患者肺组织中PRMT7表达分析
验证PRMT7在COPD患者肺组织中的表达及细胞定位
对COPD患者和对照肺组织进行GSEA、qPCR、Western blot和免疫荧光,检测PRMT7表达及与巨噬细胞标志物的共定位。
The arginine methyltransferase PRMT7 promotes extravasation of monocytes resulting in tissue injury in COPD.
包含患者肺组织、多种小鼠模型、体外细胞实验及组学分析,并进行了功能与机制验证
COPD患者肺组织样本 CS暴露小鼠模型 Prmt7+/−小鼠及Lyz2-Cre Prmt7fl/fl小鼠 MH-S和RAW264.7巨噬细胞系
Prmt7+/−小鼠与野生型对照在CS暴露4个月后的巨噬细胞募集和肺功能 MH-S细胞中CRISPR/Cas9敲除Prmt7对迁移和黏附的影响 PRMT7抑制剂SGC3027处理对RAP1A和整合素表达的影响 COPD患者肺组织中PRMT7表达与疾病严重程度的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PRMT7在COPD患者肺组织中的表达及细胞定位
对COPD患者和对照肺组织进行GSEA、qPCR、Western blot和免疫荧光,检测PRMT7表达及与巨噬细胞标志物的共定位。
确定PRMT7缺失对单核细胞募集和肺损伤的影响
使用Prmt7+/−小鼠和Lyz2-Cre Prmt7fl/fl小鼠,在CS暴露、弹性蛋白酶诱导、博来霉素诱导和皮肤损伤模型中评估巨噬细胞募集、肺损伤和肺功能。
阐明PRMT7通过RAP1A调控黏附和迁移的分子机制
在MH-S和RAW264.7细胞中CRISPR/Cas9敲除Prmt7,进行Transwell迁移、伤口愈合、黏附实验,检测RAP1A、ITGAL/ITGAM表达及MAPK磷酸化;通过ATAC-Seq和ChIP-qPCR分析Rap1a调控。
验证炎症巨噬细胞通过ALOX5/LTB4诱导AT2细胞铁死亡
用极化巨噬细胞条件培养基处理MLE12细胞,检测细胞死亡、脂质过氧化和ACSL4表达;使用siRNA敲低Alox5,并检测LTB4水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 巨噬细胞极化 | 重组小鼠IFNγ | ImmunoTools | -- |
| 重组小鼠IL4 | ImmunoTools | -- | |
| LPS刺激 | 脂多糖(大肠杆菌O55:B5) | Sigma-Aldrich | -- |
| PRMT7抑制 | SGC3027 | Structural Genomics Consortium | -- |
| 铁死亡诱导 | (1S,3R)-RSL3 | -- | -- |
| 流式分析 | PE标记抗CD11b抗体(克隆M1/70.15.11.5) | Miltenyi Biotec | 130-091-240 |
| FITC标记抗CD11a抗体(克隆M17/4) | eBioscience/Thermo Fisher Scientific | 11-0111-82 | |
| Western blot | 抗PRMT7抗体 | Novus Biologicals | NBP2-26135 |
| 抗单甲基化精氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 8015 | |
| 抗RAP1A/B抗体 | Abcam | ab187659 | |
| 免疫组化 | 抗Galectin 3抗体 | Santa Cruz | sc-20157 |
| 免疫荧光 | 抗PRMT7抗体 | Santa Cruz | sc-98882 |
| ELISA | LTB4参数检测试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY (581/591) | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CS暴露小鼠模型 | CS浓度500 mg/m³ TPM,暴露时间50分钟/次,每日2次,持续3天或4个月 阅读提示:Methods 'Cigarette smoke (CS) exposure' |
| 弹性蛋白酶诱导肺气肿模型 | 猪胰腺弹性蛋白酶40 U/kg,单次口咽吸入,80 μl体积 阅读提示:Methods 'Elastase application' |
| 博来霉素诱导肺纤维化模型 | 博来霉素2 U/kg,单次口咽吸入,80 μl体积 阅读提示:Methods 'Bleomycin application' |
| MH-S细胞迁移实验 | CCL2浓度100 ng/ml,迁移时间24小时 阅读提示:Methods 'MH-S cell culture'和Figure 2f图注 |
| 巨噬细胞条件培养基诱导AT2细胞铁死亡 | 极化刺激:IFNγ 20 ng/ml + LPS 1 μg/ml,处理时间24-48小时 阅读提示:Methods 'Generation of bone marrow-derived macrophages'和Figure 5l-m图注 |
| PRMT7抑制剂处理 | SGC3027浓度5 μM,处理24小时 阅读提示:Methods 'MH-S cell culture' |