他汀处理增加HMG-CoA水平
验证他汀抑制HMGCR是否导致其底物HMG-CoA积累
HepG2细胞用辛伐他汀处理24小时,靶向质谱检测10种酰基辅酶A;C57BL/6NJ小鼠喂食含阿托伐他汀饲料2-4周,检测肝脏酰基辅酶A
Statin therapy inhibits fatty acid synthase via dynamic protein modifications.
包含HepG2细胞、小鼠模型、纯化FAS体外实验、质谱鉴定修饰位点及功能验证
HepG2细胞 C57BL/6NJ小鼠 纯化猪FAS
辛伐他汀处理HepG2细胞24小时,HMG-CoA水平变化(n=6,两次独立实验各三个生物学重复) 阿托伐他汀饮食喂养C57BL/6NJ小鼠2-4周,肝脏HMG-CoA水平(n=4生物学重复) Western blot检测HMG化修饰:非还原、非加热条件,使用抗HMG-赖氨酸抗体 质谱鉴定HMG化位点:磷酸泛酰巯基乙胺、丝氨酸581、赖氨酸673 FAS活性测定:监测NADPH氧化,HMG-CoA预孵育30分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证他汀抑制HMGCR是否导致其底物HMG-CoA积累
HepG2细胞用辛伐他汀处理24小时,靶向质谱检测10种酰基辅酶A;C57BL/6NJ小鼠喂食含阿托伐他汀饲料2-4周,检测肝脏酰基辅酶A
检测HMG-CoA增加是否导致蛋白质HMG化
HepG2细胞用不同浓度辛伐他汀处理不同时间,小鼠肝脏样品,Western blot使用抗HMG-赖氨酸抗体;免疫沉淀结合质谱鉴定修饰蛋白
探究FAS HMG化的机制是否依赖HMG酸酐形成及CoA
HepG2细胞裂解液与HMG-CoA孵育,SDS变性后孵育,HMG-NAC处理,Western blot检测HMG化
验证FAS HMG化是否源于胆固醇合成途径的HMG-CoA
使用hymeglusin抑制HMGCS1,联合辛伐他汀处理HepG2细胞,检测HMG-CoA水平和FAS HMG化
表征FAS HMG化的化学特性及动态性
纯化FAS与HMG-CoA及丙二酰辅酶A共孵育,HepG2细胞他汀处理及去除,DTT/加热处理,羟胺处理,Western blot检测
确定FAS上HMG修饰的具体氨基酸残基
纯化FAS与HMG-CoA孵育,Glu-C和胃蛋白酶消化,LC-MS/MS及PRM分析;HepG2细胞FAS免疫沉淀后质谱
评估HMG化对FAS酶活及细胞/小鼠de novo脂肪生成的影响
纯化FAS活性测定(NADPH氧化);HepG2细胞和 mice deuterated water标记,GC-MS检测棕榈酸合成
验证FAS亚群与HMGCR邻近,并鉴定HMG化FAS相关的细胞信号变化
邻近连接实验检测FAS-HMGCR相互作用;共免疫沉淀;无标记定量蛋白质组学比较辛伐他汀、hymeglusin、二甲双胍处理
探究AMPK激活是否通过抑制HMGCR诱导FAS HMG化
HepG2细胞二甲双胍处理24小时,检测HMG-CoA和FAS HMG化;AICAR处理;蛋白质组学比较
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Thermo | 11960 |
| 药物处理 | 辛伐他汀 | Sigma | -- |
| hymeglusin | Cayman Chemical | -- | |
| Western blot | HMG抗体 | Millipore | ABS2108 |
| FAS抗体 | abcam | ab184619 | |
| HMGCR抗体 | Millipore | ABS229 | |
| 磷酸化ACC抗体 | CST | 3661 | |
| 总ACC抗体 | CST | 3662 | |
| LI-COR 926-32213 驴抗兔二抗 | LI-COR | 926-32213 | |
| LI-COR 925-68072 驴抗鼠二抗 | LI-COR | 925-68072 | |
| 蛋白纯化 | 150 kDa截留分子量离心过滤管 | Sigma | -- |
| 体外化学处理 | HMG-CoA | Sigma | -- |
| 丙二酰辅酶A | Sigma | -- | |
| 质谱 | Glu-C蛋白酶 | Promega | -- |
| 胃蛋白酶 | Promega | -- | |
| Pierce去污剂去除柱 | Pierce | 87777 | |
| 三(2-羧乙基)膦 | Sigma | -- | |
| N-乙基马来酰亚胺 | Alfa Aesar | -- | |
| FAS活性测定 | 乙酰辅酶A | Sigma | -- |
| NADPH | Roche | -- | |
| GC-MS | Agilent 7890B气相色谱系统 | Agilent | -- |
| Agilent 5977 A质谱仪 | Agilent | -- | |
| Agilent 5973N质谱检测器 | Agilent | -- | |
| 邻近连接实验 | Sigma Duolink Probemaker试剂盒 | Sigma | -- |
| Sigma Duolink原位检测绿色试剂盒 | Sigma | -- | |
| 共免疫沉淀 | HMGCR偶联琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271595 |
| Western blot | 抗FAS小鼠单克隆抗体 | Sigma-Aldrich | WH0002194M1 |
| 蛋白质组学 | EASY-nLC超高效液相色谱系统 | Thermo | -- |
| Q Exactive Plus混合四极杆-轨道阱质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | HepG2细胞培养基:高糖无谷氨酰胺DMEM+10% FBS;辛伐他汀浓度2 μM(除非另说明);处理时间24小时(或指示时间);DMSO终浓度0.1% 阅读提示:Methods: Cell lines and reagents |
| 动物实验 | 小鼠品系C57BL/6NJ,12-24周龄,雌雄均用;阿托伐他汀剂量0.01%混入饲料,处理12-14天;处死前2小时灌胃100 mg/kg阿托伐他汀;氘水注射27 μL/g体重,饮水4%氘水 阅读提示:Methods: Statin-treated mice |
| Western blot检测HMG化 | 样品未加热、非还原条件(除非另说明);HMG抗体1:1000;FAS抗体1:5000;封闭1%鱼明胶;抗体稀释液含30 mg/mL BSA 阅读提示:Methods: Western blotting |
| 质谱鉴定修饰位点 | FAS 25 μg,HMG-CoA 10 μM,37°C 30分钟;Glu-C 1:20或胃蛋白酶1:100;LC-MS/MS参数设置 阅读提示:Methods: Identification of HMGylation sites via mass spectrometry |
| FAS活性测定 | FAS 30 nM,HMG-CoA预孵育30分钟37°C;反应体系含50 mM磷酸盐pH 7.0,40 μM乙酰辅酶A,60 μM NADPH;丙二酰辅酶A 40 μM启动反应;340 nm吸光度每20秒读数10分钟 阅读提示:Methods: Fatty acid synthase activity assay |