胞实验 | B16-F1和HEK293细胞培养条件(DMEM含10% FBS、100 U/ml青霉素-链霉素、2.5 μg/ml Plasmocin)、siRNA转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染后检测时间(48 h)及敲低效率验证方法 阅读提示:Methods中Cell culture小节;Fig. 7b、7c图注 |
| 单分子运动分析 | GFP-动力蛋白重链稳定表达HeLa细胞、FLAG-hDYNLRB1/2转染量(2 μg)、FLAG免疫沉淀洗脱条件、成像帧率(每300 ms)和总时长(3 min)、生物学重复数(3次) 阅读提示:Methods中Single-molecule imaging小节;Fig. 8c图注 |